Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-DLK1-35:109
Sequence Length
5181 nt
GC Content
0.4428
GCCUGGCCCAGGACCAAAUCAAAAGGUCUGAAAAAUGAUAUUCAUUGUCCUAAUGUGUAAAUUUCGACAAUUUGCAAAUUUGUAGAUUCUUUAGAAUAGAACUAACUCAAGCCCUUCAUUCUGCAGCUGAGGCUCACUGCCCCCAGUGGGCAGUGGGUCCAGGGGGUUUCUGAGGACAGGGCAUGACCCAGCCCUGCUGCCCCCAAGAUGGCACCUGGCUUGGAGGGGUGAGGGGCCCUGUUAGUCUGACUUUGAAGAAGACCAGCCUUCCAGACUCGCUUGGUGCCCUGACAGGUAUGUGUGCUCUUCUCUCUCCCACCUAACAGCCCCUUUUGGGAGACAGGGUCUGAGAGGAAGAUCAUGAUUAAUCCAGUUCUGCACAAAACACUGAGGUCCAUUAGAAGACAAUAGGUCUUGGCUGUUUCAUUCCUUUUAAGAGCUGUUUAAUAUUCCACGGUAUGUAUGCACCAUUGUUGAUUACACUCUUCUACUGUUGAAAAUCCCAGCUGAAAGUGCUCUGGGGGAGGAGAAGCUUUGGUCACAGUCCUAGCCGUCAGGGUGGGUCACAGAUUCAUAGGUGUUCAUUAAAUUAUUUUUUAAAAAAGAAUACAUAAAAAUGGUGCUUAAUGCAGAUCAGUGAGGAAGCGUGUCACAAAUCGAGGUUUUAAUUAAUACGAUUCUGCUCAACUAAUGCCCGAUAAAAAAGAUCUAAGCUGUUUCCAUUUUUUGUUGCUGUUACCAACGACACUGCAGUGAGCAUUCUUGCAGCUAAAUCUGUAAACACAUCCUCGACUGUUCCUUUACCCCAGCUUCUUAGAGAUGGGGUGGUGGGUUAAAUUGUUUGCAAAAGUUUAUUUUCAUUGAGUGAUCUUUCUAAAAUGGCAUUUUGACCUUGUUACUGUCUUGCUUUAAAGCCUCCAUCUGACUUCCUGGAGCUUCCGGGACGGGGUCCAAAAAAUAAGGCCUUAUCCUGGCAUGGAAGACCCUUUAGGGUCUGUCUUGGAACUUGCCAGCCUCAGCCCCUCCCCACUGGUGUUUACCUGCUAGGCGCACCUCACCCCCACGGGGCUACCUGUUUCUCUCAGCGGGCUCCCUACUUCUUAGGCUUUGCGCGGCCGUGCCUUUUCAGCCAGUUUCUCCCCGGCCUUAAAGAGCAGGCUUGAAAUAUCCCUGUUGGGGAGCCCAAAGUUAGAUGGGCCCCACGAAACACUGUGUUCAGAAGCCCACCGAAGCCCUGACCCUGGAAGUGGGAUGCCUCAUUGACAUUUUUUUCCCAAUUAAAGGGAAUGUUUUGCAUUUUUCUAGAAUUGAUGAAACUGGUCAACUGUUACUCACCCUCCUUCCUUUGUCCCUUUCUAGGAGCCCUGGGCUCCCCCAGUGUUGCCUGGGUCUGACUUUGCCUCAGUGAAAACUGCCUCGAAUUCUUUCUUGCACCGAUGGGCAGAUGGGCAGUGUCGGAGGAUCGUGUCAUCUGUCCCGUGGCGCUGGGUAAGUCUGCAGUGUUGUAAAGCUGCAAACACCCUUCUGGGUGGGGCUCAGGCUGGCACCCCCCCACUGCCCCAGCCUGCGCUAUACCACGUUCCCCUGAUGCUUGCCUUGUGCCGGGCCCCAGAACCCAGAGUCAUGGGGUCCACAGCGCGGGAGUAGCGUCUCAGUGUUGUGAGUUCUGGGGAUGAGGUUCGGGGUAUGAUUACAUAUUCUUGAUUGACUCAUAAAUUUCUUUUACAGUUGGCUUGGUCAAGUCAGUGUUCAAACUAUCUCCUGCUCUUUCAAGGGGAUCUGGGGCUCUAGAAGAUUAGAGGACUUGGAGAGGUUAGUGACUUGCUCGAGGUCGGCUAGGAAGCAAGACCCAGGAUUCCAACUCAGGUCUGUGUGAUUCCUCUGCAAAAUGGAGAGGUGGAAGGAUGGAUGUCAGGUCUGAUGGAUGGAUGGAUGCCUACAUCAAGAUACAUGCAUAGAUGGAGAGAUGGCUGGCUACCUCAUGAAUGCUGGGAAUGAGAGAGGAUAGUCAAUUUCCCACCAAGAUCAAAGGCUUACUUGAUCUUUGAAGAGAGGUUCCCUCUGAAUGGAGCUUGCUGGUGAAGCUCCUGCCUUCUGUUCUGCUUCUGAGCGCACUGACUGGCUCAGGUGGCUCUGGGACAACAGGUGGGAUGCCAGCUUACAGGGACCAAGUCCCAGCUGUGGUGCUGGAGCUGCUCAGUGGCAACUCUCCGUCUCUGCUGCUUUCACGCAGCACUGACGAAGAGCAGGCAUCCGCCUUUCCACUGGCUCUCCUGGAUGACUAAGCCCUAAGCCCCAACCGCAUACUCAGCCCUUCACUGGCACUUGGCAUAAUUUUAUCUCCUCUAAAUCAUCACAGCCACCCUCCAUGAUAGCAAUUUCUAUUCUCAAUUAAGUGAAAAGGAAACCGAAGUUUAGGAGUGGUAAGUGACUUACCCAAAAUCGUAUAAGGAGGAAAUGCAGACCCAGGAUUUGAACUCGAGUCUUCUUUCCUUCCAAACUCAUCCCCUCAACCUGUUUAUUUCCUUUUCUCUAUGACCAUGUCUGAAGAAAUCUGCCUUGGGGUUGUCUCAUAUUGGACUCACUCUCUUGGUCUGUCAGUGAGCUGAACUUCUCAUCCAAUCAAAUCCAAGCUUAUUUCCCAAGUAAUAUCUCUAGUGUAUUCUAUUUGUAAUGAUCACACAGGCAAGGGCCACACAUAUCACUGGCAUCCUACAGUACAAUUAAUCAAGUCAAAUUAGAUUCCUGGCAUCUCAUAUUCUGACUGAAUGCUAAUGGUAGUAGAUGUAAAAAUGACUCCAGUGCAAGGCAAGGAGGGAGGGGACUGGAUGUAGGGCUGAAUGGCGAAUCAGUAAGCCUUGCUGCAGACCUGGGUUAACAUUAGCAGAUAGGUUUUGAGAACCUGCUCAUGGGCUAGGCCCUACUUCACACAUUCUAGGUGCUAAGGUUUCAAUCUCAGCUUUGCCAUUGACUACUUUUGUGAGUUUGGACAAGGUAUUUAAUUUCUGUGCCGCGUUUUCUUCAGUUGUACCAACAGUACCUUACUAAUACCGAUAGUACCUUACUAAUGAGUACUUGAGGAUUAAAUGAGGCAAACAUAUAAAUUCCUUAAAAGAGAGCAUUCCAGGCUGGGCAUGGUGGCUUAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGUGGGAGGAUCCCUUGAGCCCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGAGAAACAUAGGGAGACCCCAAUCUCUACAAAAUAUUUAAAAAUUAUCUGGGUGUAGUGGUGCACAUCUGUGGUCCUAGUUACCUGGGAGACUGAGAUGGGAAGAUUGCUUGGGCCUGGGAGGUCAAGGCUGCAGUGAGCCAUGGUUGUGCCACUGCACUUUAGCCUGGAUGACAGAGGGAAACCCGGUCUCCAAAGAAAAAAAAAGACUGUUGUGAGAAUCAAACGAGAUAAUGUAUGCUGAGGCAUGCUGUGAACACUACGUGCUGGGUACAGGAGGACAGCCAAGCAUGUACCAAUGAUGGCAAUGUGUUCCUCACUCCCCAGCUUUAUAAAUAUAUAAUUGAUAAAUCAGUAUUGUAUGUAUUUGUAUUGUAUUUAAAUUGUACAGUGUGACAUUUUGAUAUACAUAUAUAUUGUGAAAUGAUUACCAUAAUCAAGCGAAUUAACAUACCCAUCACCUCAUGUAGUUCCGUUUUUCCAUGUGUGCAGUGAGAAUACUUAAGGUCUACUCUUUUAGCAAAUUUCAAGCAUGAAAUACAUUAUUGUUAACUAUAGUCACCGUACUCUGCAUUGGGUUACCAGAACUUACUCCUAACUGCAUCUUACUCCUAAGUUUGCAUCCUCUCACUAAGAUCUCCAGAUUCCUCUCACUCCUGACCCCUAGUAACUACCUUUCUAGUCUCUGCUUCUGUGAGGUUAUUCCAAAACAAAAGCCAGGUUCUAGGCUGUUGAGGCUGAGGGUAGGAAGUGUAUCAACAGGUAUACAGAAUAGUCACUGGUCUUGGGCUAAAUGGUGACUUCAAGUGUAGUGGCUGCAUAGUCAAAAAUGAAUUAGAUGAGUACAAAAGUGACGAAAUGAAAGAAUGUCAAGAAUGGACCACAAAGACAGUGUUUUAUGACCUAAAGAUUAAGAUUUAUCCAUUUGUGUACAAUUGUGGACUAUAUAAAAUAAAACAAGACUUUGACCUCAGUGGAUAAGAAGUAUUUGGAUGUACUAAUCAAUAUUUUUGGUCUGGGUCAGUGGUGGGUUCAUCUGUGUUUGUUGUAUUUAAAAAAAUUCUAAUAGUUGCUGUUUGUUGCACAGAAUGGACAAAUCAUAGUUUAUAUAGUCAUGCAGUAUUUAUGAGAAUGUUGACUCUUACUUGGGUAGAUAAGGUACUUAAAGAAAAUGUAAUUAAUAGUUGAUGUUGUUAAAUCUUGGCUGGAGAGUUGUUUAAGGGUGUUCAUAAAUGAGUAAAUGAAUGAAUGAACAAACACAUGAAUAAAACAAGAGAGGGCAAACAUGGGACAAAGGUGAUCAUAUCUCAUUGUCGUAAAUUCUUUUUAUGUAGCUUCAGCAUCCGUUUUCAACCUAAGUUUAACUUUCUCAUUCCAGAAGCAGGCUUAGUCACCCUUGACACAGUUUGCAGUUAUCCACCUCCUCCAAGUUCUUAAUAUGUUAGAUCCAGAUAACUGCCUUGUACAGCCACCUCCAGGAUACUGCCUCCCUAAAAAACAGCUAGAUACACUGACCCCACAGCCUAUGUGGACCACACAGAUAUAGUGGCUUGCUCUAAAUGCACCAGUGAGAACUCUCUGCAGGAAACCUGCUUGGGAAAUGCCAUAGCCUGCAAUACAGGCUUUCCCCUUCCCGCUGGCCCUUAUUUCAUUUUGUACAUGAACAUAGUUUAUUUACACGUUUGCCCAUAAAUAGAAAUCUGGGCUAUUUACUCUGACCAAGGAGCACACAAAGAGAUGAAAGAUGACGUCAGUGUUCUAUUAGUGGAGUAACAGAUUGGAUU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1586.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1682.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 1413.7
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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