Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-DLK1-35:110

Sequence Length

1399 nt

GC Content

0.5054

CAAAAGCUGAGGCUCACUGCCCCCAGUGGGCAGUGGGUCCAGGGGGUUUCUGAGGACAGGGCAUGACCCAGCCCUGCUGCCCCCAAGAUGGCACCUGGCUUGGAGGGGUGAGGGGCCCUGUUAGUCUGACUUUGAAGAAGACCAGCCUUCCAGACUCGCUUGGUGCCCUGACAGGUAUGUGUGCUCUUCUCUCUCCCACCUAACAGCCCCUUUUGGGAGACAGGGUCUGAGAGGAGUCAGGGUCGUAUAACCUUAACACAGUGUGUUAUCCAAAAACCCACUAACCCUGUUACUCUUGUCUGUCUGCUAUGUGAAACCAAGGGCGGUGUUAAAGUUUAUCACCAUGAUAUACAGAUGUGCGUGGGGACAUCUGGGAUGGGGCUCAGGGGUCUACCUGGAGGUCAGAGAGGGCAGGAUCUGCUUAGGGGAGAUGGAUGACUGUGGGGGUCAGACAGGGCAGGGUUUGCUUAGGGGAGAUGGAUGACUGUGGACAUGUGGCUGUAAAUCAUCCUCCCCGUCUUACAUAGGAUGGGGAUGCAACUUUCAAGAGUUGCCUUGAUUGGUACCUUAAAGGAAAUAAAACAUAAAAUGCUUGGCACAUAGUAGAUGCUCAACACAUGUAGAAAAGGCACUUAUUUUAGGUGGAUCUGCCGCCGAAUGGCCCUUUUGCAAGCUCUUCUCAUUUUUUGGAAUCCAAAGGGAAGGUGUGGGGAGCAGGGUCGGGGUGGAGGGGAAGGACGACGUGAGGUUGCAGAGGGCAUUUUCUUGAGGCAAUGGCAUAUCUUUCAUUGGUACUGGCUGGGUUUAUGCGGACUUUGAGAGGAGUGGAGUGUCUCCAAGUGGGGCUACCCCAGCCUGCAGGUUGGAUGCAGGUAACCUCAGUCUGGGCACUGCAUUUUUAUUUACCAUAAAAAUAUUUCAUAUUUGCUGGGUGUGGUGGCUCACGCUUAUAAUCCCAGCACUUUCGGAGGCCGAGGCCGGUGGAUCACCUGAGGCCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCGUCUCUACAAAAAUACACAAAAUUAGCUGGGCGUGGUGGUGCAUGCCUGUAGUUCCAGCUACUCAGGAGACUGAGGCAUGAGAAUUGCUCGAACCUGGAAGGCAGAAGUUGCAGUUAGCCGAGAUUGCACCAUUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGCAAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAUUGCAAAACUAUAGCAAUCACCUCAAGGUUUUCACAGGAAUCAAACUCAGUCCAAACUAAAAUGCUGUGUAAUAAAUAGUGGGGCUUCACGUGCAGGAAAGGCGAUUAAGAGCGAGGCAUGCAGGCCGAGGGCUGCUUAACCUGUCUCAGAUUUCUUCCGCACAAAGUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-494.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -522.69

Frequency: 0.0000

Diversity: 382.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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