Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-DLK1-35:127
Sequence Length
737 nt
GC Content
0.4016
AGGACAUAGGCUGCUAAUGAACAGCCCCAUCUGAUUUAAUCACUGUGCAAUGACCGUGAACUGUACAGUUACCUCCGUGUGUCACAGGAAGACUCUUUUGACUUAAGCACCCUUCCAUGGUCAUGAGGUUUCUGGUUGCCUCUGUGUGUUAGAAGCUUGGAGACCAAUGCCUUCUGCUGUGAUCGCGUUCUCCACAGUUGCCUCUGGGUAGGAGCCUGGACACUAAUAGAAAAUGGAUGCACUUGAGCCGACCUAAGCAUUCAUGGUCAUGAGAUUUGUGGUUGCCACUGUUGGUUAGGAGCAUAGAGAUCAGUAAUGGACACACCUGGGCUGGCAGAACAUCUUGCCUUGAUCUGGAGCCCCAUGUCUGCCCCUCUGUAGAGGUGCACAUGGGCCAAUGAUGGAUGCAAUGAGCUGAUCAUUUUGCUGUGAUCAAGGCUAUGUUGCCUCUGUGUUAGGCCAAUGUGAGUAAUGGUUCUUGUCUUGGUUUAGGUUGUUUAAUGGUAUUCCUGAUAUUAUUAAAAAUUAUUUAAUAUAAUAAAAAGUUAAUUGGCUUAAUGACAAUGUGCAACAUUGAGGUUAAUUAAUGAAAGAGAUGUAGUCUCUGUGGGAAAUUAUUGUAUAGACAAAUGUAAGGAUUCUUCAAAUAUCUUGUUCUUGGGUUUUCAAAAUCAUGUAUUCAUUUUAUUAUCAAAGAAGAAAUGAUUUAUUCAAUAAAUAUUUAGAAAUGAAUGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-203.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -216.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 226.2
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........(((((........))))).((((((((...))))(((((((((((((.(((((((.((((..(((...(((((((.((....((((((..((.(((((.(((...((((((((((((((((((..(((((.(((.(((((((...((((((((((...((((..((......))..)))))))))).))))...(((((((....)))))))...............)))))))..))).))))).)))).)))))))))))).))...))).))((((....))))...))))).)))).)).....)))))))))..(((((..((((.((........)).)))).)))))(((.(((((......))))).)))(((((.((((....(((((.(((((.((((((((((......))))))..))))..))))).)))))....)))).)))))......)))..))))..))))))))))).((((((((((((...)))))))))))).(((((.....))))).....((((((((((((.....((((((...))))))))))))))))))...((((((...))))))..........)))))))))..((((.(((((((..............))))))).))))...(((((((...(((..............)))...)))))))...........(((((....)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
........(((((........))))),{{{{{((({,..||{({(({{,,{{||{||||,((({{((({.,{{,,,((((((({{({{{.,,,||||.||}|,,{{|{||...{{((((((((((((((((..(((((.(((.(((((((.,.((((((((((...((((..((......))..)))))))))).)))}...(((((((....)))))))...............)))))))..))).))))).)))).)))))))))))).}}...|||{||{||||.,,|}}}},,,||}}|}}}}.}}||...}})}}}}|}|,{{||||{(({{,{{,,,,|||.,(({|.{{{({(|(((,({(((.,,,,.}}})),)})|||||,{(((,,,.(((((.(((((,((((((((((......))))))}.}))).}))))).))))),}}.)))).))))).,....)))}}).)))..))))))))}},|(((((((((((...)))))))))))}.,{(((,....,,))),,...((((((((((((.....((((({...})))))))))))))))))...((((((...)))))).,,}},..,,)))))))))..((((.(((((((..............))))))).))))...|{{{{{{...(((,(({,.......,.))},,,))))}}|,{||,........,,,.,..))))))}},
Back