Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-DLK1-35:140

Sequence Length

2155 nt

GC Content

0.4571

AAUGGAUGUCCUUGUUCUGAUUUGAGGAUGCCUCCAAGGUCACAUACUCUGUUUGCACCACGCUUAGGAAGGAGCGUGAAGACCAAGGGAAGAUGAUAAACACAGAUCAUGGAGGACUGUUUUAUCUGUUUGUGAUCUGCCGUCCUCUGUGAGCCUCAGGAUGGAUGUUUGCCAGCCGAUUCCAUGGUUACAAGCUCUAUAGCUGCAUCUAUGUGUUAGGAGCAUGAAGACCAAUAAUGGAUGCACUGAGCUGAUUAUGAAUUUAGCCCUGAUGAAGACUUGUGUUGCUGUCAUGAUAUGAAAGAUUCCAGUAAUGAACGCACUUGAGUUGAUUCAAGCACGCUUCCAUGGUCAUGAGCUCUGUGGUUGCAUCUGUGUGUUAGGAGCAUGCAGACCAAUAGUGAUAAUCUCGAGGUGAUUUAUGCAUUCUUCCAUGGCCACCAGCCUUAUGAUUGCAUCUGUGCGUCACAGCUUAGAGAUCAAUAAUGGAUGCAACAAGCUCUUUGAAUCAUUCUGUUGGGAUCAAGAUUGUUGUGUUCCCUCUGUUUGGAAAGAGACCAAGAAUGGAUACGCUCAGGUGAUUUAAGCAGUCUUCCAUGGCCACGAGCUCUGUGGUUGCCUCUGUAUAUUAAGAGCACAGAGAUUAAAAAUGGGUGCACUUGAGCCGAUUGAAACAUUCCUCCUUGCAUCUUUCUUCUGUGAUUGCAUCUAUUUGUUAGUAGCAUAGAGACCAAUAAUAGAUGGCUUGUGCUGAUGGAAGGAUUCCUCCCUGGUGACAUGCUGUGUCUGCCUCUUGAUUGGGAGCACGCAGACCUACAAUGAUGCACUUUUUAUGAUUUGAGAAUUCCUUCAUGGUCACGUGCUCUGUUUUUAUCAUGGUUGGGAGCCUGCAGAGCAAUAAGGGACAUGCCUUUGCUGAUUUGAGGAUUCCUCUGAGGUUGGGAGCUAAGUUUGCAUCAUGCUUAGAAAGGAGUGUGCAGACCUGUAAUGAUUGCACUUUGCUGAUUGAAGGAUUCCUUCAAGUCCAUGUGCUCCACUUGCACCAUUUUUAGGAUGGAGCCUGGAGACCUAUAAUGAACAACUUGUGCUGUGUUAAGGAUUCCUCCAUGAUCACGCGCCCCAUUUGUACACCAUGCUUGGGAAGGUGCAUGCAGACCAAUAAUGGACGUACUUGUGAUGAUUUAAAGAUGCCUCCAAGGUCACGUGCUCUGUUUGCACCAUGCUUAGGAAGGAGCGUACAGACCAAAAAUGGAUGAAUUGUGCACCUUGAAAAGUUCUUCCAUGGUCACCUGAGGCAUCUGCGUCAUGAUUAGGCUCCGGAUGACUAAUAAUGGACGUACUUGUUCUGAUUUGAGGACUUCUUCAUGGUCACAUGUUCUGUUUGCACCAUGCUUAGGAAGGAGCAUGUGUACCAAUAAUGGAAGCACAGAAGCUGGUUUUAAUAGUUAAGAGCUGUAUGGUCCAUCUCUGUGCUAGAAGCUGGAGACCAAUAACAGUCACUCCCUGCACUGAUUCUGCCAUGACCACUUGCUCUAUGGUUGUUUUAAGGAACCUACAGACAAAUAAUGGAUUAUCAUUGGUGAAGAUCUUAGCUGUUCCAUAGAAGGAACACACUUAUCACUACAGUGAUUCUGUAAUGAUGAAGACCUUUAUGGGUCAGUGAUGGGUAGACCAGAGCUGAUUAAAUUAUUCUCCCAUUGAUGAGGAACUUUACCUUAUCCCUCAGAGUAAGGAGAAUGUCAUAUAAUGAAAGAUACUGAUCUCUGUUCUUGGUUAAGUUCCAAGAACCAUCUAAGUUUCGUGCCCCUCAGCUGUAAAAGGGAAGUACAUUUCAUUUGUUUAUUCUGUAAAACUCUCGGUGUGUGCCAUGGCCAUGCACUGAUGAUGAGCACAUGUGUGCGGCCCCUGCCCCCGUGGAGCGCAUGCAUGGUCCUCCAGCCAGAGACCGCGCUGGGAGAAAUCAGGGGUUCACUCCUGGUCGGAGGAGCAAUCCAUCAGUCAUCCUGCCCAGAGCUUGUGAAGGUGCAGUGGCCUGAGCCAGGCUUCCAAGAGGACAACCGUGAUGGGCUCUGUGUGCGUUGCUGGGAGGACUUUUCAAUGUGAUGGCAGCCUGGGGGAAGACAGUGUCACCACGACAGUGUCACGGAACAUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-692.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -733.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 543.27

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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