Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-DLK1-35:32
Sequence Length
1351 nt
GC Content
0.5699
GCAGACGGCGGAGAGCAGAGAGGGAGCGCGCCUUGGCUCGCUGGCCUUGGCGGCGGCUCCUCAGGAGAGCUGGGGCGCCCACGAGAGGAUCCCUCACCCGGGUCUCUCCUCAGGGAUGACAUCAUCCGUCCACCUCCUUGUCUUCAAGGACCACCUCCUCUCCAUGCUGAGCUGCUGCCAAGGGGCCUGCUGCCCAUCUACACCUCACGAGGGCACUAGGAGCACGGUUUCCUGGAUCCCACCAACAUACAAAGCAGCCACUCACUGACCCCCAGGACCAGGAUGGCAAAGGAUGAAGAGGACCGGAACUGACCAGCCAGCUGUCCCUCUUACCUAAAGACUUAAACCAAUGCCCUAGUGAGGGGGCAUUGGGCAUUAAGCCCUGACCUUUGCUAUGCUCAUACUUUGACUCUAUGAGUACUUUCCUAUAAGUCUUUGCUUGUGUUCACCUGCUAGCAAACUGGAGUGUUUCCCUCCCCAAGGGGGUGUCAGUCUUUGUCGACUGACUCUGUCAUCACCCUUAUGAUGUCCUGAAUGGAAGGAUCCCUUUGGGAAAUUCUCAGGAGGGGGACCUGGGCCAAGGGCUUGGCCAGCAUCCUGCUGGCAACUCCAAGGCCCUGGGUGGGCUUCUGGAAUGAGCAUGCUACUGAAUCACCAAAGGCACGCCCGACCUCUCUGAAGAUCUUCCUAUCCUUUUCUGGGGGAAUGGGGUCGAUGAGAGCAACCUCCUAGGGUUGUUGUGAGAAUUAAAUGAGAUAAAAGAGGCCUCAGGCAGGAUCUGGCAUAGAGGAGGUGAUCAGCAAAUGUUUGUUGAAAAGGUUUGACAGGUCAGUCCCUUCCCACCCCUCUUGCUUGUCUUACUUGUCUUAUUUAUUCUCCAACAGCACUCCAGGCAGCCCUUGUCCACGGGCUCUCCUUGCAUCAGCCAAGCUUCUUGAAAGGCCUGUCUACACUUGCUGUCUUCCUUCCUCACCUCCAAUUUCCUCUUCAACCCACUGCUUCCUGACUCGCUCUACUCCGUGGAAGCACGCUCACAAAGCAGGUUCCCAGUGCCCCCGACAAGCCCCUGCUGGUGUCUCCAUCUCCUGCCAAGCAUCCUCCAGUGCCUCCUCCUGUGGGCCUGGCCUCAGGGCUAUGGACAGACUCCUGUCCCAUCCCAGAGACCCCUCGUGAUCGUGCCCUGGCACGUGGGCCGUGGCCCGGCUGGGUCGGCUGAAGAACUGCGGAUGGAAGCUGCGGAAGAGGCCCUGAUGGGGCCCACCAUCCCGGACCCAAGUCUUCUUCCUGGCGGGCCUCUCGUCUCCUUCCUGGUUUGGGCGGAAGCCAUCACCUGGAUGCCUACGUGGGAAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-529.5 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -553.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 318.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((..((((.(((.(((((((.(((....((((((((((.((((((((((((((..((((((((((((((.((((....((((...))))....))))....))))))(((((....))))).......((((((....)))))).......)))))).))..))))))))))))))(((((.((.(((((........((((((((((((((((.(((.(((((..(((......)))............((((.((.(((..((...))..)))))))))..(((...((((((..(((..(((......))))))..)))))).)))........)))))..)))))))))).((((((((((((.....(((..........))).((((((((.........))))))))......(((((((....)))))))...((((((((((...(((((((((.......(((.((((((((((((((......))))))).((.((((((((((.......((((....((((((((......(((((..(((..(((((((.....(((((..(((....(((((((...)))))))...)))..)))))((((((.((((.(((..(((.((......))..)))))).)))).)))))).)))))))..)))..)))))))))))))....))))..))))).))))).))..))))))).))).(((((.((((((.(((((((((((..(((((...((((((((...((....((((.(.(((((.((((((.(((.....))).))))).).))))).).))))....))..)))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))(((((...(((..(((((((.(((((((....).))))......))..)))))))..)))...)))))....................................(((((((..................))))))).))).....))))))).))))))))))))(((((((....)))..)))).........(((...)))....((((.((((.(....).)))))))).(((.(((....((((((....))))))...))).)))..))))))))).(((((....)))))))))).)))))))(((((((((((((......((((((.......))))))....))))..(((((......)))))...))))).))))......))))))))))...))))))))))))).))..(((....))).))..)))..))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((,(({{.(((((((.((((.(((((..(((..((.(((((((((((((((((..((((((((..((((.,.,,..({((((,.((|......))))}}))),}},,(((((....))))).}.....((((((....))))))}}.))..)))))).))..)))))))))))),,))))).)).))).............((.(((((((.(((((..{({.,||(((......}}}............((((.((.(((..({...))..)))))))))...((.(((((((((..(((..(({..,{,.|||}|,....,.,....,{{({((((..((((((((((......))))))))))((,...,||.........}}},.{(((((((.........)))))))}........})))))}|||{{.|{|.......)),}))},.(((((((((.......(((.((((((((((((((......))))))).((.((((((((((.,,..,.((((,...{(((((({.....,(((((..(((..(((((((.....(((((..(((.{{.(((((({...}))))))}}.)))..))))){(((((.((((.(((..(((.({......})..)))))).)))).)))))}.)))))))..)))..)))))))))))))..,)))},,}))))).))))).))..))))))).))).{((((.(((((,{(((((((((((..(((((...((((((((...((...,((((.({(((((.((((({.{({.....}}}.})))).}.})))).},))))..},})},)))))))})))))..)))))))))))))))))))))))))))))))(((((...(((..(((((({.,,{{{{(...,||.,,)},...,)..,)))))))..)))...))))),........,}}..}}}....))))))))).))..((((((..(((,..(((((((...))))}}))..}.)))..))))))))))).))))))).))...(((....)))))))))))).}))}}))),..,|.}||.,(((.(((((.({{.{{{(((((((((,{,((({,,,((((((....)))))).,,|,|.(((....)))..}..{({((,,..)}}}}.)))))),)))))||||}}|||.||.,.....,.}}|))}...,)))}}))}.)}))).}}}..(((((((.(((....((((....))))......))).)))))))})))))((((((({,,.{(((({...,||,....,))).}))))},.})))))))
Back