Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-DLK1-35:43

Sequence Length

1742 nt

GC Content

0.5821

GCAGACGGCGGAGAGCAGAGAGGGAGCGCGCCUUGGCUCGCUGGCCUUGGCGGCGGCUCCUCAGGAGAGCUGGGGCGCCCACGAGAGGAUCCCUCACCCGGGUCUCUCCUCAGGGAUGACAUCAUCCGUCCACCUCCUUGUCUUCAAGGACCACCUCCUCUCCAUGCUGAGCUGCUGCCAAGGGGCCUGCUGCCCAUCUACACCUCACGAGGGCACUAGGAGCACGGUUUCCUGGAUCCCACCAACAUACAAAGCAGCCACUCACUGACCCCCAGGACCAGGAUGGCAAAGGAUGAAGAGGACCGGAACUGACCAGCCAGCUGUCCCUCUUACCUAAAGACUUAAACCAAUGCCCUAGUGAGGGGGCAUUGGGCAUUAAGCCCUGACCUUUGCUAUGCUCAUACUUUGACUCUAUGAGUACUUUCCUAUAAGUCUUUGCUUGUGUUCACCUGCUAGCAAACUGGAGUGUUUCCCUCCCCAAGGGGGUGUCAGUCUUUGUCGACUGACUCUGUCAUCACCCUUAUGAUGUCCUGAAUGGAAGGAUCCCUUUGGGAAAUUCUCAGGAGGGGGACCUGGGCCAAGGGCUUGGCCAGCAUCCUGCUGGCAACUCCAAGGCCCUGGGUGGGCUUCUGGAAUGAGCAUGCUACUGAAUCACCAAAGGCACGCCCGACCUCUCUGAAGAUCUUCCUAUCCUUUUCUGGGGGAAUGGGGUCGAUGAGAGCAACCUCCUAGGGUUGUUGUGAGAAUUAAAUGAGAUAAAAGAGGCCUCAGGCAGGAUCUGGCAUAGAGGAGGUGAUCAGCAAAUGUUUGUUGAAAAGGUUUGACAGGUCAGUCCCUUCCCACCCCUCUUGCUUGUCUUACUUGUCUUAUUUAUUCUCCAACAGCACUCCAGGCAGCCCUUGUCCACGGGCUCUCCUUGCAUCAGCCAAGCUUCUUGAAAGGCCUGUCUACACUUGCUGUCUUCCUUCCUCACCUCCAAUUUCCUCUUCAACCCACUGCUUCCUGACUCGCUCUACUCCGUGGAAGCACGCUCACAAAGGUUCCCAGUGCCCCCGACAAGCCCCUGCUGGUGUCUCCAUCUCCUGCCAAGCAUCCUCCAGUGCCUCCUCCUGUGGGCCUGGCCUCAGGGCUAUGGACAGACUCCUGUCCCAUCCCAGAGACCCCUCGUGAUCGUGCCCUGUAGUCACCCCACUCCACCGAAAAGUAAACUGCAGGCACGUGGGCCGUGGCCCGGCUGGGUCGGCUGAAGAACUGCGGAUGGAAGCUGCGGAAGAGGCCCUGAUGGGGCCCACCAUCCCGGACCCAAGUCUUCUUCCUGGCGGGCCUCUCGUCUCCUUCCUGGUUUGGGCGGAAGCCAUCACCUGGAUGCCUACGUGGGAAGGGACCUCGAAUGUGGGACCCCAGCCCCUCUCCAGCUCGAAAUCCCUCCACAGCCACGGGGACACCCUGCACCUAUUCCCACGGGACAGGCUGGACCCAGAGACUCUGGACCCGGGGCCUCCCCUUGAGUAGAGACCCGCCCUCUGACUGAUGGACGCCGCUGACCUGGGGUCAGACCCGUGGGCUGGACCCCUGCCCACCCCGCAGGAACCCUGAGGCCUAGGGGAGCUGUUGAGCCUUCAGUGUCUGCAUGUGGGAAGUGGGCUCCUUCACCUACCUCACAGGGCUGUUGUGAGGGGCGCUGUGAUGCGGUUCCAAAGCACAGGGCUUGGCGCACCCCACUGUGCUCUCAAUAAAUGUGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-700.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -729.14

Frequency: 0.0000

Diversity: 475.26

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.......(((((((.((.(((.(.(((((..((((((((((((.(.((((((.(((((((((((((((((((..((((((.((((.(((((..(((((((((((((.((((((((....))))).......((((((....))))))(((((.(.(((.((.(((((.((...(((...(((((.((.(((((........((((((((((((((((.(((.(((((..(((......)))............((((.((.(((..((...))..)))))))))..(((...((((((..(((..(((......))))))..)))))).)))........)))))..)))))))))).((((((((((((...........((((((((....(((((((.........)))))))((((......)))).((((((.((........)).))))))(((((((((.......(((.((((((((((((((......))))))).((.((((((((((.......((((....((((((((......(((((..(((..(((((((.....(((((..(((....(((((((...)))))))...)))..)))))((((((.((((.(((..(((.((......))..)))))).)))).)))))).)))))))..)))..)))))))))))))....))))..))))).))))).))..))))))).))).(((((.((((((.(((((((((((..(((((...((((((((...((....((((.(.(((((.((((((.(((.....))).))))).).))))).).))))....))..)))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))(((((...(((..(((((((.(((((((....).))))......))..)))))))..)))...)))))....................................(((((((..................)))))))......))))))))))))))))))))(((((((....)))..)))).........(((...)))....((((.((((.(....).)))))))).(((.(((....((((((....))))))...))).)))..))))))))).((((((.((((((........((....)).......))))))))))))))))).)))))))))).)).))))))).)))...).)).)))...))).)).))))))))....(((((((.(((....((((....))))......))).))))))).(((.....(((.(((...(((....)))...))).))).....))).))).)))))))))...)))))).)))))))...))))).((((((..(((((.....(((.(((((....(((((.(((.((((...)))).)))((((..(((((...)))))..))))(((.(((...(.(((((((.......)))).))).).))).))).((((((...))))))....((((((.((...)).))))))...)))))..))))).)))...)))))....))))))(..((((.(.....((((((..(((((........)))))))))))).))))..)))))))))))))).)...))))....)))...))))).))))).)))).)).)))))))......)))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.......(((((((.((.(((.(.(((((.,((((.(({(((((((((((((((((..((((((((..((((.,,,,..({((((,.(({......))))}}))),}},,(((((....))))).}.....((((((....))))))}}.))..)))))).))..))))))))))))}})|||},||{{(((.{{..........||}|||,(((((((....,,}}))}||...,..,..........,}|}|}}|.{{.(((.....}})||.(((((.((((..((.(((((((((..(((..(((.,,(,.|{|||,,...,,,...,,|{{{{{{{..{{((((((((......))))))))||({,....|,...,..,,,||,..{(((((((.........)))))))}........}))))}}||(({.{{|.......)).}))}}.{((((((((.......(((.((((((((((((((......))))))).((.((((((((((.,,..,.((((,...{(((((({.....,(((((..(((..(((((((.....(((((..(((.{{.(((((({...}))))))}}.)))..))))){(((((.((((.(((..(((.({......})..)))))).)))).)))))}.)))))))..)))..)))))))))))))..,)))},,}))))).))))).))..))))))).))).{((((.(((((,{(((((((((((..(((((...((((((((...((...,((((.({(((((.((((({.{({.....}}}.})))).}.})))).},))))..},})},)))))))})))))..))))))))))))))))))))))))))))))|(((((...(((..(((((({.,,{{{{(...,||.,,)},...,)..,)))))))..)))...))))),........,,,..}}}....))))))))).,)...}))}}))))....({{{{.....,|||||}|.{{{{{{|,..||,,,}}|(((((((|{(({{((((.,{{{(({{...,,....,,,|},.,||}{(({(.((.(((((.(((((((((.((((((((((({,...((((((....)))))|{(((.(((((....,,,..,..(((((({((((((........,,....},...,,..)))))))))))).((((....))))(((.(((((|(({.{,{..{{({(({,,,.,{|||}||..({((({{,{,,(((((((,({{....(({(,,..||}}......})).)))))}}.,{{{,{{.(((.(({..,(((....)))...})).))}.||||,|{||||||||||..{{{{.,|}|||.,,,,,,,},}})},)),,)}}}..)))))},.}}||}.{((({...)))||..,{,.,|||,,,}}|,.}))|{((..(((({...)))))..))))})))))|,},|.|||||,|}}}}}}}))))).,,})}))..,},,|,,.)))))))))))....((((((.((...)).))))))))))))))).....))))))).))))}|||,..,})},.,}}}},.,,}}.||||{{..|||||........))}}})))}))))))),)))},.)))))))))})}.)))}},})}..}}.,))))),.))))).)))).)).)))))))......},)..