Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-DLK1-35:45

Sequence Length

1598 nt

GC Content

0.5707

GCAGACGGCGGAGAGCAGAGAGGGAGCGCGCCUUGGCUCGCUGGCCUUGGCGGCGGCUCCUCAGGAGAGCUGGGGCGCCCACGAGAGGAUCCCUCACCCGGGUCUCUCCUCAGGGAUGACAUCAUCCGUCCACCUCCUUGUCUUCAAGGACCACCUCCUCUCCAUGCUGAGCUGCUGCCAAGGGGCCUGCUGCCCAUCUACACCUCACGAGGGCACUAGGAGCACGGUUUCCUGGAUCCCACCAACAUACAAAGCAGCCACUCACUGACCCCCAGGACCAGGAUGGCAAAGGAUGAAGAGGACCGGAACUGACCAGCCAGCUGUCCCUCUUACCUAAAGACUUAAACCAAUGCCCUAGUGAGGGGGCAUUGGGCAUUAAGCCCUGACCUUUGCUAUGCUCAUACUUUGACUCUAUGAGUACUUUCCUAUAAGUCUUUGCUUGUGUUCACCUGCUAGCAAACUGGAGUGUUUCCCUCCCCAAGGGGGUGUCAGUCUUUGUCGACUGACUCUGUCAUCACCCUUAUGAUGUCCUGAAUGGAAGGAUCCCUUUGGGAAAUUCUCAGGAGGGGGACCUGGGCCAAGGGCUUGGCCAGCAUCCUGCUGGCAACUCCAAGGCCCUGGGUGGGCUUCUGGAAUGAGCAUGCUACUGAAUCACCAAAGGCACGCCCGACCUCUCUGAAGAUCUUCCUAUCCUUUUCUGGGGGAAUGGGGUCGAUGAGAGCAACCUCCUAGGGUUGUUGUGAGAAUUAAAUGAGAUAAAAGAGGCCUCAGGCAGGAUCUGGCAUAGAGGAGGUGAUCAGCAAAUGUUUGUUGAAAAGGUUUGACAGGUCAGUCCCUUCCCACCCCUCUUGCUUGUCUUACUUGUCUUAUUUAUUCUCCAACAGCACUCCAGGCAGCCCUUGUCCACGGGCUCUCCUUGCAUCAGGGCUAAUCUCGGGCCUUGUCGAAGGAAGAGGCUGCAGACGUUAAUGAGGUUAGCUGCUGGAUUCCAGUAUUCGUCGCAUAAGGAUCCUUCUUUGUCUGCGAAGGAAAAACACACUGAUUAUCAUAAUGAGGCACGUGGGCCGUGGCCCGGCUGGGUCGGCUGAAGAACUGCGGAUGGAAGCUGCGGAAGAGGCCCUGAUGGGGCCCACCAUCCCGGACCCAAGUCUUCUUCCUGGCGGGCCUCUCGUCUCCUUCCUGGUUUGGGCGGAAGCCAUCACCUGGAUGCCUACGUGGGAAGGGACCUCGAAUGUGGGACCCCAGCCCCUCUCCAGCUCGAAAUCCCUCCACAGCCACGGGGACACCCUGCACCUAUUCCCACGGGACAGGCUGGACCCAGAGACUCUGGACCCGGGGCCUCCCCUUGAGUAGAGACCCGCCCUCUGACUGAUGGACGCCGCUGACCUGGGGUCAGACCCGUGGGCUGGACCCCUGCCCACCCCGCAGGAACCCUGAGGCCUAGGGGAGCUGUUGAGCCUUCAGUGUCUGCAUGUGGGAAGUGGGCUCCUUCACCUACCUCACAGGGCUGUUGUGAGGGGCGCUGUGAUGCGGUUCCAAAGCACAGGGCUUGGCGCACCCCACUGUGCUCUCAAUAAAUGUGUUUCCUGUCUUAACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-658.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -685.1

Frequency: 0.0000

Diversity: 476.83

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((((..(((((((.((.(((.(.(((((..(((..((.(((((((((((((((((..((((((((((((((.((((....((((...))))....))))....))))))(((((....))))).......((((((....)))))).......)))))).))..))))))))))))..))))).)).))).........((((((.((((((((((.....((((((((((......)))..........(((.......)))...(((((.((((((((((((((((...((((((..(((..(((......))))))..)))))).........(((((.((((((((((......))))))))))...)))))......))))))))))(((((((.........)))))))((((......)))).((((((.((........)).))))))(((((((((.......(((.((((((((((((((......))))))).((.((((((((((.......((((....((((((((......(((((..(((..(((((((.....(((((..(((....(((((((...)))))))...)))..)))))((((((.((((.(((..(((.((......))..)))))).)))).)))))).)))))))..)))..)))))))))))))....))))..))))).))))).))..))))))).))).(((((.((((((.(((((((((((..(((((...((((((((...((....((((.(.(((((.((((((.(((.....))).))))).).))))).).))))....))..)))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))).(((((...((((((((.(((....((.((((((((((((((((((((((.((....)).))))))...........)))))))))))(((((...))))).(((.(((((((((((....))))))..))))).)))........)))))...))....))).).)))))))...(((((....)))))))))).....((((((.......))))))..(((((...((.(((((((.(((....((((....))))......))).))))))))))))))...))))))))))).)))))))....))))).))))).))))))..(((..(((......)))..))).(((((((..((((((...(((((....((((..(((((...)))))..(((.((((...)))).)))((((..(((((...)))))..))))(((.(((...(.(((((((.......)))).))).).))).)))))))....)))))((((((.(.(((((.(((..((.(((...((.((((...)))).))....))).))..))).))))).).).)))))..((((((..(((((........)))))))))))))))))....)))))))(((.((.(((.........))))).)))..))))).)))).)).)))))))..............))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

..((((((.,(((((((.((.(((.(.(((((..(((,.{{.(((((((((((((((((..((((((((..((((.,,,,..({((((,.((|......))))}}))),}},,(((((....))))).}.....((((((....))))))}}.))..)))))).))..))))))))))))|||||||,||,}||{,,.....{(((((({{(((,(({{({(...((({||||((,.{{{{|.....,,,,..((((.{,{{..{{{{{{(((((({((((((,(({,,{(({,{((((((.{(((.,(((.{{{{.||||||..||||||.......,.{{{{..((((((((((......)))))))))),,..,,||||,,,,,,,,|||,,|(((((((.........)))))))|,{{......)))}.{{((((.(({......,)).))))),(((((((((.......(((.((((((((((((((......))))))).((.((((((((((.,,..,.((((,...{(((((({.....,(((((..(((..(((((((.....(((((..(((.{{.(((((({...}))))))}}.)))..))))){(((((.((((.(((..(((.({......})..)))))).)))).)))))}.)))))))..)))..)))))))))))))..,)))},,,))))).))))).))..))))))).))).{((((.(((((,{(((((((((((..(((((...((((((((...((...,((((.({(((((.((((({.{({.....}}}.})))).}.})))).},))))..},})},)))))))})))))..))))))))))))))))))))))))))))))),,{(({{..{{{..{||}||{{{{{{,|,,|||||||..,,,..||||||},{.,,})).)))}))}.,}}.,.....)))),))))}|||||...})))).{((.(((((((((((....)))))),.})))).})),.......{{,{{{,.,.,}}},)),,.,,|(((({.{,|(((((({,,({{,((,,.....,,|},|}}...}}))).))..|.|||||,{{,((||||,.|||}}}}||,|},..}))},,.,,,}}}|))}))}))))}}}}}.|||}|}|,|,||{||,,}}},,,,}}})),,}|}}.||||||,{((({..((({.,{.||{..,.....}}|||,,}},,}}}}..)))}},,...{{{.{((({...}|||||.{({.,{{|.,.))}}.))){{((..(((((...)))))..))}}(({.|||,,.{.{{(((((.......)))),,)).).))}.}))}||||||}}})))))).,,.{(((((,((...||,||}}}}.,,}||||..,))}}.))},,,}))},|||},,.)))}},}}))).}))}.})))}}..))))),)))...,}}..{|||{{||.}}}.)))))))){({,(((({.,|,,....}...,))))),))).))))).)))).)).))))))).............,))))))......