Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-DLK1-35:46

Sequence Length

1726 nt

GC Content

0.5805

GCAGACGGCGGAGAGCAGAGAGGGAGCGCGCCUUGGCUCGCUGGCCUUGGCGGCGGCUCCUCAGGAGAGCUGGGGCGCCCACGAGAGGAUCCCUCACCCGGGUCUCUCCUCAGGGAUGACAUCAUCCGUCCACCUCCUUGUCUUCAAGGACCACCUCCUCUCCAUGCUGAGCUGCUGCCAAGGGGCCUGCUGCCCAUCUACACCUCACGAGGGCACUAGGAGCACGGUUUCCUGGAUCCCACCAACAUACAAAGCAGCCACUCACUGACCCCCAGGACCAGGAUGGCAAAGGAUGAAGAGGACCGGAACUGACCAGCCAGCUGUCCCUCUUACCUAAAGACUUAAACCAAUGCCCUAGUGAGGGGGCAUUGGGCAUUAAGCCCUGACCUUUGCUAUGCUCAUACUUUGACUCUAUGAGUACUUUCCUAUAAGUCUUUGCUUGUGUUCACCUGCUAGCAAACUGGAGUGUUUCCCUCCCCAAGGGGGUGUCAGUCUUUGUCGACUGACUCUGUCAUCACCCUUAUGAUGUCCUGAAUGGAAGGAUCCCUUUGGGAAAUUCUCAGGAGGGGGACCUGGGCCAAGGGCUUGGCCAGCAUCCUGCUGGCAACUCCAAGGCCCUGGGUGGGCUUCUGGAAUGAGCAUGCUACUGAAUCACCAAAGGCACGCCCGACCUCUCUGAAGAUCUUCCUAUCCUUUUCUGGGGGAAUGGGGUCGAUGAGAGCAACCUCCUAGGGUUGUUGUGAGAAUUAAAUGAGAUAAAAGAGGCCUCAGGCAGGAUCUGGCAUAGAGGAGGUGAUCAGCAAAUGUUUGUUGAAAAGGUUUGACAGGUCAGUCCCUUCCCACCCCUCUUGCUUGUCUUACUUGUCUUAUUUAUUCUCCAACAGCACUCCAGGCAGCCCUUGUCCACGGGCUCUCCUUGCAUCAGCCAAGCUUCUUGAAAGGCCUGUCUACACUUGCUGUCUUCCUUCCUCACCUCCAAUUUCCUCUUCAACCCACUGCUUCCUGACUCGCUCUACUCCGUGGAAGCACGCUCACAAAGGUUCCCAGUGCCCCCGACAAGCCCCUGCUGGUGUCUCCAUCUCCUGCCAAGCAUCCUCCAGUGCCUCCUCCUGUGGGCCUGGCCUCAGGGCUAUGGACAGACUCCUGUCCCAUCCCAGAGACCCCUCGUGAUCGUGCCCUGGCACGUGGGCCGUGGCCCGGCUGGGUCGGCUGAAGAACUGCGGAUGGAAGCUGCGGAAGAGGCCCUGAUGGGGCCCACCAUCCCGGACCCAAGUCUUCUUCCUGGCGGGCCUCUCGUCUCCUUCCUGGUUUGGGCGGAAGCCAUCACCUGGAUGCCUACGUGGGAAGGGACCUCGAAUGUGGGACCCCAGCCCCUCUCCAGCUCGAAAUCCCUCCACAGCCACGGGGACACCCUGCACCUAUUCCCACGGGACAGGCUGGACCCAGAGACUCUGGACCCGGGGCCUCCCCUUGAGUAGAGACCCGCCCUCUGACUGAUGGACGCCGCUGACCUGGGGUCAGACCCGUGGGCUGGACCCCUGCCCACCCCGCAGGAACCCUGAGGCCUAGGGGAGCUGUUGAGCCUUCAGUGUCUGCAUGUGGGAAGUGGGCUCCUUCACCUACCUCACAGGGCUGUUGUGAGGGGCGCUGUGAUGCGGUUCCAAAGCACAGGGCUUGGCGCACCCCACUGUGCUCUCAAUAAAUGUGUUUCCUGUCUUAACAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-693.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -721.34

Frequency: 0.0000

Diversity: 492.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((((..(((((((.((.(((.(.(((((..((((((((((((.(.((((((.(((((((((((((((((((..((((((.((((.(((((..(((((((((((((.((((((((....))))).......((((((....))))))(((((.(.(((.((.(((((.((...(((...(((((.((.(((((........((((((((((((((((.(((.(((((..(((......)))............((((.((.(((..((...))..)))))))))..(((...((((((..(((..(((......))))))..)))))).)))........)))))..)))))))))).((((((((((((...........((((((((....(((((((.........)))))))((((......)))).((((((.((........)).))))))(((((((((.......(((.((((((((((((((......))))))).((.((((((((((.......((((....((((((((......(((((..(((..(((((((.....(((((..(((....(((((((...)))))))...)))..)))))((((((.((((.(((..(((.((......))..)))))).)))).)))))).)))))))..)))..)))))))))))))....))))..))))).))))).))..))))))).))).(((((.((((((.(((((((((((..(((((...((((((((...((....((((.(.(((((.((((((.(((.....))).))))).).))))).).))))....))..)))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))(((((...(((..(((((((.(((((((....).))))......))..)))))))..)))...)))))....................................(((((((..................)))))))......))))))))))))))))))))(((((((....)))..)))).........(((...)))....((((.((((.(....).)))))))).(((.(((....((((((....))))))...))).)))..))))))))).(((((....)))))))))).)))))))))).)).))))))).)))...).)).)))...))).)).))))))))....(((((((.(((....((((....))))......))).))))))).(((.....(((.(((...(((....)))...))).))).....))).))).)))))))))...)))))).)))))))...))))).((((((..(((((.....(((.(((((....(((((.(((.((((...)))).)))((((..(((((...)))))..))))(((.(((...(.(((((((.......)))).))).).))).))).((((((...))))))....((((((.((...)).))))))...)))))..))))).)))...)))))....))))))(..((((.(.....((((((..(((((........)))))))))))).))))..)))))))))))))).)...))))....)))...))))).))))).)))).)).)))))))..............)))))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

..((((((.,(((((((.((.(((.(.(((((.,((((.(({(((((((((((((((((..((((((((..((((.,,,,..({((((,.(({......))))}}))),}},,(((((....))))).}.....((((((....))))))}}.))..)))))).))..))))))))))))}})||||,||{{(((.{,.......,,,||}|||,(((((((...,,,}}}}}||..,,,.,..........,||||}||.{{.(((..,..}})||.{((((.((((..((.(((((((((..(((..{({.,,(,.|{|||,,..,,,,...,,|{{{{{{{..{{((((((({......))))))))||({,....|,...,,,,,,||,..{(((((((.........)))))))}........}))))}|||(({.{{|.......)).}))}}.{((((((((.......(((.((((((((((((((......))))))).((.((((((((((.,,..,.((((,...{(((((({.....,(((((..(((..(((((((.....(((((..(((.{{.(((((({...}))))))}}.)))..))))){(((((.((((.(((..(((.({......})..)))))).)))).)))))}.)))))))..)))..)))))))))))))..,)))},,}))))).))))).))..))))))).))).{((((.(((((,{(((((((((((..(((((...((((((((...((...,((((.({(((((.((((({.{({.....}}}.})))).}.})))).},))))..},})},)))))))})))))..))))))))))))))))))))))))))))))|(((((...(((..(((((({.,,{{{{(...,||.,,)},...,)..,)))))))..)))...))))),........,,,..}}}....})))))))}.,}...}})||}}}}....{{{{{.....,|||||}|.{{{{{{||,,||,,,}}|({|{({{||(({{(({{.,{||((|{..,,,...,,,}||,.,||}{(({(.((.(((((.((({(((((,((((((((((({,...((((((....)))))|{{{{.(((((....,,,,,,..(((((....))))).{(((,...))}){{{.||{{||(({,,,{..{{({((|,,,.,{|||}||..({((({{,{,,(((((((,({{....(({(,,..||}}......})).)))))}}.,{{{,{{.(((.(({..,(((....)))...})).))}.||||,|{||||||||||..{{{{.,|}|||.,,,,,,,},}})},))},)}}}..)))))},.},||}.{((({...}}}||..,{,.,|||,,,}}|,.}))|{((..(((({...)))))..))))|||}}}|,},|.|||{{{|,}}}}}}))))).,,})})),.}}},|,|.})}}}))))))....((((((.((...)).))))))})))))))}.....))))))).))))}|||,..,})},.,}}}},.}}}}.|||||{..|||||.,,,....))}}})))}})))))),)))),,)))))})})}}}.)))}},})}..}}.,))))),.))))).)))).)).))))))).............,)))))).........