Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-DLK1-35:61
Sequence Length
4489 nt
GC Content
0.4901
CAGAGAGGGAGCGCGCCUUGGCUCGCUGGCCUUGGCGGCGGCUCCUCAGGAGAGCUGGGGCGCCCACGAGAGGAUCCCUCACCCGGGUCUCUCCUCAGGGAUGACAUCAUCCGUCCACCUCCUUGUCUUCAAGGACCACCUCCUCUCCAUGCUGAGCUGCUGCCAAGGGGCCUGCUGCCCAUCUACACCUCACGAGGGCACUAGGAGCACGGUUUCCUGGAUCCCACCAACAUACAAAGCAGCCACUCACUGACCCCCAGGACCAGGAUGGCAAAGGAUGAAGAGGACCGGAACUGACCAGCCAGCUGUCCCUCUUACCUAAAGACUUAAACCAAUGCCCUAGUGAGGGGGCAUUGGGCAUUAAGCCCUGACCUUUGCUAUGCUCAUACUUUGACUCUAUGAGUACUUUCCUAUAAGUCUUUGCUUGUGUUCACCUGCUAGCAAACUGGAGUGUUUCCCUCCCCAAGGGGGUGUCAGUCUUUGUCGACUGACUCUGUCAUCACCCUUAUGAUGUCCUGAAUGGAAGGAUCCCUUUGGGAAAUUCUCAGGAGGGGGACCUGGGCCAAGGGCUUGGCCAGCAUCCUGCUGGCAACUCCAAGGCCCUGGGUGGGCUUCUGGAAUGAGCAUGCUACUGAAUCACCAAAGGCACGCCCGACCUCUCUGAAGAUCUUCCUAUCCUUUUCUGGGGGAAUGGGGUCGAUGAGAGCAACCUCCUAGGGUUGUUGUGAGAAUUAAAUGAGAUAAAAGAGGCCUCAGGCAGGAUCUGGCAUAGAGGAGGUGAUCAGCAAAUGUUUGUUGAAAAGGUUUGACAGGUCAGUCCCUUCCCACCCCUCUUGCUUGUCUUACUUGUCUUAUUUAUUCUCCAACAGCACUCCAGGCAGCCCUUGUCCACGGGCUCUCCUUGCAUCAGGUAGGGGCUUUGCAGAGACCAUCGACGGGCUGACUUGAGUAAGAACACGAAUUAUGCAUGUGGCCAUUUCCAGAGCACUUUCUAUGUGAUAUGAACAUGUGAUUUUUAUGUAAUAUGUGUAUGUAAACGAGGCAGCCUCAUUUCCAGGUGAGGAUGCAUUUGGUAGUGUUGAUUUUUGUAAUUUAAAGAAGCUGAAAGGGAGAGAGGACCCGUGAGGACUGAACUCUCUGUCCCAUGGGGUAGGGCUUACAUUUACAUUAAAGAAACAGAAACUUGCUGGGAGGUGUAAGUAUUUGGUCACAUUGCUGGCAACAGAAGGGGUUGGAGUUGGACCCAGGGUGCCACGCUAGCUGCCCUCACCCCUUCUUCCCCUCUGGCCCAGAGUUAUACUAAGAGUCCUUUUAUUUCAAACCAAAUGUUUGACAAUGGGACAGUCUGUUUGAAAUCCCAGCUGCCUGGGGUGGUCUUGGGGGUCUGGGUGGCCCCAGUGCUGGUACCAUGUGCUGGCUUCACCUUUUAAUAACAGUGUGACCUUAAACAAGUCGCUUAACUACUCUAAGUUUCAGUUUCUUUCAUGGUCUAAAUGGAGAUUAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCCCCUCGUGUAUCUACCCCACAGGGCGCUUUUGAAGACCAAAUGCUGUAACUACUAUGAAAGUGCUUUGUAAAUUGCUGUGGAAAGUGUGAGCUACUCAAGCACCCGAGGCUGUCCCUCCUUGCUCACAUGUCCAGCCCAAUUCUCCCUUAGUGAGAACAGCACUCAGUAGGUGCUGUGUGUGUUUGUGUUCAAUUAAGAAAUUCCAGAAUAAAUAAAAAUGAAUUAAUUCAACAAACAUUUUCUGGGGCACCGACAAUCUGCCCAGUGCACCAGGCUAGGUAUCUGAUACAAAGAUAAUGAAAACAGUCUCUUGGAACCUAAUUGGGGUCCUCAUUUGACCAGGAAUUUCUUUCGUCCCGUUUUAAGCCAACCAGUUUUGUCCGGACAAGACAAAAACAACUUGGGCUGCUUUAGAGAAGCCCAGCUCAGUGUAGACAAUAGCUGCCCAGCCUCUGAAAGGGGCUGAUUGGAUUAUGUGGCAAAUGGAGGUGCAAGGAUGACUUGGACGGUGACAAAUGAAGUGGGCGGAGACCUGCUUUGAGUUAAUCCAGGCUAUUAGGAGGGGACCUUUUGUCUUCCAGAGACUGGCAGGAGCUUUUACCAGUGGUUUUUACAUCCUUAAUGUUCAGGACGAAUAAUUUAUGGUCAGUGAAAAUCCAGGCCCCAGUGAGAUUCGAGUGGGCUGUAAAAUCGAGAGUCCUGCUCCCAGUGAGUAAUGGUAGUGAAUGUUUCUGUCACUUUUUGCAACCGUCCAUUCAUUUGAUCCUCACAACUCCCUGUCCUGAGCCAGGACCGGCCACUGCCACUCCCAGGGAAACAGAGGCUGUCAAGAGGCUCCACAGAUUGGGCCCCACUGGAUCAUUGAACCCCUGUUCCCUGAGUUCUAGAGGAAGAAUUGUACCUGUCUCAGUCCCGGCCACCUCCAGAAGGCCUCCCUCUGCAUUUCUGACUUUGCUGUGCCGGCAGCCUGGAGCCUCCCAGGUCCCUGCUGUCAUCUUUUCUAGCCACUACAGUCUCUGUCUUUCCUUUCACAGCCAAGCUUCUUGAAAGGCCUGUCUACACUUGCUGUCUUCCUUCCUCACCUCCAAUUUCCUCUUCAACCCACUGCUUCCUGACUCGCUCUACUCCGUGGAAGCACGCUCACAAAGGUAAAGACUUUUCUGUGGCUUAAUCCUUGUCAUGUUUUCGGCUCAUGGACACAAGGACACAUUUUCAUGCCUUCUCUCACAGGGCUCUGCGUCUCCGGUUCACUUCUGUGUCUUUACACUCCCUUCACAGAGACACUUGCUCCCCCUUCUCUCGUUCUUAGCAUCCCCUAGGAACUUGCACACCCAGGUCUCUCGACUUCUGGACCUGCUUCUUACCAUGCCGUCUUAAGCAGUCAGGAGUCGCUGCCUGGGUUCGAGUCCUAGUUAAAUUACUUAGUGCUGAGACCUUGGGGUAGGUAAACUUUUCCAAGCCAGGUUUAUCUCAGUUUCAAAAUAGGGUUAAUCGUCUUUAUCUGGCAGGUCAGGUGGGAUGUCUCACAGGUAAGCACCAGAUGCCAUUUGAAAGGCUUGAAGCAAAGUCAAUAAAGCAUUCAUGGGAAAAUACAACUGGAGGCACCACUAGAUUUUCGUAUACAUUAGGUUCCCACGGGGAGGACCGAAGAGAGAAGAAAGAAGUGGAAAGGGAGGAGCGUGCAGGAGAGACAGGAGAAGAGAAUAACUAAACAAAGACAUUAAAGACAAAAAAAAAGUAGGAAAGGGAGACUUAGAAAAUAUUAAAAGCCACCAAAAACACAUCCAAAGACGGUUUCCCCUUACGUUAGUUGGGCUAAAAGAAAGCAAAUGGGAAGAAGGUUUUAAAUUGAUUAUCCCAGUGACAAAUCCCAGGAAGCUUUCACAUCAAAUCACCCUAUUCUGGGUUUUUAACUCCUUCCAUCGAGUUUAACCUCUUUACCUCCCACAUCCUGGUAAACCCUGCCCCCUCCCUACCGCCCCCUUUGCUGGUGAUUAAAUCCUGAAGGUACACGAAGUAUUUCAGUGAAUGAAUGGCUAACAGAAAAGGGCCUCCCCUCCCCCUUACCCUGGCGGUGUUUUUCAGUUUUAUUCCACUUUCCGCCCUUUUCCCUUAAUGAACACAGGGCUAAUCUCGGGCCUUGUCGAAGGAAGAGGCUGCAGACGUUAAUGAGGUUAGCUGCUGGAUUCCAGUAUUCGUCGCAUAAGGAUCCUUCUUUGUCUGCGAAGGAAAAACACACUGAUUAUCAUAAUGAGGUGAACUGGCCACCGCCGGGCCGGGGCGAUGUGGCUUCUUAAGCCACACUUCUAAUUUUGGUGAUGGAGCCGACAUUUCUUUGGCUUCUCAUUUAAGUCUUUGCCUCUGUCCCAGUGCGAAGUCCAUUCAGCGGGGUUGAAAGUUGCAGGCAGCUUUGGGAAGGGGGGCGUCGGACAGGGUUGCAUUGUAGAAAGUGGCUUUGUUCGAUCCUUCGCACAGAUGCAAAUGGCCAGAGCAUUCAUUCCCUUUCUUCAAGAGCUGAGGACUGGGGGGGCCACUGGUGAUCAGUUCCCAACUCUAGCUCUCCUCUGACUCAUCUCAGGACCCAUUGAGGACAUCCAAAACUCACUCAAGAUCACCAAGUGGUAGGAAAGUACUAACUCCUGGGCAUAGCCCUAGGGGAGUGACUACAAUGUGAAUACUCAUGGAAUGCCUAGCCAGGUGAAGAAGUGAAUGCAUGUUGGCAUCCCAGAGGGACCCCCCUUAAGAGGGCAUAGUUUGGGGUUCAGAUUUGACUCCAGCAUACUGUUGAAAUUGGGCACAGGGGGCUAGUGAUUAGUCAGGAUCAAUCAGUGGAGAGGAGAUUAAAACUCACAUCUGGGAGUCCGGAAUCAGAACUUGUAGUUCUUUUUUUUGAAAUGGAGUCUCGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGUGAUCUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1533.82 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1616.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 1276.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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