Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-DLK1-35:74

Sequence Length

2368 nt

GC Content

0.4962

CCCAAGGGGGUGUCAGUCUUUGUCGACUGACUCUGUCAUCACCCUUAUGAUGUCCUGAAUGGAAGGAUCCCUUUGGGAAAUUCUCAGGAGGGGGACCUGGGCCAAGGGCUUGGCCAGCAUCCUGCUGGCAACUCCAAGGCCCUGGGUGGGCUUCUGGAAUGAGCAUGCUACUGAAUCACCAAAGGCACGCCCGACCUCUCUGAAGAUCUUCCUAUCCUUUUCUGGGGGAAUGGGGUCGAUGAGAGCAACCUCCUAGGGUUGUUGUGAGAAUUAAAUGAGAUAAAAGAGGCCUCAGGCAGGAUCUGGCAUAGAGGAGGUGAUCAGCAAAUGUUUGUUGAAAAGGUUUGACAGGUCAGUCCCUUCCCACCCCUCUUGCUUGUCUUACUUGUCUUAUUUAUUCUCCAACAGCACUCCAGGCAGCCCUUGUCCACGGGCUCUCCUUGCAUCAGGUAGGGGCUUUGCAGAGACCAUCGACGGGCUGACUUGAGUAAGAACACGAAUUAUGCAUGUGGCCAUUUCCAGAGCACUUUCUAUGUGAUAUGAACAUGUGAUUUUUAUGUAAUAUGUGUAUGUAAACGAGGCAGCCUCAUUUCCAGGUGAGGAUGCAUUUGGUAGUGUUGAUUUUUGUAAUUUAAAGAAGCUGAAAGGGAGAGAGGACCCGUGAGGACUGAACUCUCUGUCCCAUGGGGUAGGGCUUACAUUUACAUUAAAGAAACAGAAACUUGCUGGGAGGUGUAAGUAUUUGGUCACAUUGCUGGCAACAGAAGGGGUUGGAGUUGGACCCAGGGUGCCACGCUAGCUGCCCUCACCCCUUCUUCCCCUCUGGCCCAGAGUUAUACUAAGAGUCCUUUUAUUUCAAACCAAAUGUUUGACAAUGGGACAGUCUGUUUGAAAUCCCAGCUGCCUGGGGUGGUCUUGGGGGUCUGGGUGGCCCCAGUGCUGGUACCAUGUGCUGGCUUCACCUUUUAAUAACAGUGUGACCUUAAACAAGUCGCUUAACUACUCUAAGUUUCAGUUUCUUUCAUGGUCUAAAUGGAGAUUAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCCCCUCGUGUAUCUACCCCACAGGGCGCUUUUGAAGACCAAAUGCUGUAACUACUAUGAAAGUGCUUUGUAAAUUGCUGUGGAAAGUGUGAGCUACUCAAGCACCCGAGGCUGUCCCUCCUUGCUCACAUGUCCAGCCCAAUUCUCCCUUAGUGAGAACAGCACUCAGUAGGUGCUGUGUGUGUUUGUGUUCAAUUAAGAAAUUCCAGAAUAAAUAAAAAUGAAUUAAUUCAACAAACAUUUUCUGGGGCACCGACAAUCUGCCCAGUGCACCAGGCUAGGUAUCUGAUACAAAGAUAAUGAAAACAGUCUCUUGGAACCUAAUUGGGGUCCUCAUUUGACCAGGAAUUUCUUUCGUCCCGUUUUAAGCCAACCAGUUUUGUCCGGACAAGACAAAAACAACUUGGGCUGCUUUAGAGAAGCCCAGCUCAGUGUAGACAAUAGCUGCCCAGCCUCUGAAAGGGGCUGAUUGGAUUAUGUGGCAAAUGGAGGUGCAAGGAUGACUUGGACGGUGACAAAUGAAGUGGGCGGAGACCUGCUUUGAGUUAAUCCAGGCUAUUAGGAGGGGACCUUUUGUCUUCCAGAGACUGGCAGGAGCUUUUACCAGUGGUUUUUACAUCCUUAAUGUUCAGGACGAAUAAUUUAUGGUCAGUGAAAAUCCAGGCCCCAGUGAGAUUCGAGUGGGCUGUAAAAUCGAGAGUCCUGCUCCCAGUGAGUAAUGGUAGUGAAUGUUUCUGUCACUUUUUGCAACCGUCCAUUCAUUUGAUCCUCACAACUCCCUGUCCUGAGCCAGGACCGGCCACUGCCACUCCCAGGGAAACAGAGGCUGUCAAGAGGCUCCACAGAUUGGGCCCCACUGGAUCAUUGAACCCCUGUUCCCUGAGUUCUAGAGGAAGAAUUGUACCUGUCUCAGUCCCGGCCACCUCCAGAAGGCCUCCCUCUGCAUUUCUGACUUUGCUGUGCCGGCAGCCUGGAGCCUCCCAGGUCCCUGCUGUCAUCUUUUCUAGCCACUACAGUCUCUGUCUUUCCUUUCACAGCCAAGCUUCUUGAAAGGCCUGUCUACACUUGCUGUCUUCCUUCCUCACCUCCAAUUUCCUCUUCAACCCACUGCUUCCUGACUCGCUCUACUCCGUGGAAGCACGCUCACAAAGGCACGUGGGCCGUGGCCCGGCUGGGUCGGCUGAAGAACUGCGGAUGGAAGCUGCGGAAGAGGCCCUGAUGGGGCCCACCAUCCCGGACCCAAGUCUUCUUCCUGGCGGGCCUCUCGUCUCCUUCCUGGUUUGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-817.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -864.96

Frequency: 0.0000

Diversity: 553.4

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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