Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-DLK1-35:86
Sequence Length
720 nt
GC Content
0.6250
CUUCAACCCACUGCUUCCUGACUCGCUCUACUCCGUGGAAGCACGCUCACAAAGUUCCUGACCUGGCCAUCCCGGGGUGCCCUUGACCAGCCCCGUGUCUCCUCAGGGUGUCCCAGCACCAGCCUGGCACAGAGUGGGGCUCAGUUAGAGUAUGUGGGAUGUUGGUUUCGCCAGGCACGUGGGCCGUGGCCCGGCUGGGUCGGCUGAAGAACUGCGGAUGGAAGCUGCGGAAGAGGCCCUGAUGGGGCCCACCAUCCCGGACCCAAGUCUUCUUCCUGGCGGGCCUCUCGUCUCCUUCCUGGUUUGGGCGGAAGCCAUCACCUGGAUGCCUACGUGGGAAGGGACCUCGAAUGUGGGACCCCAGCCCCUCUCCAGCUCGAAAUCCCUCCACAGCCACGGGGACACCCUGCACCUAUUCCCACGGGACAGGCUGGACCCAGAGACUCUGGACCCGGGGCCUCCCCUUGAGUAGAGACCCGCCCUCUGACUGAUGGACGCCGCUGACCUGGGGUCAGACCCGUGGGCUGGACCCCUGCCCACCCCGCAGGAACCCUGAGGCCUAGGGGAGCUGUUGAGCCUUCAGUGUCUGCAUGUGGGAAGUGGGCUCCUUCACCUACCUCACAGGGCUGUUGUGAGGGGCGCUGUGAUGCGGUUCCAAAGCACAGGGCUUGGCGCACCCCACUGUGCUCUCAAUAAAUGUGUUUCCUGUCUUAACAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-290.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -302.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 203.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((((..(((((...(((((((...)))).)))..(((((...((((((...(((((((....(((((((..(..(.(((((((((.(((((((((((((((((........((((.((.....)).))))((((((((((.....((((((.(((...(.(((..((...(((((.(..(((((((..(((.((.........)).)))...))))).))..).))))))).))).).))).))))))((((....)))).......((((((.((((..((....(((.(((...(((....)))...))).))).((((.((((((((((((..((((.((.((((..........))))))..))))..))))).....((...(((....))).))......)))))))....)))).((..(((((...)))))..))((((...))))..))..)))).)))))))))))))))).))))))......)))))))..)))).)).)))))))...)..)..)))))))((((...)))).)))).)))))))))..)))))..)))).)...))).)))))..(((((........)))))...(((((((..((((..(((((((.(((.((((...((((.((.....))))))))))...))).)))))))..))))..))....)))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((((((..{((((...(((((((...))))}}))..(((((...((((((...(((((((....(((((((..,..{.(((((((((.(((((((((((((((((.,{{...,||{{}||,}..,||{|,||{(((((((((...(((((.,,{((((...}))}|,{{,{{(((({.,{{((({{({{|(||{(({...,..{{(|((||,,.,||||.||..|.(({||,{,,(({{{{{.{|||,,,{({(....}}},.....,})),)))))}},,|||.,,.(((.(((...(((....)))...))).))).)}}}}}|||({||((({..((({.,|,{({........}},})},)),,))))..))))))).,,||,.,(((,...)))}),..(({(((....(((,.|{{({((..(((((...)))))..))|,}))))))),..)))))).,.))))).)))))))))}.))})})),,,..}))))))..)))).)).)))))))...,..}..)))))))((((...)))).)))).)))))))))..)))))..)))).}...))).)))))..(((((........)))))...(((((((..(((({{(((((((.(((.((((...(({{(((.....))))))))))...))).))))))),.})))..)}....)))))...........
Back