Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-DLK1-35:92
Sequence Length
4867 nt
GC Content
0.5348
GAAAUGGAGUCUCGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGUGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCUGCCUUCCGGGUUCAAGCAAUUCUCCCACCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGCGCCCACCACCACAGCCGGCUACUUUUUGUAUUUUUAGGAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGUCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUCAUGAUCCACCUGCCUUAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCAUGCCCAGCCCUAUAGUAGUUCUUCUUUUGCCCCUUAAUAUCUUCACCCACAUGUCCUGUACCCUGCCUGAACCCUCCUCCUCUUUUUGUUCUGAUCUUUGAGCUCCCUAGAGCCCAUAAUUCUUUAGAGCAGGUAUGUCCCGAGUCUGAAACAUGCCCUUAUUUGUCCCAAGCUCUGGACAUUUCUCACCCCAAGGCGGAUCAAUCAUGAUUAAAUCACUCCAAUUAAACUUUAGGCUCCAGUCAGACCUUCAGCCAAAUGGAAAAAAAAACUAGGGGAUAAGGGAGGUAGUUGGAGCAAGAAAAUGUUAUUAGUUGAAACCUUACGGGACCUUCCUCCCUUAGUGAGUCUGUUGGCUAAAGGUUCUCUGGCUUCGUGAAUUAGAAUCGGAUACUGUUUCCAAGUUAGCAAAACCAACUCUACCCCAGCACCCCACGAGGAAGAAUGUGGAAGGAUCUCCCAUUGGCCGGUUGGGGCAAAAGCCUGAGGCAAUCUUUCAUCCCCUUUUGCCAAGGCGAGACUUUCCCAGUGACGGUGAUGUAGUUGGCCACUCUGACUAUGGGUGGACUCGGGUGUAGACCUCUGAAGCUGAGAUCACACGAAAACCUGGCCUCCCCGCCAUGUAGCUGUUGGAGAGUAGAAAAAUAGAGCACGCCUGAUGUUUCUAAAUGAGAAGACUUUCAAUAGUAAUGAAGAAUCCAUGGCACUCUCCUCACCCUCAAACACAUGGCAGUCAUUCACAUACAGGCCCCAAAGCCACUGUUAGUGCUGCAGUAGCUCCUGUGGACAUUGGAAAGCCCGGAGAGGGCGUGGAAGAAAUCAGCUGGCCCCCGGCAGGUUCUCUGGGGUUUUGUGCCCAAGGCUCCUGGAGCCCUAAAAACUUUCAAAAGUUAACUCCCCACGUCCCCAUCCUGCUUGGGUUUCUGGACUUUUCUGAGGCACCGGCAGAGGGGUCUCGUUGCUCCCUUGAGUGUAGGGGCAGCCCUUUAACCUGGCUCCUUGAGUCCCUGCUUUUUCUGCUUCUGUUGCCUUCUUCCUCGUCUUCCUCUCUCUCAAUAUCUCCCUCUCUUUGUCCCUCCCCAGUUCCUGACCUGGCCAUCCCGGGGUGCCCUUGACCAGCCCCGUGUCUCCUCAGGGUGUCCCAGCACCAGCCUGGCACAGAGUGGGGCUCAGUUAGAGUAUGUGGGAUGUUGGUUUCGCCAGGUGAGUGAAUGAAAGGACUCGACCACCACAGCUGAGCCACUAGCUGGGCCAUGCGAAGAGUUCUAGGUGCAAAGGCUGGAGGGUGGAAUUCAUUUUUGAGAGGUGUGUGAGCAGCUUCCGACCCCUGCCCCAUUUGAACGGGGGCCUUGCUGGUCGCGUCCCUGCAUUCACCCGCGCGGCCAUCCCGUCAUCCAACAGUUGAUCCUAACUGAGCACGCCCACGGCCCUGGUCUGGCCUGGGCACCGGCCACCGUAGCCCAUCCCUUGAUGGCCUCUGUGUCCCCAGGAGGGCGGGCCGGGGGGUUGCCCAGGGGCUGGAGCAGUGGACUGUGGCUCCAUAGAGGUAGGCCGGAGGGUGUGAGGGCAGAUUCAAGCUAUCCCCAGGGCUCUGCUCUGGUCGGAGCCAGCCCCUUCUCCCUCUCUGCCUUCCCCGCCCCAUUCCUGAUGCUGAACUGUUCUGGACCCCUGGCCCUGAGUCUCUCAGGACCAAAGUGGGCACGGGAACAGCUGUAGUGUGUGCCCCCCCGGGCUUUGGCCACAGGUCUCCCUCUCGAGGUGUGGUUGUGACUGCGACCCUUCCCUUGCCGUGAUGCCUUCCUCCCCCGGGGCUUGGUCCAGCUCCUUCACUCUCUAGCAGCUGCUGGGGCCCACCUCCCAUGCCGAGGACCAGCAGGGGAAACCUCCAGGGAGCAUCUGCAGGCUCUGCUUCUGCCCGGCUGCUGGCUUGCUCUCCCUGGUGGCUCUCCAGCGGCCAGCUUCCUCACCCACCCGGCACUCCGCUUUGCUCUGUCUCCUGAGGUGGGCCUGACCAACCUCCCCUUCUCUGCCUCAGUCCCUGGGCUCCAGGGCUCAGCUCCACAGCCCUCUGCCUAGCAGGCUGGUUCUCCCUGCCAAGCCCAUACCUGUGGUCACCUGGCCCUCCUGUGGUCUGAGUACCACUCCCCUGCCCCAGGAGCCACUCCCACUCCAGCUGCCUGUUUCCAGCAGGUUCCCAGUGCCCCCGACAAGCCCCUGCUGGUGUCUCCAUCUCCUGCCAAGCAUCCUCCAGUGCCUCCUCCUGUGGGCCUGGCCUCAGGGCUAUGGACAGACUCCUGUCCCAUCCCAGAGACCCCUCGUGAUCGUGCCCUGGUGGGUGUUGCCCCCGCCUGCCUUUGCCUCCGCCGUGGCCCUGAGAGUCCUGGGCUCUGCCCCGCCCGGUCCCUUGCUCCCCACUCAGUUCUGGAUUUGGGGCUGCCCCUAACCCAGCCCGUUGCUGCUUUGCACCUUUUCCUGUCAUUGGGCAUCCCCCAGUAGUCACCCCACUCCACCGAAAAGUAAACUGCAGGUGAGGCCGUGCCCCGAGUCUUUCUUCGGUGUGUUUGGCUUUUCCGGGGCGCUUGCCUUGCCAUGAUUCUAACUCUCUGCCCUUCCCCAAGGCACGUGGGCCGUGGCCCGGCUGGGUCGGCUGAAGAACUGCGGAUGGAAGCUGCGGAAGAGGCCCUGAUGGGGCCCACCAUCCCGGACCCAAGUCUUCUUCCUGGCGGGCCUCUCGUCUCCUUCCUGGUUUGGGCGGAAGCCAUCACCUGGAUGCCUACGUGGGAAGGGACCUCGAAUGUGGGACCCCAGCCCCUCUCCAGCUCGAAAUCGUAAGUGGCUGGAGUGUAAAGAACACACAUGUGGCCUUGCUGCUGAGGGUGGGGCCAGCUGCCCGGAGCACACCGCCAGGCGGACCUCGUGGAGGGGCUGGCGGGCACUGGCCGGGGGUCUGUGCACCGGGAGGUGGGUGCCCAUCGAGUCAAGCCAAGUGCAGACCUGGGGGCUCCUGUUUUCUAAGACAGGAGCCCCCUGCCUCCUUGUGUUGUCUCUGUGGCAAAAGAAUUCUAUAGGCGGGCUUCAAAUGUCGGACCCCAAAAGAAUUUCUUCUUUUUCACUCUUCUAAAUGAAUGGCUCUUUCAUUAUUGAGUCUCCCUUUGGCUCUUGUGCCGCAGGGCAGACUAGGAUGGAAGUGCCCUGUGAGCUGGGGGGCCCUUCAAAGGGCCAAGGAGAAAACGCAGGCCGAGGGACCAGCCUUCCAAAUGGGCUUCAAGCUCCAAUGACCUCCGCUCGCCCCCUCGAAAUGUCUGGAAAACAUAAUGGGCAGAUUUUCUGUCUUCAAAGUUUCCGGCUAAACCUCUUCAAGUUCUUUAUUGUUUGGGACUGAGACACUCAGCCAUGUUAAUGGGUAGUUUCUUUUGUAUUUGCCUUGAAAGGCCAAAAUAUUUUUAUAUUGCCACAGACAAAGCCACCUAUUUAAAAAUGAACUCCAUGUCCGUCGUUUCCCACCAGGAGACUAUGUACCAUGUGUGUGUCUCUAUGUAUUCUGGGGUCUUGAAACAGGUUUCUCAUGGGGAUGGUCAUUCACCACGGUCCAGAGGGGCAGAACAGGCGGCGCUUGCCUUGCCCAGGGGGCCUGGGGAACGUGGGCCCUCAUCUCAGAUCUGCCCCCAGUAUGUUUAGGACGCGAGCCCCAGAAGGAUCUGGGAGUAAACUUAACAUUCACUGUGUCUCUGCUCUGCAUCCGCCAUUUGUGUGUGUUUCUGGACUGUGGGCUGUGUGUACCUUGGUUGGUGACUCAGUGAGAAGAAGCAGGAAUGCCAAAGAUACUGUGAAUGUUCUGAGUUUUGUUGCUGUUGUUGUUGAGAGGUUGUUUCACUGGUAUCUAUUGCAUUGUAUAAUAAAUGACCAGAUGAAUGAAUGAGUGAAGCAAGAGAGAAUGAAUAAACAAGUAAAUAGGUAAAGAAGUAAGCAAGCCAGGAUGAGAGUGUGUGUACACAAGACCAUGGUUCAUCCGCUUUGAUGGCUAGGCAAUCAAUAUAUAAAUAGAAAAAAACCAGUGAAUCACUAAGUAAUAGGGCAACACACAAAGCGAUAUCAGGUGAUUAUGGACUAAGGGGUAUGUGUAACUCAAAUAUAUGCCUCUGACAUUUGACAAUGAAAAAGAACCUAAAUGAAAGAAAGAAUGGAUGUAUGAGUAGUGAAGUGCAGAAUGAGACAUAGAUUUUGAGGCCCGUCAAAAUGAAAAGAUGCAAGUUAGGGAACAAGUGAUCAAAAGGGAGAAGGGAAAGGUUUUUUUUAAAAAACCAAAACAACAAAGAAAGGUUAAAAAAAAAAACAGACUAGAGGAUGAGUAAUGAGUAACUCUGUAAGGAGGACCAUGUCAGACUAUUGUAAGCUAAGCAUUAGGACUGAUACAAAUAAUAUAUGCUCCUGGCAUAGAAAAAUAAACCACAGAGAACGAGUUCAAAGAAUAGCAAAGAAAGAAAGAGGACCCAGUGGGCGAAAGAUGAGAGUGUACUUUUACCAAAAGUUAUCUAAGCCUGAGCACUUGAAGUCUGCACAUAAAUAAAUAAAUGACAAAAGAAAGAAAAAAAGGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1741.9 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1828.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 1468.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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