Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-ERICH1-15:1
Sequence Length
764 nt
GC Content
0.4097
UUAUUGCAACCCAGGAUUUUUCAGCCCCAGUUAUAAAACUCUGCCCUGUGUUUCAGACCACUGGUCAAACUACGUGACCCAAUUUCUGCUGUCCUCACCCUGGCUUAGUUAAUUGGAACAUUGUGCUAAGUACCAAGGUCAGAGAUGAGUCUCUGUGGAUGCUGUAAAGCCAUUUGAUUUUACAGUCUUGCUUAAACCAUAGCUUCUACUUUACUUUUUUUUUCUUUUCGUCAGCAAUCACUGGGGAAGGGAAACCAACACGGAUGCCUCAGUCAAGGAAGAAAAGCUGCCACAUCAUUUCAGUACUAAUAUCGGCUAAGCUUAAUAGAGCAUUUUUAUAAAUUAAGAACUUAAAACGGUAUUAUUUUUAAAAGACUAAAAAUAAAUACAGACAUAGUUUCUAAAAAGAUUUGCAAGUUGAUUUAAUUCAUUUAAGUAGUCCUACAUGUGUCACACCUUCACACACUCAGAAGGUCACACACAAUUUCCUGGUUUGUUGCAUUGACUCUUCUAGGAGAUUUUGUGAAGUACCAGUGCCACCCCGGGUACACCUUGGUGGGGACCGACAUUCUGACUUGCAAGCUCAGUUCCCAGUUGCAGUUUGAGGGUUCUCUCCCAACAUGUGAAGCACAAUGCCCAGCAAAUGAAGUCCGGACUGGAUCAUCGGGAGUCAUUCUCAGUCCAGGGUAUCCGGGUAAUUAUUUUAACUCCCAGACUUGCUCUUGGAGUAUUAAAGUGGAACCAAACUACAACAUUACCAUCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-187.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -202.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 195.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((.(((((((...((.(((((((....(((..(((..(((...((((.....(((((.......))))).....)))).......)))...)))..))))))))))..(((((((((...(((((((((((((((....)))))).....(((((((((.(....).)))))))))...(((........)))...((((((((......(((((((((.((((......)))).)))))))))((.....))...(((......))).....((((((((......................)))..)))))......(((..(((.....(((.(((((.......((((((((((((......))))))).)))))......))))).)))..)))..)))....(((......))).....(((....))).(((((...((((((.........)))))).))))).((((((((((...(((.....)))....))))))))))..))))))))...(((((......))))))))))))))((((..(((.(((.((((.((((.((........)))))))))).))).)))...)))).........)))))))))....))....)))))))((((((((....(....)....)).)))))).)))).....((((((((((((((((((.(((.....))).)))))..)))))))...............)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
........((((.(((({,,...({.{{((((....,||{..(((,,({(...{(({.....(((((.......))))).....||||.||,,,.}}},,.|||,.}|||,,||||..(((((((((...,((((((((((((((....}))))).,{..(((((((((.,....}.)))))))))...(((........)))...((((((((......(((((((((.((((......)))).))))))))}{{.....}|,,.{{{..,,..}}}.,,..{{(({({{......,,..............)))..}||||....|}||,.,{{{,....,|||{{({{.......((((((((((((......)))))))}}}))).,...,})}}},},,..,||,,|||.,{.{((......))).}}..}}}}}}..,,.{((((...((((((.........)))))).,|))},{(((((((((...(((.....)))....)))))))))}..))))))))...(((((......)))))))))))))|((((,.(({.{((.{((,{(({{{({........)))))))))}.))},)}},..}))).........))))))))).,,,),.,,,,}))))}||{{{|||.,,.|||||},...}),}})))),)))).,,,,|||,,{{{{(((((((((.(((.....))).)))))..))))||||.......,,.,....,,,,,.....
Back