Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-ERICH1-19:14
Sequence Length
989 nt
GC Content
0.4621
CCCUCCGUCCGGCAUCCGCGCCGCUCAAGGACUCCAAAGUCAGCGUCGCGAAUCGACAUCUAGAGGAGUACUCACCACUUAAUUGAUGAUCAAUACACGUUCCUUGAAAGAACCGAUAGCAUGCGAUCGAUACAGAGCAUCUGCACUGGGAUUGUCCGCCCCGCCUGUCAGGGAGGCCUCGGGGGCUAAUGGAGCUGAGGGUAUAGUCGGCCUUGGACCCUCGCUUUUUUCCUUUCCUGUACUAUGAAGAUAACUGCCUUAUCUCCCCCUCAGGACUGUUUUGGGGAUUAAAUAGGACGUUUAAAUUACCAACGCUCUUUGAAAUAAACAUUUCAAAAUUAUUAUAACCCUUUAGUACAUGUGGGAAAACGUUGACAUUCAUGUUCAAGUUUAUUUUUCUGCUGGCUCAUUUAGGUUUGUUGAAGCCUUGAGUCCCUAGGAUUGUCUAAGAACAUGGGUAAAUGUGUGUGGAGGCCUCCCUGGAGGCCAGAGAACUGCCAGCAGCCUUCAUGAUGUUAGGGGAACAGGAACCUAGGAGAGCCAGGGUGACAUCGUUUUAAAAUCAACAACCCAUCUUGGCGGGCGCGGUGGCUCAAGCCUGUAAUCCCAGCAGUUUGGGAGAAAAAAAUUAGCCGGGUGUGGUGGUGGGCACCUGUAAUCUCAGCUACUCAGGAGGCUGAAGCAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUCACGCCAUGGCACUCUAGCCUGGGCAACAAGAAUGAAACUCUGUCUCAAAAAAAUAAAAAUAAAAUAAAAUAAACUCCAUCUUAAAACCAGUGAAACCACCAUUGCAAAAUUAUAACUGAGACAGUGAGAGAUCUGACCUAACCAACUCCAUCCUACUUUUAACCUCCAAACUGUCCUUGUUCAUUCCUGGGUGUAGGCCAAACUAACUUUGGAAGAAACUUAGUUUAUGGUUUCCCGAAACAAAUCCUUUUCUUGUCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-282.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -302.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 234.5
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
................((((.((((....((((....)))))))).))))....((((...((((((..............(((((...)))))....((((.......))))((((........))))...((((...))))..(((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((..((.(((((........)))))))))).))))).....((((((..(.(((((((...((((((.....))))))...((((((((...))))))))........(((((((.........)))).)))(((((((....)))))))................))))))).).))))))(((((...((((((((((..........(((((..((((((...((((((....))))))))))))..)))))........)))))))))).))))).....)))))))))))))))))(((((..(((....)))..))).)).(.(((((..........))))).)..(((((((((.....(((........)))....)))))))))))).)))).(((....)))..)))))))))((((((((.((...((((.(((...((.((((((((.(((.(((((((((((.((..(((..(.((.(.(((((....))))).).)))..))))).)))))))))).).))).(((((..(((..(((......)))..))).............(.((((((((......................(((........)))....(((((.......)))))............)))))))).)...))))).)))..))).)).))...))).))))...)))))))))).....(((..((((.((((.(((......))))))).))))..)))...((((.(((....)))))))...))))))...))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..........||....((((.((((....((((....)))))))).))))....((((...((((((,,...,,.,,,...,,{|{||,,}}}}....((((.......)))},{,{.(,{{{{.,||,...,,||}}}}}))}.(((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((({..{(.(((((........)))))))))).))))).,...((((((..{.(((((((.{.((((((.....)))))),{{((,{({{,...}}}}))))........{(,((({.........)))).)}|(((((((....))))))),...............))))))).}.)))))}(((((.,,({((((((((.,,...,,..(((((..((((((...((((((....))))))))))))..)))))..,,,,..)))))))))).})))).....))))))))))))))))){{{,{..{{|....))).,)}).}}.|.{{{{{,.....,..,}}})),}..(((((((((.....{{{........}}}....)))))))))))).)))).(((....)))..)))))))))(((((((((((...{{{,..((..(((((.(((((((((({,{(((((((((.((..(((..(.((.(.(((((....))))).).)))..))))).))))))))))})...,.(((((..(((..(((......)))..))).............{.((((((((......................,..........,,.....(((((.......)))))............)))))))).}...))))).,))),}))},)).)))))..}))))...)))))))))).....|||}.|||,.||||,|{(.,,,..}}||,||{||,.{{||{{..,,,..,))))}}}}}}},,...})))))...)))).,,
Back