Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-ERICH1-19:19

Sequence Length

1278 nt

GC Content

0.5125

GGGGCCGGGCUGAACCAUGGCGGGCGGCGGCAUGGGGGCGGUGGGGCUCCGCGGGCAGCCUGGUUGCGCUGCACCCGGACGGGGCCGAGGGGACCUGAAAGCUGCGGCAGAGCCUGACCGCGCCGUUCUCCAGAAGAGCCCCGGCCGCGGCUGAGUCGCGCUCCGGGUGUGGACGGAGCCGGAGCCUCCCCGGGGCUCGGUGAGGACACAGGGCCCAAGCCCCGGACCUUCAAGUCUUGACCGAGCGCAUCCCCGGCCCUUCUGCGCCCACACCUGAGUUUUUGUCUGUAGGAGUUUCCGCAGUUUGCUAAGAAUCGACAUCUAGAGGAGUACUCACCACUUAAUUGAUGAUCAAUACACGUUCCUUGAAAGAACCGAUAGCAUGCGAUCGAUACAGAGCAUCUGCACUGGGAUUGUCCGCCCCGCCUGUCAGGGAGGCCUCGGGGGCUAAUGGAGCUGAGGGUAUAGUCGGCCUUGGACCCUCGCUUUUUUCCUUUCCUGUACUAUGAAGAUAACUGCCUUAUCUCCCCCUCAGGACUGUUUUGGGGAUUAAAUAGGACGUUUAAAUUACCAACGCUCUUUGAAAUAAACAUUUCAAAAUUAUUAUAACCCUUUAGUACAUGUGGGAAAACGUUGACAUUCAUGUUCAAGUUUAUUUUUCUGCUGGCUCAUUUAGGUUUGUUGAAGCCUUGAGUCCCUAGGAUUGUCUAAGAACAUGGGUAAAUGUGUGUGGAGGCCUCCCUGGAGGCCAGAGAACUGCCAGCAGCCUUCAUGAUGUUAGGGGAACAGGAACCUAGGAGAGCCAGGGUGACAUCGUUUUAAAAUCAACAACCCAUCUUGGCGGGCGCGGUGGCUCAAGCCUGUAAUCCCAGCAGUUUGGGAGAAAAAAAUUAGCCGGGUGUGGUGGUGGGCACCUGUAAUCUCAGCUACUCAGGAGGCUGAAGCAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUCACGCCAUGGCACUCUAGCCUGGGCAACAAGAAUGAAACUCUGUCUCAAAAAAAUAAAAAUAAAAUAAAAUAAACUCCAUCUUAAAACCAGUGAAACCACCAUUGCAAAAUUAUAACUGAGACAGUGAGAGAUCUGACCUAACCAACUCCAUCCUACUUUUAACCUCCAAACUGUCCUUGUUCAUUCCUGGGUGUAGGCCAAACUAACUUUGGAAGAAACUUAGUUUAUGGUUUCCCGAAACAAAUCCUUUUCUUGUCUGGAGACUAGACUGCCUUUGUAGGACUAAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-437 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -461.9

Frequency: 0.0000

Diversity: 311.61

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.((((((((.((((.(((((((.(((...((((.(((.(((((((((.(((..((((((((.((((((((((((((((((((....(((...(((.(.((((((((...))).))))).).))))))....).))))))..((((((...)))))).))))))))))).)).)))))).))..)))))))(((((((.(((((..((((((........)).))))...))))).))))))))).)))))).)))).))))))))...((((.((((((((.....(((...(((((((..((((..(.((((((((((((((.....)))........(((((...)))))....((((.......))))...))).)))...))))).)..)))).))))....)))...))).((((((((.(((((((((((((((((((((..((.(((((........)))))))))).))))).....((((((..(.(((((((...((((((.....))))))...((((((((...))))))))........(((((((.........)))).)))(((((((....)))))))................))))))).).))))))(((((...((((((((((..........(((((..((((((...((((((....))))))))))))..)))))........)))))))))).))))).....)))))))))))))))))(((((..(((....)))..))).))......)))).)))))))).))))...(((((((((.....(((........)))....)))))))))....)).)))).)).))))))...)))).(((((((((.((...((((.(((...((.((((((((.(((.(((((((((((.((..(((..(.((.(.(((((....))))).).)))..))))).)))))))))).).))).(((((..(((..(((......)))..))).............(.((((((((......................(((........)))....(((((.......)))))............)))))))).)...))))).)))..))).)).))...))).))))...)))))))))))....(((..((((.((((.(((......))))))).))))..))).(((((..((((((((.((...(((....)))....)).)))))))))))))(((....)))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((,((((((({.((((,(((((({{(((...((((,(((.(((((((((.(((..((((((((.((((((((((((((((((((..{{(((...{{..({,(((((((...))).)))))},,})))))....).)))))){,{(((((...))))))}))))))))))).)).)))))).))..))))))}(((((((.(((((..(((({(,.......)).)))}...))))).)))))))}).}))))),)))).))))})))...{{((.(({{{{{{||,,.(({,.,{{{((((..((((..{.((((({{(({{{{({.,..}}},...,...(((({...}))))....((((.......))))|,.}}}.}}}...))))).}..)))).))))..,|||}...}))}||||((((.{((((((((((((((((((({..{(.(((((,,......}}}}}))))).))))),,,.,((((((..{.(((((((.,.((((((.....)))))),{{((,{({{,...}}}}))))........{(,((((.........)))).)}|(((((((....))))))),...............))))))).}.)))))}(((((.,,({((((((((.,,...,,..(((((..((((((...((((((....))))))))))))..)))))..,,,,..)))))))))}.})))).....)))))))))))))))))|,{,{..||||,,|}}},|||},,}.,,,,,)))}.})))))}}.}))),,.(((((((((.....(((........)))....)))))))))||{,}}.}}}),)).,)))))...}))).((((((({({{(...,{{,.,({..(((((.(((((((((({,{(((((((((.((..(((..(.((.(.(((((....))))).).)))..))))).))))))))))})...,.(((((..(((..(((......)))..))).............{.((((((((......................,..........,,.....(((((.......)))))............)))))))).}...))))).,))),}))},)).)))))..})}}}...)))))))))))....{((..((((.{(((.(((......))))))}.)))).,))).{((((,.{(((((((.({.,,{(,....,}}.}}})).))))))))))))}{{{....))).,....