Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-ERICH1-19:2

Sequence Length

917 nt

GC Content

0.4722

CUUGACAGCAGCUCCGACGGCACCUCUGUGGCUCUGCAGGAGCCGCCUCCCCGCCUCGUGGGCACACAGAAUCGACAUCUAGAGGAGUACUCACCACUUAAUUGAUGAUCAAUACACGUUCCUUGAAAGAACCGAUAGCAUGCGAUCGAUACAGAGCAUCUGCACUGGGAUUGUCCGCCCCGCCUGUCAGGGAGGCCUCGGGGGCUAAUGGAGCUGAGGGUAUAGUCGGCCUUGGACCCUCGCUUUUUUCCUUUCCUGUACUAUGAAGAUAACUGCCUUAUCUCCCCCUCAGGACUGUUUUGGGGAUUAAAUAGGACGUUUAAAUUACCAACGCUCUUUGAAAUAAACAUUUCAAAAUUAUUAUAACCCUUUAGUACAUGUGGGAAAACGUUGACAUUCAUGUUCAAGUUUAUUUUUCUGCUGGCUCAUUUAGGUUUGUUGAAGCCUUGAGUCCCUAGGAUUGUCUAAGAACAUGGGUAAAUGUGUGUGGAGGCCUCCCUGGAGGCCAGAGAACUGCCAGCAGCCUUCAUGAUGUUAGGGGAACAGGAACCUAGGAGAGCCAGGGUGACAUCGUUUUAAAAUCAACAACCCAUCUUGGCGGGCGCGGUGGCUCAAGCCUGUAAUCCCAGCAGUUUGGGAGAAAAAAAUUAGCCGGGUGUGGUGGUGGGCACCUGUAAUCUCAGCUACUCAGGAGGCUGAAGCAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUCACGCCAUGGCACUCUAGCCUGGGCAACAAGAAUGAAACUCUGUCUCAAAAAAAUAAAAAUAAAAUAAAAUAAACUCCAUCUUAAAACCAGUGAAACCACCAUUGCAAAAUUAUAACUGAGACAGUGAGAGAUCUGACCUAACCAACUCCAUCCUACUUUUAACCUCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-272.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -287.92

Frequency: 0.0000

Diversity: 211.24

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((((((..((.((((((((((((((((...))))))))......(((((.((((...........((((((..(((..((....))..)))....)))).)).......((((.......))))((((........)))).....((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((.(((((........)))))))))).))))).....((((((..(.(((((((...((((((.....))))))...((((((((...))))))))........(((((((.........)))).)))(((((((....)))))))................))))))).).))))))(((((...((((((((((..........(((((..((((((...((((((....))))))))))))..)))))........)))))))))).))))).....)))))))))))))((((..(((..(((((.((.((((......(.(((((..........))))).)..(((((((((.....(((........)))....)))))))))))))))))))))))..))))....((((((....)))))).............)))))..)).))))))))......)))))))....((((....)))).)))))..)))))...)))).)))))))))).))).))))))))(((((..(((..(((......)))..))).............(.((((((((......................(((........)))....(((((.......)))))............)))))))).)...)))))...................................

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,,,...((((((..((.((((((((((((((((...))))))))......(((((.((((......,.,{,(,(((({,{{(,.,,.,,|,,.,}},.,{{||,,.))}}}....((((.......))))|{,|,|.,}|},})}}...,,({(({{{{{{.{{(((,,(((((((((((((({(((((((((((((((((((({..{(.(((((........)))))))))).))))).....((((((..{.(((((((.,.((((((.....)))))),{{((,{({{,...}}}}))))........{(,((((.........)))).)}|(((((((....))))))),...............))))))).}.))))))(((((...((((((((((..,...{,..(((((..((((((...((((((....))))))))))))..)))))..,,,,..)))))))))).))))).....))))))))))))}||||..(((..(((({.{(.((({.,....{.{((((..........))))).}..(((((((((.....{{{........}}}....)))))))))))))))))))))))..))))....((((({....}))))).............)))))},)).)))))))}}}}},.,}}|{|{{{.,,,,.,.}})))},||}}}..))))),..)))).))))))))))}})).)})))))){{{{{..(((..(((......)))..))).............{.((((((((......................,..........,,.....(((((.......)))))............)))))))).}.,.}})))...................................