Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-ERICH1-19:3
Sequence Length
978 nt
GC Content
0.4581
GCAUCCGCGCCGCUCAAGGACUCCAAAGUCAGCGUCGCGAAUCGACAUCUAGAGGAGUACUCACCACUUAAUUGAUGAUCAAUACACGUUCCUUGAAAGAACCGAUAGCAUGCGAUCGAUACAGAGCAUCUGCACUGGGAUUGUCCGCCCCGCCUGUCAGGGAGGCCUCGGGGGCUAAUGGAGCUGAGGGUAUAGUCGGCCUUGGACCCUCGCUUUUUUCCUUUCCUGUACUAUGAAGAUAACUGCCUUAUCUCCCCCUCAGGACUGUUUUGGGGAUUAAAUAGGACGUUUAAAUUACCAACGCUCUUUGAAAUAAACAUUUCAAAAUUAUUAUAACCCUUUAGUACAUGUGGGAAAACGUUGACAUUCAUGUUCAAGUUUAUUUUUCUGCUGGCUCAUUUAGGUUUGUUGAAGCCUUGAGUCCCUAGGAUUGUCUAAGAACAUGGGUAAAUGUGUGUGGAGGCCUCCCUGGAGGCCAGAGAACUGCCAGCAGCCUUCAUGAUGUUAGGGGAACAGGAACCUAGGAGAGCCAGGGUGACAUCGUUUUAAAAUCAACAACCCAUCUUGGCGGGCGCGGUGGCUCAAGCCUGUAAUCCCAGCAGUUUGGGAGAAAAAAAUUAGCCGGGUGUGGUGGUGGGCACCUGUAAUCUCAGCUACUCAGGAGGCUGAAGCAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUCACGCCAUGGCACUCUAGCCUGGGCAACAAGAAUGAAACUCUGUCUCAAAAAAAUAAAAAUAAAAUAAAAUAAACUCCAUCUUAAAACCAGUGAAACCACCAUUGCAAAAUUAUAACUGAGACAGUGAGAGAUCUGACCUAACCAACUCCAUCCUACUUUUAACCUCCAAACUGUCCUUGUUCAUUCCUGGGUGUAGGCCAAACUAACUUUGGAAGAAACUUAGUUUAUGGUUUCCCGAAACAAAUCCUUUUCUUGUCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-282.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -301.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 218.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((.((((....((((....)))))))).))))....((((...((((((..............(((((...)))))....((((.......))))((((........))))...((((...))))..(((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((..((.(((((........)))))))))).))))).....((((((..(.(((((((...((((((.....))))))...((((((((...))))))))........(((((((.........)))).)))(((((((....)))))))................))))))).).))))))(((((...((((((((((..........(((((..((((((...((((((....))))))))))))..)))))........)))))))))).))))).....)))))))))))))))))(((((..(((....)))..))).)).(.(((((..........))))).)..(((((((((.....(((........)))....)))))))))))).)))).(((....)))..)))))))))((((((((.((...((((.(((...((.((((((((.(((.(((((((((((.((..(((..(.((.(.(((((....))))).).)))..))))).)))))))))).).))).(((((..(((..(((......)))..))).............(.((((((((......................(((........)))....(((((.......)))))............)))))))).)...))))).)))..))).)).))...))).))))...)))))))))).....(((..((((.((((.(((......))))))).))))..)))...((((.(((....)))))))...))))))...))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((.((((....((((....)))))))).))))....((((...((((((.....,,.,,....,,{({,,,,|}}}....((((.......)))),{,{.(,{{{{.,||,....,||}}}}}))}.(((((((((.(((((((((((.((((((((((((((((((({{..{(.(((((.,......}})})))))}.))))).,,..((((((..{.(((((((.{.((((((.....)))))),{{((,{({{,...}}}}))))........{(,((({.........)))).)}|(((((((....))))))),............,..))))))).}.)))))}(((((.,,({((((((((.,,...,,..(((((..((((((...((((((....))))))))))))..)))))..,,,,..)))))))))).})))).....))))))))))))))))){{{,{..{{|....))).,)}).}}.{.{({((,.........}}})),}..(((((((((.....{{{........}}}....)))))))))))).)))).(((....)))..)))))))))(((((((((((...{{{,..((..(((((.(((((((((({,{(((((((((.((..(((..(.((.(.(((((....))))).).)))..))))).))))))))))})...,.(((((..(((..(((......)))..))).............{.((((((((......................,..........,,.....(((((.......)))))............)))))))).}...))))).,))),}))},)).)))))..}))))...))))))))))....,|||}.|||,.||||,{{(.,,...}}}},||{||,,{{|||{..|,,,.,)))}}}))}}},,...))))))...))))...
Back