Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-FGF9-3:3
Sequence Length
325 nt
GC Content
0.4154
GUGAAAUUGCACAGUGUCAGGAAUGAUUUGCCAAUGUCUUCAGUAGGAUUCAACAGAGUUGGAUUGCUGAGAAUAAAAUUACGGAUUUCUCCAUAAUGGACACACGCACUUUUUGUUUGUGCUGUUUCCUUUAGAAUGGACGAUGAGUCAAAAUUGUUCGUUUAUGCUUCUUCACAGAAGGAUCUUCUGUGUCGUAGGAGGUGGCCUGCAGCAAUCUGGACAUUCAGUGGUCCUCCUGUGAUUAAUAGGUGAACGGAUGAGCUAUUCUGAUAAGAACUGGGGAACUUUUGCCAUUCAAAAGCAAAUAGAAGAACUGGGAGAUUCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-88 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -94.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 83.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((......))).......(((...((((.(((...(((((.....(((((....)))))(((((((((((......((((.(((....))).))))(((.(((.((((.........))))))).)))....(((((((((((........)))))))))))..(((((((((((((((...))))))))....)))))))...)).)))))))))((((........)))).(((((.....)))))....((((........))))....(((.(((.((....)).))))))...........)))))..))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{(...,,.|}|,,,,{{,,,..,}||{{,{|,.,,{{((((((,.,(((((((...))))))))))))))......,{{{.(((..,,|||.}}}}{||{(((.((({.....}}.})))||||{|,|(((.((((((.(((.(((({....((((((((((((..,...((((((.((((((..(((((((.((((.{.{{.,,,.)}.)..}))})))),.})).)))))).)))))).......)))))))))))).(({((((....)))).))).},})))))))))))).}))).))))}}....,,})),))}})),
Back