Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-FGF9-3:7

Sequence Length

2142 nt

GC Content

0.4342

AGGGGCUGGGCGGGCCGGCCCAGGGCCUGCCUAUGGCCUGAAAGAGAAAACCUGCCACGGAGCCCGGGCUUCUCUGAUCCUCCCGCCAAACUUUGUCUCUCAUUUAGCUUUCUUUGUGUCUGAGGAUUUAGCAAAGGCCUCAGGGAUUCAACAGAGUUGGAUUGCUGAGAAUAAAAUUACGGAUUUCUCCAUAAUGGACACACGCACUUUUUGUUUGUGCUGUUUCCUUUAGAAUGGACGAUGAGUCAAAAUUGUUCGUUUAUGCUUCUUCACAGAAGGAUCUUCUGUGUCGUAGGAGGUGGCCUGCAGCAAUCUGGACAUUCAGUGGUCCUCCUGUGAUUAAUAGGUGAACGGAUGAGCUAUUCUGAUAAGAACUGGGGAACUUUUGCCAUUCAAAAGCAAAUAGAAGAACUGGGAGAUUCCUCAACUUAGCUUUUCUUUUUUUUGGUUCUAAAGUGACUGCGAAUGGAGGUAGAAGAGAAGAAAAGCUUUCAAAAACAUCUUCCAUUAAGAAAAAUAUGUAUCUUCAUGAAGACCUAUCUGAGUAAAAUUACUAAAACAUAAUGGCUUUCUUGAAAUAGAAUGGAAUGAAAGGCAUAUUAGGGAGUAUGAAAGUAUGAAGAUUUUAUUAACAUACUUCUAGAAGUUUAUUAAAUAUCUGCACAGGAACUGUAAUUUGAGAUCAGUGGUGGAAAGAGAAUAAAGGAAUCACGUGGACAUCAGCUCUGAGGCCUGUGGCCCCACUUGCUUCUGGGCUUUCUAUAGACAUUUGCUGGUGACCUGCCCAGGCAGGCUAGAGUACCCUUCCUCAUUGCACCCUGUGUUCCCAUCCUCUUUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUUCUUCCUCCAUCCCUUAUGAAACCCUCGUUGUGCAGUUACUUAUUAGGUGCUGUGUGAGCGUCUGAAGUCUCCCCUCACCCACUUUUCCAUUUGGGCCACUUGGCCAGUGAUUGCAUCAGUACCAGGGUUCUAGGAGCCAUGCAGGGAUCCCCAGUGGGCAGAGCUGGCCGUAGCAUUUGGAAAGGAAGAGAGAGAACUGGAGACAAUGCCUAGGAACAAAAGCAGAGUCCAGACCCAGGCAUCAAGUGCAAAUCCAAAGGCUCUGGAUGAGUCAGUUCCCAGCAAAGGGACACAAGUAGGCACAGAAGGAAGGACAGCAGAAAACACUGGUCCAGAGAGGGCCUGCAGAGCCAGAAGCGAUGACGCAUCCAAGGUUGUGUUUGACUUCUGCACUGCCUCUGCAACCUGUAAGCACAUCUGAGCCAGUUCAGAAAGUAGGAAAACCAAAGUAUAUCAGAAAUGGCCUCUUAUCAUCAAGGAGAUUUUGGUCUAGAUUGCUUAUUGCUCAGGAGAAAUCACCACUUUUUAAAAAGAUAUGCUGAGAUAGGGUUUAGUUGGGAUAGAAAAGGUUAUUAAACUACGGGACACCCUUCCUUUACAGAGUGUAAGCACUACUACCCCUUUUGUUUGUCUGUUUUUCUUAUUUUUCUCACAGAUGCAGUUCCUGCAUUAGUAUUGAUAAAUGUGUGGCUGCUCCACUUGGAGUGUUUUCAAAGCAUAAAUCACAGCAUUGAUGGUGCUGUGGUUUGGCUCUUCCAGCCCUCUUAACAACGGUCUGAUGGACUUGGCGAGAGUCUAGCCACGUGUUCUGGCCUCUGUCACUCUCAUGGCUGAAACGCAUGCACACCCACAGAUGGGGGCCCCGUGGUAGAGAUGUGCCUCUACUUGUCAAAUAGACUGACUCCAAAUUCGGAAAUAUGCCUCAGGAAUCUAGAAAGAUAGAAAAGGAGUCUUCGUCACUGUAGGGUCUCAUUCACAAUAUGGAGGAGAGAUGGAGGGGAGUUUUUGGUAUAAAUUUUGCCUCAUAAAAAUUCUCCACGUUGUUUUGUACUGUAUGAGGGUAGCGAGAAAUUAGUUGAUGGUUAACAAUCAAGCUGGAGAAGAAUAUCCUCAAUUUUUCACAUGGAAAAUGAAAAACUACAACUCCUUCCAAAUAUAUGUAUGUUUCUUUUCUGAAGAUAGACGUGUGUGUGUUUGUGUGUAUCAUAUAACAUUUAUUUUUUGAUUUCUUUGUUAUCAACAGUAAAAAUACAGAAAAUGAUGCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-638.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -682.2

Frequency: 0.0000

Diversity: 559.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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