Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-FGFR2-12:11

Sequence Length

943 nt

GC Content

0.4592

CUACGCUGGGAAGAGAUGAGCUGAUGCCCAGCUCAGCUGCUCUUCUGAGUCUUCAAUUUCCAGACCAACCUCCCUUAAGGUGACUGACAGUGGGGACCUCAACCUCACCUACAGGGAUGUGGACUGAUCCCAUGGUCUCAGUGAGAGACCCAGGCAAUAUUUCUACAUGAAGCAUGUUGGAUUUCUGAAUUAUCCAGCCUCAAAUGACACCGGGAUGGGACAGUGUUAACCCAGAUAAGAAAACUGAGGCUCUGAGAAGUUGAGGGACUUGGUCAAGGCCACAUGUCAGUGAGUGCCAGAAGUUUCUGCUACUCCUACAAAAUCAGAAGUUCCCCAAAUCCAAACCAUCUCGACCUACCCCUGUGACCCGCCAAAAGAAGCUGGCCUUCCCCAUCCUCCUGUCUCCGCAGUGCCAUUUGCCUUUCAGUCUCCUAAAAAGAAGCACUUACUCUCUUCCCCAAAUCGCAGAGGGAAGCUUCAAAUACACUUCUAAUCAUCCUCAGUACCCAGCAGUAUAUAGGAAGUUAUUGUCCCAAAGUUGUGUGUCAUGCCCGAAGUGUCUGGGAUCCCCGAGUGCCUGUGGUGCCCAAGAGCUAUGAAUCUGCUAUCAUCAACACAGAGGGUACCUUCUGAAUGGGCUAUGUCUACAGUGAUGCUGCAAAUGGAAGCUAACCCUAGGAUGACUGGCCUCUGACACUUGAGCCAUCCCAUCAUCUGUCAUGGGUUGACCCAUCCAUCCCCUCAAUGAGCCUGACCUUCAGGACCACUGACAGAGGAGCAGUCAAUAGAAAUUAAUUGUUAAAUACCCAGAAAAUCUGAAAUGGUAUUUAAUAUGCAGUUCAUCAAGAGCAAAAGUUCCUUAAAUCUUCAUCUAGAAAAGUUAUUUAUAAGGGAUGAAUAUGUUGUAUGAAUAUGUUGUAUGCAAAUAUUAUAUUCAAGGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-263.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -280.69

Frequency: 0.0000

Diversity: 270.63

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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