Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-FGFR2-12:12

Sequence Length

907 nt

GC Content

0.4542

CUGCUCUUCUGAGUCUUCAAUUUCCAGACCAACCUCCCUUAAGGUGACUGACAGUGGGGACCUCAACCUCACCUACAGGGAUGUGGACUGAUCCCAUGGUCUCAGUGAGAGACCCAGGCAAUAUUUCUACAUGAAGCAUGUUGGAUUUCUGAAUUAUCCAGCCUCAAAUGACACCGGGAUGGGACAGUGUUAACCCAGAUAAGAAAACUGAGGCUCUGAGAAGUUGAGGGACUUGGUCAAGGCCACAUGUCAGUGAGUGCCAGAAGUUUCUGCUACUCCUACAAAAUCAGAAGUUCCCCAAAUCCAAACCAUCUCGACCUACCCCUGUGACCCGCCAAAAGAAGCUGGCCUUCCCCAUCCUCCUGUCUCCGCAGUGCCAUUUGCCUUUCAGUCUCCUAAAAAGAAGCACUUACUCUCUUCCCCAAAUCGCAGAGGGAAGCUUCAAAUACACUUCUAAUCAUCCUCAGUACCCAGCAGUAUAUAGGAAGUUAUUGUCCCAAAGUUGUGUGUCAUGCCCGAAGUGUCUGGGAUCCCCGAGUGCCUGUGGUGCCCAAGAGCUAUGAAUCUGCUAUCAUCAACACAGAGGGUACCUUCUGAAUGGGCUAUGUCUACAGUGAUGCUGCAAAUGGAAGCUAACCCUAGGAUGACUGGCCUCUGACACUUGAGCCAUCCCAUCAUCUGUCAUGGGUUGACCCAUCCAUCCCCUCAAUGAGCCUGACCUUCAGGACCACUGACAGAGGAGCAGUCAAUAGAAAUUAAUUGUUAAAUACCCAGAAAAUCUGAAAUGGUAUUUAAUAUGCAGUUCAUCAAGAGCAAAAGUUCCUUAAAUCUUCAUCUAGAAAAGUUAUUUAUAAGGGAUGAAUAUGUUGUAUGAAUAUGUUGUAUGCAAAUAUUAUAUUCAAGGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-247.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -264.27

Frequency: 0.0000

Diversity: 246.42

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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