Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-HMBOX1-12:1

Sequence Length

849 nt

GC Content

0.5866

AUUCAUAAAACCGAGGCCGAGAGGAAGAGGGAGGCGGCCUCCGACCCGCCGCCAGCGGCGGGCAGCGCCCGGACUUUGUGAAUGGAGCGCGCGGCGCCUUUCGCCGUCUACCCGCGGGCCCAGCCUGCGCCGCGCCUCCAGCCCGACACCGGCACCUGUGCCGCCGCUGCACCCCGCCGCUAGGCGGGCGGCGCCAAAGGAAAUAGCCGGCUGAGGAGGCCAGGGCUCGGGUUUGAGCUUUCAUCCCUUGGCACCUUCGCGCUUCCCCGCGUGACAGCCCCGUAGGUUUUUCCCGGUUACCCAAGUGGAGAGGGGACCGGAGCGCUGCUGCCCACCCAGCGGGGCCUGACACCUCCUAGCCCCAGACUCCCCGUGCGCUUUCGGCCCGGCCAGUCCUUUCUGAAUAUGCGAUUCCUGAGACGUUAGCGUAUGCAUUAGCGUGAUCGAUUUUCAUCUAAAGCCAUUAAAUCAGUUUUAUAGCUUCCCCAAGAACGUGGGCAACCCCCUGCUUGGAAGAUGAAAGAGAAAGUCCUCCCGCCCGAAGCCCAGGAUCGGAGUGAGGUGUGGGGUUUGUUGCUUUACUACCCAAAGGGAGGCAUUAAUUGCCGGAAUGGUGUUCCGAGGGAGGAGAGCAGGCUGCGCUCCUGUCCACGCUUCCUAAAAGAUGUUUAUUUAACCCUGGUCGGGGGAAAAACAAGGUUUUCGGGUUUGGGAAACGUCUUCACCCUAUCUUGCAUAGUUGUGAAUUAUCCUUUCAGGAAAUGACAGGGUCCACAUUUGUUGCGGAGCUGGACCCUGGAAAAUGUACCCGCAAAGAAUGACCUUUUGAAAGGACUUCAGCAGCUCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-332.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -349.18

Frequency: 0.0000

Diversity: 195.43

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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