Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-HMBOX1-1:5

Sequence Length

552 nt

GC Content

0.3895

UUUUUUUUUUUUUUGCUUGUGCUUAUUAAAUAGCAAGGGUCAUCUGUCAGGAUGUUGUGGUGGUGUGUGAUCAGAGCAGAGGGCCUUUCUUUUCCUGUACUGUGCUCUACUUCCUUAUGCAUGCUUGGUUUCAAAGAUGACCGCCACUUUAAAAGAAAGAUUUCCUCACAGCUCUCCAGAGAACUAUCAUACUAAGGUGAUAGGAAAGGCUUCUCGGAUACAAGCCAACAAGUCAGUUUUCUGAUUACAGAAACUCCUCUCACAGGUUAUGUUUGGAAAGGCUGUUCUCCAUUCCACUUAUAAAUUGAAAGUGAUAAGCUACUGUCUUGUGAUCUUGCAGGGCCAGUGGUUGACUCAUCUCUGAAAGGUAACUUCGUUCAUAUCUAUGUAUUUUCAAACCUGGAAGCUUGUAAAUUGGAAGUUUCAGUAUUAGCUUUAUUAUUCUUUCUUGGUGAGGAAUAGAAAUGGCAGCAAAAAGAAAGCCAACAAUCUGAAAACUCCAGUCUCCUCUAACACUGGCUUUGUUUUAAAUCAAGAUGGGAAGAGAUACAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-131.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -144.72

Frequency: 0.0000

Diversity: 166.94

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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