Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-HSP90AA1-15:4
Sequence Length
1248 nt
GC Content
0.4728
CUUUGACAUCAGCACAGCUUUGAAAGGGGGAUGGGAGAGCGAGCAGAAAGCAGAAAAACCAGCUUUGAACUAUGCAUGCAAGGCCUCUUUCAAGCCUCAAAUUCUGUACUUAGCAAAAGUAUUCUAAAGUUCACCUGCAAAAAAUAAAAGAACAAGAAGAAUGAGAACACUACUAAUGAGAAAGAUAAGGACGGCUUGAGCCAGGGCAGUUCAGGAAACACUUGAGGAGCAGAGGCAGCAGGGCGCUGGACCAGACAGAGGACGGGAAUGUCCAAGAAGUGGUCUCUGUGUGCGGUAAUGAGCCGAGAUUACAGCUGGCAGCUGGAAACUAAACCCCAUGGGUGCCACCCAGAGAGAGCUGAGACUGACCAUGGAGUAACGGCCAAGGUCAUGUGUGUAGCCCCGGGCCAUGGAGAGGGGGUACCCUGGAGGGGCUGGGCUGGCUGGCUGGGCUCAGGCUGUCUGACAGGCAACGGGCUCCCCAGUGUUCUGAAGAGGGAGUGGCCCUGGUGGUAACUCUCUGUGGCUUAGAGGGGCUGAAGCUAGAACACCGCUGUGACUCCGGGCCCGCUGGUUCCCUGAGGGCAAGGGCCACCUUGGGUCAUCGCUCUGAACACCUUCCCCUUGCUCUGAGAAGCACAGAUGGCCAGUGUGAACUGCCUCAGCAAUCCAGGGACUGUGUCCUCUCAUUAAGAUAUCAUGGCAAAUCACGAGAAGACACAAAAAUCAAAACAUGCAAGAGAAGAAAAGACUAAUGAAAGCAGAGAUUCCCUGCGCGGCUCUUUCUAAGCUGACUAGAAGAGCAGCAGGCACUCCGAUAACUUCCGCACAGUCCAUUUUUAUUAUUCUUCAACUAACAGGAGCUCCAUUUCAAGAUAACCAAGUAUCUCUGGUUGGUAAGAAAAAUCACUGCUUUCAGAAGAACGUUAGAGUAAAUGUUGAAUUCGCUAGUGAAACUGAAACUACUGACUCAGGACUCAUAUCUGGGAAAACAUACUGUUACAAUUCAACAAGAAGAAGACAACCAACUUAAAAAAAGACAUCUCAUCAAAGAAGAGAGACAAAUGGCUAACAGGCAUAUGAAAAGAUGCUUAAAAUUUCCAGUCAUUGGGGAAAGGCCAAUGGAAACCACAGUGAGACACCAUUACACACCCACAAGAAUUAAGCUAUAAUCGAAAAGACAAUAAUAGAUAUUGGCAAGAAUGUGGCCACAUCAGAGCCCUCAUACAUUGUUGGUGGAAAUGUAAA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-356.62 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -376.9
Frequency: 0.0000
Diversity: 306.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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