Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-IRX2-5:1
Sequence Length
383 nt
GC Content
0.7389
GCUGCGGUGGUGGAGGUGCAGGAAGGUGAGGGCCAUGGGGCGCGGCGUGGGGAGCGCCAACGCCCAGGAAGGAGCGCAUGUUGAGCAGGGAGCCCUGUGCGAGGAAUGCGCUGUUGGUCCAGUUGGAGAACUUGCCGAUGUGGCAGGUGUACAGUCCGUGGCUAGGCAGGAAGGCGGGGUGUUGCAGCGGCGCCCCGGCGGAGGGCCCGUGCGCGCCGGGGUGGCCCGCGGGUGGUGGUGGCGAAGCCUUGGGCGCACCGUCGGGGCUCGUGGCUGUCUCCGCCAGCGACCAGAUCUUGGGCUUGCCGUGCGGCGCACCCUGCAGCCGCGCCUGCCCCGCCGCCCAGCUCCGCGGCCCCCGGUCGGCCCGACGAGGCGGCGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-211 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -217.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 91.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.((((((.((..((..((((.((((....(((((((((((((((.(((((.((((((((((...(((((((.(((.(((((....))))).)))...))))))).((((((...........((((((...((.((.((........)))).))..))))))..(((((((....(((((.((((((((((((.(.(((((.((.(((((...(.(((....))).)...)))))..))..))))).).))))))))))..)).))))))))))))...)))))).)))))))).....))..))))).)))))).))))))))))))))))).)))).)))))).)))((..((((...))))..))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
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