Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-IRX3-80:17
Sequence Length
1092 nt
GC Content
0.5577
UGGCUGCAGCGGCGGCGGGGACCGUGGGGCCGAGGUGGCUGCCAGCCGGCCAAUGUCUAAGCGAGGCGGAGCGGCCCAGGCGGCCCGAGCCUGGGGGAGCGCGCAGCCGGCCAGUGGCGGCCUCGCCGGCGGCCUCUUCCCGGGCUCGCAGUAGGCCCGAGUCGUCGCCGGGAGCUCCUGGGAGCAGCGUCCCCGCCCUGCUCCCCUCGCUCCCGCCUCUUGCGGCCCCACGGCCCCUCAGCGCCCGCCCCCGGCUCCGCCCGCCGCAGCCGCAGCCCCUGGCGCUAACGGUCGGUAACGGCCCGCGCGCGCCGCCCGCCGGGGGCUCGCGCCAGCCACGAGGGAGCGUCCGCGGCCCGCGCGCCCGCGCGGCGGAGGAGAGCCGGUCGAGCCUCUCCGGGUGUCGGGGUUCGGGGCGGGCGCGCGUGGGCGUGGCUCCUCUGUCCACGCCUGUUCCCUUCGUCGCCGCGGCUCUCGUCCGGGACACGGCUUUCCGGAGUAGAGCCCUUGGAGAGGUGUUAAGUGUGAUGCUUCCAUAAUACAUUUGGAUGCUGUCAGCUAAGUUCACUUCUGAACUAAGGGGUUCCUCCAAAUGUUGGCUGAAAUUCAUCCCAAGGCUGGUCUGCAAAGAGUCUGCAAUUCAUAAUGGAGCUACUGUACUGGCUAUUGGAAGGAGGAGAUUCUGAAGAUAAGGAGAGGUAAAACCUGUUUAGAAAUUAAAAAUGAGUUACGAUUUAAAGAAAAUUCAGAUGACUCAUUGUGAGUGCUAGUUCUCUUGUAGGAUGCCACUGGAAAUGUUGAAAUGAAAAAUAGAUUCAGCCGUUGGUCUUUGAAAUUUCCUGUGAUGUGUUUCAAUCUAGAUGCAAAGAACAUGGAAAAAUCAAAGUGCUCGAGUGGUUUAAAUAUGUUUUGGGUAUUCCUGUUUAUAGACUAUAAUACUUUUCCAAUUAAAAUCCUCAGUUGUCACGCAGAAGAAGGUUAAGCUGUAUUUGAUUGCCAGUUUUACUGAAAAUGCUUAGUAUUUUACAGUAUCACCAAAUAUAUUUUGUUUAGCCAAGGUAUAGGAAAAAUAAAAUAAAUUGUAUAGGUUGA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-451.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -474.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 277.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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