Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-IRX3-80:34
Sequence Length
659 nt
GC Content
0.3627
CCCGCGCGCCCGCGCGGCGGAGGAGAGGUGUUAAGUGUGAUGCUUCCAUAAUACAUUUGGAUGCUGUCAGCUAAGUUCACUUCUGAACUAAGGGGUUCCUCCAAAUGUUGGCUGAAAUUCAUCCCAAGGCUGGUCUGCAAAGUCUGCAAUUCAUAAUGGAGCUACUGUACUGGCUAUUGGAAGGAGGAGAUUCUGAAGAUAAGGAGGUAAAACCUGUUUAGAAAUUAAAAAUGAGUUACGAUUUAAAGAAAAUUCAGAUGACUCAUUGUGAGUGCUAGUUCUCUUGUAGGAUGCCACUGGAAAUGUUGAAAUGAAAAAUAUUCAGCCGUUGGUCUUUGAAAUUUCCUGUGAUGUGUUUCAAUCUAGAUGCAAAGAACAUGGAAAAAUCAAAGUGCUCGAGUGGUUUAAAUAUGUUUUGGGUAUUCCUGUUUAUAGACUAUAAUACUUUUCCAAUUAAAAUCCUCAGUUGUCACGCAGAAGAAGGUUAAGCUGUAUUUGAUUGCCAGUUUUACUGAAAAUGCUUAGUAUUUUACAGUAUCACCAAAUAUAUUUUGUUUAGCCAAGGUAUAGGAAAAAUAAAAUAAAUUGUAUAGGUUGACUUUUUUCUAAAAUGUCUUUAUUGGAUUGAAUGAAUGUUUAUACCUGAAAAAAAAAGGUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-169.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -181.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 139.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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