Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-IRX3-80:36

Sequence Length

921 nt

GC Content

0.4701

GGAGGAGAGGUGAGCCCCCGCCCGGGCCAGGCCCUCUGGCCGCGCCGUCCGCCCCUCUAGUCGUGUCCCCUCGUGGGCCGAACGGACGCGGCGGUGCCCCGCGCCCGACCAGACGUCCCGUGGGCUAGGGCCUGGGCCUCGGGCCGCGUCGGCGCCGGUCGAGCCUCUCCGGGUGUCGGGGUUCGGGGCGGGCGCGCGUGGGCGUGGCUCCUCUGUCCACGCCUGUUCCCUUCGUCGCCGCGGCUCUCGUCCGGGACACGGCUUUCCGGAGUAGAGCCCUUGGAGGUGUUAAGUGUGAUGCUUCCAUAAUACAUUUGGAUGCUGUCAGCUAAGUUCACUUCUGAACUAAGGGGUUCCUCCAAAUGUUGGCUGAAAUUCAUCCCAAGGCUGGUCUGCAAAGUCUGCAAUUCAUAAUGGAGCUACUGUACUGGCUAUUGGAAGGAGGAGAUUCUGAAGAUAAGGAGGUAAAACCUGUUUAGAAAUUAAAAAUGAGUUACGAUUUAAAGAAAAUUCAGAUGACUCAUUGUGAGUGCUAGUUCUCUUGUAGGAUGCCACUGGAAAUGUUGAAAUGAAAAAUAUUCAGCCGUUGGUCUUUGAAAUUUCCUGUGAUGUGUUUCAAUCUAGAUGCAAAGAACAUGGAAAAAUCAAAGUGCUCGAGUGGUUUAAAUAUGUUUUGGGUAUUCCUGUUUAUAGACUAUAAUACUUUUCCAAUUAAAAUCCUCAGUUGUCACGCAGAAGAAGGUUAAGCUGUAUUUGAUUGCCAGUUUUACUGAAAAUGCUUAGUAUUUUACAGUAUCACCAAAUAUAUUUUGUUUAGCCAAGGUAUAGGAAAAAUAAAAUAAAUUGUAUAGGUUGACUUUUUUCUAAAAUGUCUUUAUUGGAUUGAAUGAAUGUUUAUACCUGAAAAAAAAAGGUUCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-315.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -331.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 200.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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