Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-IRX3-80:38
Sequence Length
850 nt
GC Content
0.4847
GGAGGAGAGGUGAGCCCCCGCCCGGGCCAGGCCCUCUGGCCGCGCCGUCCGCCCCUCUAGUCGUGUCCCCUCGUGGGCCGAACGGACGCGGCGGUGCCCCGCGCCCGACCAGACGUCCCGUGGGCUAGGGCCUGGGCCUCGGGCCGCGUCGGCGCCGGUCGAGCCUCUCCGGGUGUCGGGGUUCGGGGCGGGCGCGCGUGGGCGUGGCUCCUCUGUCCACGCCUGUUCCCUUCGUCGCCGCGGCUCUCGUCCGGGACACGGCUUUCCGGAGUAGAGCCCUUGGAGGUGUUAAGUGUGAUGCUUCCAUAAUACAUUUGGAUGCUGUCAGCUAAGUUCACUUCUGAACUAAGGGGUUCCUCCAAAUGUUGGCUGAAAUUCAUCCCAAGGCUGGUCUGCAAAGUCUGCAAUUCAUAAUGGAGCUACUGUACUGGCUAUUGGAAGGAGGAGAUUCUGAAGAUAAGGAGUUCUCUUGUAGGAUGCCACUGGAAAUGUUGAAAUGAAAAAUAUUCAGCCGUUGGUCUUUGAAAUUUCCUGUGAUGUGUUUCAAUCUAGAUGCAAAGAACAUGGAAAAAUCAAAGUGCUCGAGUGGUUUAAAUAUGUUUUGGGUAUUCCUGUUUAUAGACUAUAAUACUUUUCCAAUUAAAAUCCUCAGUUGUCACGCAGAAGAAGGUUAAGCUGUAUUUGAUUGCCAGUUUUACUGAAAAUGCUUAGUAUUUUACAGUAUCACCAAAUAUAUUUUGUUUAGCCAAGGUAUAGGAAAAAUAAAAUAAAUUGUAUAGGUUGACUUUUUUCUAAAAUGUCUUUAUUGGAUUGAAUGAAUGUUUAUACCUGAAAAAAAAAGGUUCAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-300.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -315.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 177.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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