Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-IRX3-80:61
Sequence Length
1094 nt
GC Content
0.4150
CGCACCACGACACCUGGCUAAUUUUUUGUAUUUUUGGUAGAGAGAGGGUUUCACCAUGUUGCCCAGGCUGGUCUUGAGCUCCUGAGCUCAAAGUAUUUGCUUGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGGUUACAGGCGUGAGCCACCGUGCCAGGCCUUUAAUUCUUAAUUGCCGCCAGGAUUGAUUGGUAAGGCUGUAGAAGAGUUGCUGUCCAUUCCAAGUCUUCCCAUCUGAAGCAACCACCAUGCCACAGCCUUAUUCUGUCCCAUGGCUGUUUUGUGCAUCUCCAAGUGUACCAGUGUGAGGCCCUCAAACACACCCAUGCCCUCUGAUGAAAUAAUGUUGGUCGUGAUAACCACAGGGAUGUCACAGCCGCCGUUCCACACUCUAACUAAUUCUUAUUUUGUUCCAACAACAACAAUUUGAAAUGGGAAGAACCACCCCAUUUUAGACAUUUCAAAACGAGGGCUUGGAUAGAUUAUGUACCUUGUCCAAGGUCACACAACCAAAUGGCAAGGUACGGACUCAACCUAGUUCCAUCUGCCUCCAGUCCAAAACCCAGAGCUCUCAACUGCCACCCUCAUUGUCUCUACUAGAUACGGGCUUCCCUGCGGUAACUGUUGAGGCUGGAAAACACAGGCCUGAGAGAACUUUUAAAUAUGAAAUGAUAACUCUUUGCCUACUGAGAUUCUUAUUUUUAAAAACCCAGAGGAAGAUCAUAUUUAUAUAUUUAUUCAACAUUCACGUAUGAUAUUUAGAUUUACAAAAUGCUUUAUAGUGUAACAGAAUGGGCAGAAAUUUUUACUCGGGCUUAUAAUUGUCUUUUCUUUCAUAUUCAUUUAUUCCUUUGAUUUAUAUAAUGUGUUCUCUGCUUGGUCUUCUGAGAUUACGUACAAUGGUAACAAAUCGAAAAUAAUAUUAAUAAAAGAUUAUUUUGUAUCACUCACAGGGAAAACUGACUGGGGCCAUGCGCCUCUCUGUUCUUUAGAAACGUUAUGCGAGAGAACAUAAUAUUGUCCCCAGAAUACUGUCUGUAAUGCCGGCUAUGCUUAUUCGUGGUGCUUUAAAAAUAAAUUUAACUCCUGUUCUUCAUUU

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-288 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -307.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 264.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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