Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-IRX3-80:7

Sequence Length

1442 nt

GC Content

0.5680

GACAGACAGGGGCGCUGGUGAACCAGGACAGAAGAUGGCACAGGUUUGGGCACGCCGCGGAAGCUCGGGAUAUCGGGAACUUCGCAUAAUGGGGCCACACGCAAGCCGAAGCAUAACUAUAUACAAAGUUUCUCGCAUUGACUUUGACGGGCGAGAUGUACUUUAUUUCGCGAUCUCACACUAACCCAGCGCCGCACCGGCACCCGCUCGGUGCUGCGCUCUCGUGCACGCGCGUUGGCUCCUCCCCUCCGUCUGCUCCCCUCCCCCAGACACCGCCCACCAAGAGGCCUGAGCGGUUCAGACUACAUUCUCCGAGAGCCCCUGGGUCCGCCCAGCCCAGUGCCUGACACCUCCUUCACCUAUGAUUGGGCGCUGGCCUCCCUGGGCUCCGCCCCCUGGUGACGUAACCCCGCUUUCCUCCGAGUCUCGGCGCCAGAGGGGCGGGGAGGGGCGGGGUCUCGAUCGCGCUAUUGUCAUGGAGACGGGAAGCUGGCUGCAGCGGCGGCGGGGACCGUGGGGCCGAGGUGGCUGCCAGCCGGCCAAUGUCUAAGCGAGGCGGAGCGGCCCAGGCGGCCCGAGCCUGGGGGAGCGCGCAGCCGGCCAGUGGCGGCCUCGCCGGCGGCCUCUUCCCGGGCUCGCAGUAGGCCCGAGUCGUCGCCGGGAGCUCCUGGGAGCAGCGUCCCCGCCCUGCUCCCCUCGCUCCCGCCUCUUGCGGCCCCACGGCCCCUCAGCGCCCGCCCCCGGCUCCGCCCGCCGCAGCCGCAGCCCCUGGCGCUAACGGUCGGUAACGGCCCGCGCGCGCCGCCCGCCGGGGGCUCGCGCCAGCCACGAGGGAGCGUCCGCGGCCCGCGCGCCCGCGCGGCGGAGGAGAGGUGUUAAGUGUGAUGCUUCCAUAAUACAUUUGGAUGCUGUCAGCUAAGUUCACUUCUGAACUAAGGGGUUCCUCCAAAUGUUGGCUGAAAUUCAUCCCAAGGCUGGUCUGCAAAGUCUGCAAUUCAUAAUGGAGCUACUGUACUGGCUAUUGGAAGGAGGAGAUUCUGAAGAUAAGGAGGUAAAACCUGUUUAGAAAUUAAAAAUGAGUUACGAUUUAAAGAAAAUUCAGAUGACUCAUUGUGAGUGCUAGUUCUCUUGUAGGAUGCCACUGGAAAUGUUGAAAUGAAAAAUAUUCAGCCGUUGGUCUUUGAAAUUUCCUGUGAUGUGUUUCAAUCUAGAUGCAAAGAACAUGGAAAAAUCAAAGUGCUCGAGUGGUUUAAAUAUGUUUUGGGUAUUCCUGUUUAUAGACUAUAAUACUUUUCCAAUUAAAAUCCUCAGUUGUCACGCAGAAGAAGGUUAAGCUGUAUUUGAUUGCCAGUUUUACUGAAAAUGCUUAGUAUUUUACAGUAUCACCAAAUAUAUUUUGUUUAGCCAAGGUAUAGGAAAAAUAAAAUAAAUUGUAUAGGUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-567.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -594.56

Frequency: 0.0000

Diversity: 407.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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