Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-IRX3-80:9

Sequence Length

1057 nt

GC Content

0.5184

GGGGUCUCGAUCGCGCUAUUGUCAUGGAGACGGGAAGCUGGCUGCAGCGGCGGCGGGGACCGUGGGGCCGAGGUGGCUGCCAGCCGGCCAAUGUCUAAGCGAGGCGGAGCGGCCCAGGCGGCCCGAGCCUGGGGGAGCGCGCAGCCGGCCAGUGGCGGCCUCGCCGGCGGCCUCUUCCCGGGCUCGCAGUAGGCCCGAGUCGUCGCCGGGAGCUCCUGGGAGCAGCGUCCCCGCCCUGCUCCCCUCGCUCCCGCCUCUUGCGGCCCCACGGCCCCUCAGCGCCCGCCCCCGGCUCCGCCCGCCGCAGCCGCAGCCCCUGGCGCUAACGGUCGGUAACGGCCCGCGCGCGCCGCCCGCCGGGGGCUCGCGCCAGCCACGAGGGAGCGUCCGCGGCCCGCGCGCCCGCGCGGCGGAGGAGAGGUGUUAAGUGUGAUGCUUCCAUAAUACAUUUGGAUGCUGUCAGCUAAGUUCACUUCUGAACUAAGGGGUUCCUCCAAAUGUUGGCUGAAAUUCAUCCCAAGGCUGGUCUGCAAAGUCUGCAAUUCAUAAUGGAGCUACUGUACUGGCUAUUGGAAGGAGGAGAUUCUGAAGAUAAGGAGGUAAAACCUGUUUAGAAAUUAAAAAUGAGUUACGAUUUAAAGAAAAUUCAGAUGACUCAUUGUGAGUGCUAGUUCUCUUGUAGGAUGCCACUGGAAAUGUUGAAAUGAAAAAUAUUCAGCCGUUGGUCUUUGAAAUUUCCUGUGAUGUGUUUCAAUCUAGAUGCAAAGAACAUGGAAAAAUCAAAGUGCUCGAGUGGUUUAAAUAUGUUUUGGGUAUUCCUGUUUAUAGACUAUAAUACUUUUCCAAUUAAAAUCCUCAGUUGUCACGCAGAAGAAGGUUAAGCUGUAUUUGAUUGCCAGUUUUACUGAAAAUGCUUAGUAUUUUACAGUAUCACCAAAUAUAUUUUGUUUAGCCAAGGUAUAGGAAAAAUAAAAUAAAUUGUAUAGGUUGACUUUUUUCUAAAAUGUCUUUAUUGGAUUGAAUGAAUGUUUAUACCUGAAAAAAAAAGGUUCAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-397.6 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -418.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 244.85

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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