Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-JMJD7-PLA2G4B-2:12

Sequence Length

959 nt

GC Content

0.5714

GUCUCGGGUGGGGUGCGGCUUCCUGCGUCUGAGAGACGCUUCCUCUCCUGCUGUCCUCUCCCUGCCAGGCCCCUUCUGCAGCGGCUGGCUUCCAGACACCCUGCGUCCCUCCCUUGCUCGCAGCAGUUGCUGUGGCGGUCCUCCCGUGCACCCCCCCUUCUGCCCUCACUGCCCCUGGGGGUCCUCAUCACGGACCCCCUAACUCGGCAUCCUGGACACCACCACCCCGCACCUUUCCACAGUGCAGCUCUGCUCGUGCCUGUGAAGCCUCCCACAGCCUGGGAAGGAAAAUCCAGACUUGCCAGACCUUGCCUCAGCCAGGCCUUGGAAGCCUGCCAGCUUACCUAACCAGGCUAGUCUGCCCCCCUCACUCUGGGUGCUCUCCAUGGGCCACUCACCAUUUCCUGAGCAGGACCAGAGCUCUCCUGCCCCAAGGCUGGGCUUCAGCUGCUCUUUCAGCUUUGAACGUCCUUUCCCAUUCUCCAUCAUCCACAUUCACCUAUCCUGCCUGCCCCAGUUAAAAUCCUGUUUCUUCUAGGAAGUCCCUCAUCCCACCCGCUUACCCCAGGGAGACUGAGCUUGUUCCUUCUCCUAGUAAGACCCUCAGCCCAUGGAGUCCUGUGUGAUGUUGUGAGCGUGGGAGGACAGACUGAACUGCUCGGCCCGUGGAGUCCUGUGUGAUGUUGUGAGCGGGGAGGACAGACUGAACUGCGUGGUGCUUCGCACAUAGACCUCAACAGGGAUUGGCAUUUUGAAGCUGUUGGCGGGGGCUGUGGACUGCUUUUCUUCCUUUCUAGCUCAACGGCAGCUAAAGCCACUGCAUACAAUGCAAGGACUGGCUCCUGUUUGGCCACGACUGAUUGCAGCCCCUGGUGAAAUGAGAACCCUGUGGGUCGGAACAAAGUUUGGAUUAUUUAUGUUGCAAGUAACUAAAAUCUCAAGUGAAACUGGUUUAAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-323.5 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -342.43

Frequency: 0.0000

Diversity: 198.83

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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