Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-KHDRBS3-4:11

Sequence Length

691 nt

GC Content

0.5398

ACUCUCGGGGCGCGCGCGCCCAGAGCGCUGGGGUUUGGGAGGUAAUUUGGACCUCCGCCUGCCUCCCUUCCCUCGCUGCCUCCCGGAAUUUGACCAAUCCCGUGAGGAGGAGCCGUGGGCGGGGCGGGCUCGGCUCCCGGAGUGGCGUGAAAAAUUUCCCGAGGCAGAGCGAAAAGUCUUCAUGCGUUACUGAGCAUGUCCGGUGCCCGAAGGGGCGCUUUGGACGCCAGUGAAGCGAGGAGAGGCGGAGAAGGAACCGAGCGGGCAGUUGAGGGAAAUCUCGGAGGAGGUUACCUGCGAUCAAACUGGGGCUGCGUAGUGUUAGGGUCAGGCAGCUUUGAAGUGGAAUCCGGAUCCGCCACUCUCGCUGCGUGAUAUUGGGCAUGCCAUCAAAGCGCUCUCAACCGAACGUCUCGGGUAAAAUGGGAUUAGUGAAGUCUACCAAGGUAGUUGUGAGGAUCAAAAGAGAUAACGCGGAAAACGCCUCACCUGGCACGUUAUAGAUCCUAAAUGCCUAGCUAUUAUUAUGGAGCCCACAACCUCCAUAUUUUACAACUGGGAACACGGGACUCAAAGAGAUUAAAAAACUAAAUGACUCACUCAAGGUCAGGUAGUGGUGGAGACCCAGGCUUCAAGUUCAAUACUCUUUGUCCUACAAAGCCUUCCCUUAAGCAGGGGUAAUAAAACAUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-243.9 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -256.87

Frequency: 0.0000

Diversity: 243.99

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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