Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-KHDRBS3-4:12
Sequence Length
5188 nt
GC Content
0.4622
ACUCUCGGGGCGCGCGCGCCCAGAGCGCUGGGGUUUGGGAGGUAAUUUGGACCUCCGCCUGCCUCCCUUCCCUCGCUGCCUCCCGGAAUUUGACCAAUCCCGUGAGGAGGAGCCGUGGGCGGGGCGGGCUCGGCUCCCGGAGUGGCGUGAAAAAUUUCCCGAGGCAGAGCGAAAAGUCUUCAUGCGUUACUGAGCAUGUCCGGUGCCCGAAGGGGCGCUUUGGACGCCAGUGAAGCGAGGAGAGGCGGAGAAGGAACCGAGCGGGCAGUUGAGGGAAAUCUCGGAGGAGGUUACCUGCGAUCAAACUGGGGCUGCGUAGUGUUAGGGUCAGGCAGCUUUGAAGUGGAAUCCGGAUCCGCCACUCUCGCUGCGUGAUAUUGGGCAUGCCAUCAAAGCGCUCUCAACCGAACGUCUCGGGUAAAAUGGGAUUAGUGAAGUCUACCAAGGUAGUUGUGAGGAUCAAAAGAGAUAACGCGGAAAACGCCUCACCUGGCACGUUAUAGAUCCUAAAUGCCUAGCUAUUAUUAUGGAGCCCACAACCUCCAUAUUUUACAACUGGGAACACGGGACUCAAAGAGAUUAAAAAACUAAAUGACUCACUCAAGGUCAGGUAGUGGUGGAGACCCAGGCUUCAAGUUCAAUACUCUUUGUCCUACAAAGCCUUCCCUUAAGCAGGGGUAAUAAAACAUUUCAGAAAAACCACCUUAAAGAGCAUCGCUUGUGAUCUGUGGAUCACUUGGUAGUCCCCACCUCCCUCCCAUCCCCGCAAAGGUUUAGAGCUGGACAUAAGGGCCUUGGUGCAACUUUUGGAGGGCAGUUGUUCAGCUUCUGAAUUUGCAUCUGAACGAGCAAUAAGGUGGGGUGCUUUCCUCAAUUCCCUUGGGGCCCCUACAUUUUGGUUAAGGUGUAAACAGCAAGGAGCUCCAGGUCCUCCACGUCUCUAACUAGCUGAAGAAAGAUUAACUCAAUUAACCAGCAUUUACCCAGCAUCCAUCAAGUAGUAAGGUUUUCCCAGCAGGCAAGGAGCCUGUGACCUCAGGGCUGUGCAGGCAGGCACCUUGGGAUUCAGACACACUUAGACUUCCAGCCCAUUCCUCUAAUUUAGCUCUUAAUCACUUACUGCCAGGCAGUAUUUCUUGAAUGUUGUAGUACUAUGUAAUUUUAGCUAUGCUGUUAACUUUUUAAAAAAGGAUGUGUCUGUCUCCCUGUCUUGUAGCCCCAAACGUAUACUUGAUCUUGGUAAAGGAUGUCACCCAGUAUCUUAAAUAAGCCCUGAAGUUUCCCAUGUCGAAUUUUCUGGGAAGUUAAGAAUUUCCAAUAAAUCUUGGACUACUCUAAAAUGCACCAGAAAUUACGUGGUCACACUCGUGCAGUGAAAGAAGGCUUUGGCAGUAGCAUAAGACAUUAAGCAGAAGUAGGAAAUGCAGUGAGGAAGAAGUUGUAAUGUUUUCAACAGCUGCCACUAUGGAUCUAGGAUGAGAGCUUUCCACAUGUUGUUAAGAAUGAGAGACAGAUUACUCCAAGGUAGUAACUCCGGAACAAUGAAGGAGGAAGAAUGAAUGAGUUGCGCCCUGAAGAUGGUGGGCUCUCCUUUAUGCAUGAUCAUCACGAUCUCUCUGCAAUGUCUGUCCUGUGACCUCGUGAGGUGUGCAGCGUCAUGCCAGACAUCUGUGUUUGGAUGGCCCUCUGGCUCCUCCACAAUUACUGCAGAGUCAGAAGUGGAAUUUCCGCCUGAUGUUUUAUGUCAAAAUCAGUAUGAAAGACUGCAGCAUGCUGAGUGAGCUUUCCGUUCUCGCUGAGAUGCAAUGCAGGGUCCACCCUCUGCAGGCCACAAUUUUGCCUGGAGGCAAAGCAUUCAGUCUUUCCAUUGGCCUGACAAUUUGAGCCAAGCUUUGAGGCCAACAGACAAAAUGCACUAGCAACUGGAGAGGGCCUGCCUGGUGGCCCUCCCUGUGAGAAGGUAUUCUUCCUGCUCCAUUGACAUCAGGCUUAUUAGCCAUGUUUCUGGAUUUGGUCCAUUUCAUCAUAAAGAGAACAUGGAGCAGGGCUGCAGCUGAUCUUCAAAGGGCAUGAACACAAGCCAGAGAGAAGCCGUUAUUGUUGUAAGCCCUGAAGAUUUGGGGGAUAUUAUUGCAACACAACUCAGCCCAAGCUGACUAAUACAACAAGUUUCUAUGUAUACAUGGAAAUGUAUGUAAUCUUAGCCUCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAGUAUCUGAAAAUCCCAGGAUACUCGGGGCUCAUGGUGCGUAGUCAAUGAAAUGAUUAGCUCUCUUUCUUCAUCCUUCCCUCUCCAAUCUUUUCUUUUCAUUCUCCUUCAUCUCAUUCUCCUUCUCUCUGUGAUUUACAAAGCUGGUCAUGGAAAAAAAAACAUAGGAGUCAGAAGGCUUCGAUUCUAGGUUCAUAUGUAUGAGAUUUUUUGGAAAAAACUCAUACUCUCAAGGAGUCUCAGUUUCCUCAUCUUCAAGUGGGGAUAAUAACACCCUCUUUACCUAUUCUGCUGGGUUCUUUUGUAGAUCACAUGAAAGAGAGGUUAUGGAAAUCCUUUAUAUAUGUUUUGAAAAUUCUAUCCAGUUGCUGUGGCCUGAAUGUUUGUGUUCUUCAAAAUUUAUAUGUUGAAACCUAAUCACUGAUGUGAUGGUGUUUGAAGGUAAGGCUGUUAGAAGGUGAUUGGCACAAACCCCUCAUAAGAGAAGCCCCAAAGAGAGCUAGCUUGCCUGUUUCACCAUGUGAGGACAUGGUGAGAAGAAGCCAUGUAAGAAUCAGGAAACAGGUCCUCACCAGGCAUGGAAUAUGUCAGCACCUUGAUCUCGGACUUACCAGCCUCCAAACUAGUGACAAAUAAAUUACUAUUCACUAGCUGCCCAAUUAAUGGUAUUUUAUUAUGAUAGACUGAACUGACUAGGACACUAGUUAUAUGAUGAAAAUACCCUACUACUAUUACUACUGCUAGUACUUCCUGUAUUUGCUCAUAUUUUUGGAGGUCUUAUUAUGUUCCAAGUAUGGUUCUAAGUGCUUUUCAUCAGUAACUCUUGUAAGAGCCUAUUUUUAAUUCAGCAAAGGCAACAAAAUACUUUCCCUGGUUUAGUGAGGAGUAUUAACUAAUUGGGGGUAUAAACAUAACAUGGUUUCGUUUUUUCAAUAGUUGCUACUACUCUUGUUCUCCAUAGCAACUUUGGUUUCAAUUCCAUAACUUUCCUGUUGUUUCUGGUCAAAGGAACAGUUGCCUCUAGUUCCUCUGUCUAUUUUAAUAUUUUGACCCUCUCCAUUCCUGUCAGGACAGGUGGAACUCGUGGCAUAGGAAGUUCAAGUGGCAGAGGGGGCCCAGUCUGUACUUGUCUCUACUCCCCCAGAGGAGGAAAGAAAGCAAGACAGAUGCUCCCUCACGUGGAUGUCCAUGGUAUAGUUGCUGUCCUCCCCUUGGGUGGCCAUGACUGCUAUUCCUGUCCACUGAGCUUCAUGAGGGUUGGGGUGCCUCCCUCACCAGGAUCAGACUCUGGGGUCCCCCAGCAGGAGGUACCGUGUGUAUUCCUCUGUGGGCCUUGUAUGGUCCUCCUUCCCCUUCUGCUGCGUGGGUCCCUAGGGAUGCCAUUGCUCCAAAAAUACUUGCUUUCCCAAGCUCUUCAACUCCAGGGCUCAAAAUCCCCUGGGGAUCCCCUUCCUGUAGGUCUUGAGAAUUGCAACUUGGGGGCAGUCCUGACCUGGUCAUCAUCCUCCUCACCACCUCACUGUGCCAUCUCCUCACCUCAUUCUCUAACCCCCAAAAGAUGACCACUGAUGACCAGUCUCCAGGUCAGUGGAGAACGUGUGUGGAGAAGUGCAGGAGGGGUGACAAAGCAUCCCCAAACCUUACAAGUUAUUUCCUUGAUUUUGGAGAAGAAAUCCACUGGGUAGUGCCCACCACCCCCUCACACAGCUCCAGCUAGAAGUAACGAUUUACUCCCUCCCUACACUCCUCUUAUUUUGUCUUUGAGGGUGGGGGUGCUGGUUUUGCUGAAAUGACUCUGCUCAGUCAGGCUUUUGAGAGUGGGAGGGCAGGGGGCAAAGGCAGAAAGGGAAGCAACCAGGCCUUUCUCUGCCUGUUCUCUGAACUCAGAGCAUGGGGUACUAAGGACCUGGGUUCUCUGCUGUGGGCCCAAAGAGGAAACAACAAGAUCCACUUGGUACCUAAUACCCUGUCACACAGAGGUACAACAUCUCCAGCUUGAGGUGGUGUCCUGUGAGUGAUAGCAGCUCCAGGAUGGUGCAUUUACCACUGAGGAAAAGUAGAAUGAGCCCCAGCGUUGGGGGAGCGAUCUGGGAACUGCCCUCCUAUUUGCUCCCACAAUAUCCUGCAGGUUCUAUGAUACAGGUAGUUAGAGCUACUCACUAGGCUGCCUGUCUUCCCCUCCACUGCAGGACAUGCCUGUAUUUUGUCCUCAUCUGUUGCUGUAGUUUGGAUGUGUUAUUUUUUUUUCCUUUGCAUGAGUUUCCAUGCAGAACACAUGUUGGAAUUUAACUGCCAAUGUAAUGGGUGUUGGGAGGUGGGGCCUUUAUCCAAACUUUAAUUAGGUCAUUAAGAUGAUUAGUGUCCUUCUCUGGAGAGACUGGAUUAGGUCUCUUGGGAAUGAAUUAGUUCUCGUGAAAGCUGGUUGUUAUAAAGUGAGGCUGCCUCUCGUGUUUGGUGUCUUUGUACGCUUCUGCUUCCCCUUCCUUCUGCUUUCCACCGGGAGUCAAAGCAGCACCAAGUCCUCACCAGAUGGGCUGCUGGAUCUUGUACUUCCCAGCCUGCAUGACUGUAAGCUCCAUAAACCUCUUUUUAUUCCUUGUAAAUUACCCGGUCUUAGGUAUUCAACAGAAUUGAAUUGCUUAGGUAGCAACACAAAACAGAUGAAGACAUCUGUAUUCCCAGGACCUGGGACAGCACCUGGUAUAUGCAACCUACUCAGCAAAUGUUCUCUAGAAUCUUUAGAGAUUUGGGAAUAUGAAGGAAAAAAAAA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1706.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1802.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 1168.4
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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