Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-KHDRBS3-4:16

Sequence Length

905 nt

GC Content

0.4696

AUGCGUUACUGAGCAUGUCCGGUGCCCGAAGGGGCGCUUUGGACGCCAGUGAAGCGAGGAGAGGCGGAGAAGGAACCGAGCGGGCAGUUGAGGGAAAUCUCGGAGGAGGUUACCUGCGAUCAAACUGGGGCUGCGUAGUGUUAGGGUCAGGCAGCUUUGAAGUGGAAUCCGGAUCCGCCACUCUCGCUGCGUGAUAUUGGGCAUGCCAUCAAAGCGCUCUCAACCGAACGUCUCGGGUAAAAUGGGAUUAGUGAAGUCUACCAAGGUAGUUGUGAGGAUCAAAAGAGAUAACGCGGAAAACGCCUCACCUGGCACGUUAUAGAUCCUAAAUGCCUAGCUAUUAUUAUGGAGCCCACAACCUCCAUAUUUUACAACUGGGAACACGGGACUCAAAGAGAUUAAAAAACUAAAUGACUCACUCAAGGUCAGGUAGUGGUGGAGACCCAGGCUUCAAGUUCAAUACUCUUUGUCCUACAAAGCCUUCCCUUAAGCAGGGGUAAUAAAACAUUUCAGAAAAACCACCUUAAAGAGCAUCGCUUGUGAUCUGUGGAUCACUUGGUAGUCCCCACCUCCCUCCCAUCCCCGCAAAGGUUUAGAGCUGGACAUAAGGGCCUUGGUGCAACUUUUGGAGGGCAGUUGUUCAGCUUCUGAAUUUGCAUCUGAACGAGCAAUAAGGAAUUUUCUGGGAAGUUAAGAAUUUCCAAUAAAUCUUGGACUACUCUAAAAUGCACCAGAAAUUACGUGGUCACACUCGUGCAGUGAAAGAAGGCUUUGGCAGUAGCAUAAGACAUUAAGCAGAAGUAGGAAAUGCAGUGAGGAAGAAGUUGUAAUGUUUUCAACAGCUGCCACUAUGGAUCUAGGAUGAGAGCUUUCCACAUGUUGUUAAGAAUGAGAGACAGAUUACU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-264 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -281.82

Frequency: 0.0000

Diversity: 289.44

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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