Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-MUC22-1:3

Sequence Length

505 nt

GC Content

0.5347

AAAGCACAUAUAAACCCACAGCCACUGCGGGUGGAAGGAGAAGGGCAGGGUGGAAAAAGUUUGAGAGAAGGAGGGAGGAAAAGGUGUCCUGGCUAGCACCAUGUGGAUUCUCUUGAGAUGAGAAGAAAAUGCCCCGCUACGUCCCCCUUCUGCUGCUCCUGCUUCUCCUGAGGUGUUCAGAACGGGGUGGAGGAGUUAAUUUUGGUGAGAAGGAUGCAAAAGUCCCCGGGACCUGGAGAGAUGGAGUCAGGGUCCCUGGAGAAGGAGCCUCUUGGGACUCAGACAGGGCCAGUCCCGAGCGAAGGUACGGAAUAGAACCGCAGGCACAAAUGGAUGAGAGGAGACACCUAUGAACAUGGAGCCAGAAUACCCCAAUUGCUGAAACACCAGUUCAGAGAGGAGUGAGCUUGAGAAAGAGUCAGGUUUAGUGUCCCACGGAAAGAGACCAGACCUGGAAAAGACAGAGUCAAAGCUGGGUGAGCAGGCCUUCGAAGGGCGUGGCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-163.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -171.63

Frequency: 0.0000

Diversity: 85.99

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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