Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-OPRD1-1:1

Sequence Length

1746 nt

GC Content

0.5132

CAAGCAAUUCUCCUGCCUUGGCCUCCCAAAGUACUGGGUUUACAGGUGUGAGCCACUGUGCCCAGCUCUCAUACCUCGUCUUGAUGCAGUAGAAGUAGUGGUUAAGCCUGGAAUCAGAUCUUGGUUUUCCCUCUCUGAGCCUCAGUUUCCUCAUCUGUAGAGUAGACUUCCUUCACGGGUGGUUGUGAGGAUUUAAUGUAUGUAUAGGGAUAAGGCCCAGAACGUAAGUAAACUCUAAGUACAUGGUAAGUGGCAGUCACUGCUUACAAGUGGAGCCAGGGUUCAGGGUCAGAGCUAGAGACCUACAGGGAAGAGUAGGUGAGCUGUCGGGGCUAGUGAUGGAGAGAGAGAAGAGACUGGAGAUCCAGCUUGGGGAUCCCCUUGCUUCCUGGCCCAGGAGCCACCAUGGAGAGUGAGAAGCUGCCAGAGAAGCAGGAGGAGGAUGGAGAGAAUGUGCUACCAUGGAAACUGGAGGAGGAGGGCGUUCCCAGGAGGAGGGAGUGAUGGAUAAUGUCAAGUGUCAUAAGAGAGGAUGCGAGUAGGGAGGGCAGGAGGGUGAUGGGAGCUCUCCAAUUUAGUUUUUUACAUGGCCCAGGCAGCCCCCAAGCCUGGAUCAAAUCCCAGCUCUCAAGCUAACUGGCUGUGUGACCUAGACAAGGGAUUUGCCUUCUCUGAGCUUCAGUUUCCUUCUAGAGUUGAGAUGUGGGAAUUGGUCCAUCUCUAAUACGAUCAUCAGCCUCACUUAAUAAGAGUCCUAGCUUUGCCGAAUUCUUGGCCACGUGCUAGCAGUGUGAUCUUAGGCAAGUCACUUCACCUCCACGAGAGCACUCUCUGAAAGCUAGAGAUAUGGUAAGCAAAGUGCCACCAAAGUGCCUGGCACAUAGUGGGGCCUCGAUACAGGCUUAUUCUCUGAUAAUUACACGUGUGCCAGAGGCAGCUGCUCUAAGGAGGCUUGCUGGGCUUGGAAUUAGAAAUGCUCCUCAAGGGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCGUGCCCAGCCCAACCCAUGGUUCUUAAUGCUGCAGGUGGGUCCGGAGAAAGGCUUUUCUCUUUUAACCAUCUCCUUGAAUUUCAGAAGGUGGGACAACAUGUGCUGGAAAGCAGUUCUUAAGAGGACAUCUUUUCCCAAGCUCCUUAGCCUUAGCUGUCCUCUCCUGCCCUCACCAGGACUGCCCUCUCAGGGACCCAAGAGGAAGGGACAGCCUGGAAAGGAAGAAGGUCCCGGGCCAUCUGCGUCAUGGGGAUGGAGUCCCUUGGCGUGUGCCGGUGCAAAUACACUCCUGUAACGGGGCUCAUCUAGAAUCUCCUCUCGGAAUGAGGAGACCGCAAAUGUGGUUUUGAAUCUUCAUUGUCCACUUCAUUGCUGUGGUGUUGGGCAGGUCUCUGUCCCUCUCUGGGCCUCUGCACGAUGGAGGGGUAGGAGUUGAUGGUUCUGAAGGCUCUGCCAUCCUGGAAAAGAACUGAGACACUUCCCUCAUGUUCCUGGGUCCCAGAAACAGACAUCUGUUGGUAAAAUCUACUGGGCAUUUGCCCAGAGACAGGGAAAAGAAUGCCUGGGGGUCUGUAAUAGGAGCUGCCCCAAUUAGGGGCAGGGAGGCGGGCAUGUAAAAAAGGAAGCUUAAAGCUUUGUUUUCAGGCUUUUUGCCUACCCCAGGCUCCAUCUUGGUACCAAGUACUCAACCUUCUGUUUUCUCAAUAAAGUGAGCCCUCUUCUCGGUGUCUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-643 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -673.67

Frequency: 0.0000

Diversity: 308.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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