Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-ORAOV1-1:2
Sequence Length
680 nt
GC Content
0.5779
AGCUCACCAGAGAGGCCAGAGGAGGCGGCAGGAAGGUGGGGUCUCUCCAGCCAGGGGCUUCCUGAAAGAGCUGCCUUCUGAGCAGGCCCCCCAGGCUAGGAAGAUGUGCACCUGCCGAGCUGGGCAGGAGAGGGUGGCCCAGUGGAGGACCCAGCAUGGGCAGAGGUUUGGAGGUGGCAGGUCCUGAGGGAAGCGGAAGGCAGCCAGGUUGUGACAGCCUGUGAGGACCUCUUGGCUCCCGGAGCCUUCUCUCUCCUGGAAUAGAGAUGACACCGUGCUGCCAUUGAACUCAACCCGAAAAAAUGAUCUGUUGCAAAGCUCACAGGAAAUAAUGGAGCAAUGUUACACGAUAAACUGUAAAGUGUGGUGAGCAUGUGAACAAGCGUCCAGGACCCAGCGAAGCCCCAGGCUACUGGGCUAGGCGUCAGAUGAGAAGAGGCAGAGGGCAACCUCCUGUAGGAUCUGAGGCCUUCAUGUGCUCAGCCCAUGGCUGUCGUCACGGUGACGUGUGCAUGCGAUGUAUCUGGGCCAUCCUUGUUCUUGAACGCGGGCAGUGAGUCCCACGGUGAUGUGGCAUGUCACGAGCUGAAGGAGGGGCACCUGCAUUCAGGCUUGCGAACCAGCGAGACAGCCUUUGGACCUUUCGGAGCCUCACUUUCCCACACUAAGAAUUGGAGUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-279.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -290.22
Frequency: 0.0000
Diversity: 101.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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