Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-ORAOV1-1:5

Sequence Length

2167 nt

GC Content

0.5773

AGAGGGCUGCAUGGGCCUCUAUGUGAGGACCUGAUUCAGGGAAGGUCUUUUGCCACAGUGAGCUGCAUCAGCCUGGACUGUCAGAGAAGCCCUGUUGGAGUGACUGCUGGGUUCGAGGGGGCAGCCAGGUUGUGACAGCCUGUGAGGACCUCUUGGCUCCCGGAGCCUUCUCUCUCCUGGAAUAGAGAUGACACCGUGCUGCCAUUGAACUCAACCCGAAAAAAUGAUCUGUUGCAAAGCUCACAGGAAAUAAUGGAGCAAUGUUACACGAUAAACUGUAAAGUGUGGUGAGCAUGUGAACAAGCGUCCAGGACCCAGCGAAGCCCCAGGCUACUGGGCUAGGCGUCAGAUGAGAAGAGGCAGAGGGCAACCUCCUGUAGGAUCUGAGGCCUUCAUGUGCUCAGCCCAUGGCUGUCGUCACGGUGACGUGUGCAUGCGAUGUAUCUGGGCCAUCCUUGUUCUUGAACGCGGGCAGUGAGUCCCACGGUGAUGUGGCAUGUCACGAGCUGAAGGAGGGGCACCUGCAUUCAGGCUUGCGAACCAGCGAGACAGCCUUUGGACCUUUCGGAGCCUCACUUUCCCACACUAAGAAUUGGAGUGGAAUUCCCAAGGUGCUGGAGGUUGAAAGGCAUUGAGAAUCUAAAACGCUUUGCAGACAGCAAGACCCUCUGUGUAAGUUAAGAAUGCUCACUCAGUCCCAGCAGGUACUCAGAGGGAUCCUUUUAUUUCUCCAGAACAUUCUGCAGGUGAGCUGGGGAAGCCCACUGGCCCUGGCCUCACCCCCGAGCCCGAGCCUUCAGCCUGGGAAUGGUCUGGCCUCUUCCUUGCUGGCUCUCCAGCCUGGCCUCGCAGGACCCUGGGCGGGACCCCAGGAACCCUCACCCGCUAUGUGCUUCCCCAAGAAGCGCUCCCUGUGGCCUAAUUUGAGAAAACAAUGGGCCUCAAUCCAUAUUAAUGACCCUAGAGGGACCCUUUGUCCUCGGUGCACAGGCUGUAAUCAGCGGGGCUCCGGGGGCUCUGGCCUAAUUUGGAGGGACAGGUUUUAUCAUCACCCUUGAUUCGGGUGACCCAAUCUGACAGGCCCACGACCCCCUGUAUGCGGGGUCCACGUCAGAGAUGGGCUUCCUCCCAGCGGCCCACCCCAGCGGGCUGGGGAGAGGGAAGGGGGAGGUGGUGGCCAUGGGGGAAGUUCGGGGUGAAGAAGGGGUCACAGCCAGACCCCCACUUGGAUGGGCCUGUGAUCGGGUUCUCGGGAGGAGCAGGAUAUUGAUUAGAUCAGUGAAUGGUGUGGAGGCAGCUCUCCCCAGGCACGUGCUCCCGACCACCCACCAGCAAGCGUCUGUUGCCUGCCGGUGCCAGGGCUGGGUGGGGACUCUGGGACAGGCCGGCUGCCUAGGAGGGGCCAGGCAGGAGCCAAGGGGCUGGCUCCAGGGACUGCCAGGAGGGCCCCAGGGAAGGGGAGCCGGGAAGCGUUUUGGCUGCCUCCGGCGUGAAGUCGUGGAAACGUGUUUGCAGGUUAGGGCCGUGGCAUCCUCGUUGCACCAUUUGAGCGCCUAUGGGGUGCCAGAUACAUGACAAAGGGCCACCUCAUUUAAUGCUUCCCUCAACCUUCCCAGGCCCCGAUCCCCAUGUUCUGGGUCAGGAGGCCCAUUCGAGGUCAAGGGGUGGGCGAAGGCUGACGAGACAAACCCAGGGACUAGCUCCUGAGUCCCAAAACCUGUCCUCACCCACCCAGGGGUCCCCUGCACGCUCUCCAGGGUGUGCGGUGCGUGGCUGCUGGGUUUGGGUGCAUUAGAGCCUGAGGCAAGGGCUUGAGUCUGAAUUCUCGCUACGGACCAAAUGUGUGCGUCCUCCCUAAAUACAUAUGUUGAAGCCUUAACUCCCAAUGUGAUGGCAUUAGGAGAGGGGACCUGUGGAAUGUAGUUGAGUCCUGAGGGUGCGGCCCCGUGAUGAAAUUAGUGGCCUGAUAAGAAGAGGCCCAGAGAACCGGCUCUGUCUCUGCUCUCUGUCGCACGAGGACCCCACAAGAAGACGGCCACCUGCAAACAGCCAUUGAAUCUGCCAGUGACUUGGUCGUGGAGUUCCAGCCUCCAGAACUGUGAGAAAUAAAUGUUUGCGAUUUAAACCGCACAGUCUGUGGUGUUGUGUUGGCAGUCUGAACUGACGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-894.2 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -929.81

Frequency: 0.0000

Diversity: 771.09

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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