Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-PAQR3-1:4

Sequence Length

2602 nt

GC Content

0.4865

AGUGCCCCGGGCGUCCCGCCGCCUCACUAAGCGCCUGGAGCGCGAGCCGGGGUAGAGGAAGAGAGCGAAAGAGGCUGGGCGGCCGGCCCCUCCAGGGAGUGGGCUAGACGUCUCAGGCCACAAACCCGCAGGACCGCAGCCCGUCGCGCCGCCGCCGCCCCGGCCGAACCCGCGCCGCCCGCCACUCGUGGCCGUUGGCGGGGGGGGGGGGGGGGCGCUGCUGCCAACCGCUCACUGAGGCCGGGCGACCCGCGCAGGCGCGCUGCCCGCGCCGCCGGAAGUGACGGUUCCGGCUCUUGUCACGUGGAGGGGGACCAAGGGAGGUGAUUGUGGGGGUUGGGGACUAGGGCAAAGUCGGGGGUCCCGGGUCCGGGGUUGCGCCGGGAGGGUACUGGCCAGGCCCGACUUCAAGCAGGGAGGUGGCCCGGGACUGGCUCCCGCGCUGGUCACGCACCGGGGUCCGUCAUCUCGACCGGGAGUCGCUGUGCCACUCUAGGGGCUUAAAAAUGCCGCCAACAACUUUACCCCUGCUGAGGAACUUCUCGCUUCGUUUCUUAGCCAGUUUUCCAGGCCUUCUCCCUUGAGAGUCUCCUUCCGCUCGCCCACCCUGAGCGUAGGAGGUGGGAGCAGGACGGAACUGGAGUGGAUUCCAGUAACUGGACUUCUAAACCGGCUCGGUGUCGUCGCGCUCUGUAGCGGACGCUUGUGCUGGGAAGCGUUUUGCAGUUUAUAAAUUACUUAGGAGUACUUUAAACAUCUCACGCCUGCUGUACCACAGCCAUGUGGGGGUAUUCAGAACAGGUAUUAAGGUCGUUUUGCAGACCAUUCAUCACUCUUGGCUAAAAGAACUUAACGGAGUCGCCCAAGGUCACACAGCUGGCUCGUGGUAAUUGGGGACCAUUCUUUGAUUCAUAAUUUUGUGCUUUUGGCCACCCUGAAAAAGUAAGGUCAGAUCGUUGAAAAACGGGCAGAUUUAAGGCUGUUUGGAAGCAAAAGCGACCACUGCGUUCCCCUCAAAUCAAAGAGAUUUGCACCCCCUACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCUGUUGUAUCAAUUUCAUAAACUGCAGGAGUCUCCCGACUGCAGGGUGAAGCAACAAAAUAAAUAUGGGUGUAAAACAUUCAGGAGUGGUAGGGAAUGGCAAACUGUAGAGCCUGUGUAAAGAGAGCAGCCAAUUCUCAGCUCCAGCCUACUUUUCCACAAAAGAAGAUAGGCACACACACUGUGCCCAGAGGUUCCAGUUUCUUAAGAGAACCAAAAACCUGGAACUGUUUUCUAAUGUGGCAUUUCCCUAAUUUUUAAAAUAUAGAUCAAAUAAAUUGUAUCUGCAGGACUCCAGUAUGCACCUUCUAUGAAAGUAGAUGAAUGUGGUUCUAUCCCCACCCCUAUUUCUUUAUUCUUUUUAAUGAGAUAACGGGUAGAAACAUUAGAAAAUGUGCUUAGACAAAAACUUUGAACUUAAAAUCCUUGUUCUUUCUUCCCUGCUAUUUGAAGAGAAGCUAUUUCUGCCAACACUAAAAUAGUGCUCUGGAUUUAGGCAUUUCUGCUACAUAACCCACUAAACUAAAAUUCUUCAUCCAGAGACCUGACGUUUAAAGUAGAUUCCAGCUUAGUGGAAGUGAGAUUAUAUGUCAGAUGAUUGAUGUGGUGUGGCAGUUGGGGAUUUCCAUUUAGAAACAAGCUGACCACUUUCGUUGCUGUGGGGCUUCAUUGUGGAGUCUCAUUCCUAAAUUUGAAUUGUUUUUUAAGCAGAAUAAUGGAAAGAUUAAGUCAUUUCAUGCAAUUCAAAACUGGAGUCAGACAAACAUACAAAGUUUGGGCCUGAUAUAACUUCACCUGAUCACAACAAGCCUGCUAUAAUAAGUUUCAAAGUUAGUUUACGAGGAUCACUUGAGGCCAGGAGUUCAAAACCAGCAUGGUCAACAUAACAAGACCUCAUCUCUUUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUUAAAAAUUAGCCAGGUAUGGUGGUGGUGCACCUGUAAUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCGCUUGAACCAAGGAGUUCAAGGCUGCAGUGCGCUAUGAUGGCACUGGUGCACUCCAGGCUGGGUGUCUCUUAAAAACAAACAAAAGUUUGACCAGUCAAAGUGGCUUGCACCUAUAAUCCCAGCACUUUGGGAAGCCGAGGUGGGUGGAUUGCUUGAACUCAGGAGUUCAAGACCAACCUGGGCAAUAUGGUGAGACCUUCCAUCUCUAUCAAAAAUACAAAAAUUAGCUGGGCUUGGUGGGGUGGCGCAGGCCUGUGGUCCCUGCUACUUGGGAAGCUGAGGUGCGUGGAUCACUGGAGCCAAGGAAGUCGAGGCUGCAGUGAGCCAUGAUAGCAUCAGCUGCACUCCAGCCUGGACAACAGAGGAAGACACUGUCUCUAAGUAAAUAAAUAAGUCAAUUUACAAUUAAUGUGGUAAAGAUUACUUGUAUGUACCAAUGUAACUUGACUUUUGAUAUUGAAAUGUAUAAUUAUAAUAAAUGUAUAAUUAAAUGUGUAAUAAUGUAUAGACCCCCUCUGAAAGACGAGGGUAACACCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-898 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -939.47

Frequency: 0.0000

Diversity: 539.93

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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