Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-POC5-1:1

Sequence Length

754 nt

GC Content

0.3064

UAGAUCAUAAGCUAAAAUAUGAAACGCAAGGGGAGAGAAAACAAAAAUAUAAAAGAUUUAGCUCCUUAAAGAAGUAACAGAAAAUGGCUUCCAACUUCAUGUUGCAAUUAAAUAAUAACUAUUAUUAUAUUAUUGAGACAGAGUCUCGCUCUUCAGGCUGGAGUACAGUGGCAAGAUCUUGGCUGACUGCAGCUUUGACCUCCCAGGUUCAAGUAGUUCUCCUGCCUCAGCCAUCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCAUUGUGCCUGGCCUAACUAAUUAUUUUUUGAGAAGAACUCAUUGAUAGCACAAAAGUACUUGGAGAAACUACUUAAGCUAACUACUAUUAAGCUGUCUUCUUUCACAAAUAUUAAUAAAAGUACUGAUAGAAAUGUAACUAAGAUACAUAAUGUGUUUUAAUACACAUUAAUCUUUUGAAUUACACAUUUUCUCUUGAGGAUUAUAAUAAAAUGAUGGUACAAUUUAUCCUUCUUUAUAGAUUUGUGGAAAGUACCAACAUAAUUGACAAGAAAUGAAAUACUGCCAUUUAAAAGUCCUGUAUUAAAAUAAAACUACUUUGAAUCAUCUUAGACUAAAUAUUUUAAAAACUGAUUCAAGUGCUUAUUCAUAAGAUAAUGGAAUUUUAAAUAAGAAAAGCCAAAUUAAAAAUUAUAUUUUAGGCAAAAACCAUUUUAACACAGAUAAUACUGUGAUAUUUAUUUUCCUGAAGAAAACCACUUAUGCUAGUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-164.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -178.46

Frequency: 0.0000

Diversity: 144.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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