Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-POTEM-21:2

Sequence Length

724 nt

GC Content

0.4378

GCCACGUGAAGGAUGUGUUUGCUUCCCCUUCCACCAUGAUUGUAAGUUUCCUGAGGCCUCCCCAGCCAUGUGGAACUGUGAAUUAAACUUCUUUCCUGGAGUGUGAAAAUGAACUAAUAAACUCUGUGACCUCAGAGACUCCCUCUCAGUGACCCUGUUCUCAAAUGUAUGAAGAUGGGUGCUCAAAGAUCUCUCUCUAAACAUGGAACAGGGCCUGUCUGAAGACAUAAGUGAUUAACUUCUAAUCUAUAACUAAGGUCUGAGUCCUGAAGACCUUCCUCUGGAGGCUGAGUAGUUAAUCUAGAUGGGUCCAGGUGCUGCAGGUAAAAUACCUCUUUUCUGACAAGACUAGGACUCUUACAUAGACUACCAUGAACUAAAAGAAGCACAACAUUGCCAGAGUAACCUGUGAUACUGUCUUCAUGCGAACUUGGUAUCCUGUUUCCAUCCCAGCCUUCUAUAACCCAGUAACAUCUUUUUUGAAACCAGUGGGUGAGAAAGACACCUGGUCAGGAACGCGGACCACAGGACAACUCAGGCUCACCCACGGCAUCAGACUAAAGGCAAACAAGGACUCUGUAUAAAGUACCGGUGGCAUGUGUAUUAGUGGAGAUGCAGCCUGUGCUCUGCAGACAGGGAGUCACACAGACACUUUUCUAUAAUUUCUUAAGUGCUUUGAAUGUUCAAGUAGAAAGUCUAACAUUAAAUUUGAUUGAACAAUUGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-187.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -203.67

Frequency: 0.0000

Diversity: 127.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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