Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-PRIMPOL-7:1
Sequence Length
1321 nt
GC Content
0.5329
GCGCGAGCGGCCCGGCCGGGAGGUGCGGAAGUUCGCCGCAGCAGCUCAUUGGCGGGCAGCGCCGCUUUCAUCAUUUCUCGGAAAAGUCAAUUUCAUUUUCGCUUCCCCAGGUCGCGGCGGCGGGAGCAACAAGCAGCGGCUCGUGAGUCCGCGGCUCGCACCCAGGGGCGCCCGCACGUGCGGCUAGAACGUCCGAGUCGGGGUCCGGGGCGGGGGGCGCAGGCCCGCGGCGGUAGGGGAGGAGAGCGGGCACCCGAGUCUCCAUCCUCAGGGUGGCCUGAAGGUUCCAGGAGGGCGUCCGGCGAAGGCACGGGGCUGCGACCAUCCAGUUAGCAGGGCUGGUGUGACUGUUGAGAGUAAAUGAAAAUUCGUUUUGUGACACCGACCACCUCCAAGGAAUGAAAGGAGCAGUCAGCCGAAACGACAGCAUUACUUGCGUCCUUACCUAAUUGGAACCUUAUCCGUGGCUGAGGGUGCCACCAUUGGAGGGGCCGCCGCCCCCUCUGACACCACCUGGCGCUCCGCUCCAUUUAGGAGCUAGAACGAAAAGGAGGCCCAUCCCCCAGUAAGUCACAGCCCACGCCAAGAUGAGUUCUGGAGCCUGUGCGACCGAAGUUUCUUCACCGCAGGGCGAGGUGGACAAGGGUGUGAGUUACUUUGACUUCAAGACGUCUCAGUGGCGGCUGGUUCUGGAGAGAGGCUUUAUGCUGGAGCACUUCCAGCAAAGUUCGGCUGGGGCCUCCUUAACUCACUGGCUGGUCACCCUUGGCCUCGGUUUUCAACCAAAGCCUAAGGCCUCAGUUUUCAACGCUGUAAAUGGAAAUAAAUGAGAGAAGAAAGUACAGCCCGUGUGACAAGUGCAGCAAGCAAUGCAACUUCCUUGGGACCUACCCUUUGUGGUCCCUUGCUUUAAAAGUAUAGAUUCACAUUUAGUUAGACCUGUUUCUUCCUCGCAUGCAAUUUCACCAGUCUUUUCCCAGACUUCUGUACUCAACAGAGGAAGUUCCUUCCUGGGAGACCAUAGCUGUUUGUAUGUAAAGAGUUGCGAAAAAACAAAAGCAAAACAAAAAACUCCAACACCUCUCUGUCACAGAAGUAUUGAAUUAUAUAGACUGGAAAAAUGGAAGUAUCCAAGAAAACGCGUGUGAAUUUGGAAGAUGCAAGAAUGGUGAGAGAAGAACAUAAGCCACCUGACAUCUCACUAGUCAGGAAUAGACCUGUGGAUAUUUUUAUGUAUUUCCUUCUAGUGAUCUUUCUAAGGGACCGUUUCCAAUCCGCAUCUCCUCUGUCUGUGUGUAGGAUUUAAGAAUGCUGACUGUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-462.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -488.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 434.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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