Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-RAB40B-1:8

Sequence Length

896 nt

GC Content

0.5078

GGUGCACGUGCAACGGAGACACCGCCCCUAAACCUGGGGCCCUGAGGCUAACAGCUAACAGUGGCCCUGCCGUUACGGCCAGUGUCAGGUGCCAGCUGGGCUGGACCAGGAAUUCCCAGAAACCUGGCAAGGCAUGAUUUGGGGUGGGUCGUGCUGAGGGCCACACCAUCCGCUUCCCCGCUUCUGAGGCCUUCCGACCUGGGCUGAGCCCGGCUACCCGAGUCCCGGGGUCUCCGGCUCACAGACUUCUCGGCCUCCGUAAUUGCAAACGCCAGCUCCCCCAGUCCAUCUCCUGUCCUGGAUCUACGUCUAUAUCCUACUGGAUCCGUCUCUCUGGAGAACCCUAAUACAGCUGUCAACACAAGGAUGAACUAACUACAAGAAGGCCUGAAUAGGAACUCUCCCAGGGGACGAAGAGGUUUCAGCCUUCAGCAAAGGAUGGUUCAUAGAAACCGUUCGCAUAGUCGGCCCUCCACGGACUGCAACCCUAGUUAAUAUUACCUACAGUAAACAAAAAAUUCAAGUAUAGAUUUUAGUCUAAAGCAAAUAGGAAAUGUCGCUUCCCUGGACGUUGGGAGAAGCAAACACGAAUCCUCUCCUGAGGCCGGAAGCGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCGGGCGGAUCAUUUUAUAACUAUCUAUUAAAUGUUUAAGUUUUCAGUCCAUUUUUCCUGUCUACAUGGAAUUGCCGACUGCACAAAGAACACAUGAGGGCUCUCUCAAGGCCAUCAUUUCCGCGGAGUCCCAUUUCCUGACUCAAAUGACAAGCUCUCAACUUUCUACUCAAGAUCAUUGAAACAUCUGUGUUGAUUAUUUGUAACCGGGAUAUGCUUUAUUUAUUAGAUAAGAGACUAACC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-271.4 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -290.66

Frequency: 0.0000

Diversity: 238.23

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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