Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-RICTOR-54:1
Sequence Length
1298 nt
GC Content
0.4345
UUGACUUGACUUAUCCCAAAGCACAAACCUAAGACCCCAUUGCAGGUCCACGAUAUGUGCCAGUGAAUUCCACUUCUGCUAGUCAAUUCCCCAUGUUCUGAUGCCUCGCAUCCAAAGCAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGAGAAGGAGAGAGGAGAGAGAGAGACAGAGAGACGGAGAGAGACAGAGAGACAGAGAGAGAGACAGAGAGGAGAGAGUGCCCAUGCCUAGCACAGUGCCUGGCACACAGUAGUUGCUCAAUCCGCAUUUAUUACUGUAUUUCUCUGCAGAGAAGCUUCCUACAUUCCUCUAUGGGCAUGCCAGAAGGCAGUCCCCCACCGUAUCCAAAUUUCUGUCUUUGAAGUUCAGGAUGAUGUCAAAUGUCCACCCCCAGUCCCAGUUGGUCACCUCUGGCCAGGGGAUGUAGUUUUCUAGCAGACAGCUUGUGGGAAAUGGUUUGUGGCAAUCCCCAAAUAGAGCUGUCUUUUGAUUAAUAGCAAACUAGAAGGAACUCCACCUGUUCCCAUGGCAUGAAACUUUCUUGCAGCUUUGCAGAUGCGUUAUCGAACAAUCUUUCUUCGGACAUCUCCAGGGACAAUGAGAGCACUGUUUCUCAAGAUCUUCUUGCUCCAUUUUUUAAAACACAUCUAAUUAUUAGGAAAUCCAUACAUGCAUCUGUCUGAAUUUUACCUUCAUUAGUCCAAACUCUGCCUUUCAGAGCCAUAAAGAGUAAGUUUCUCCCAUAUGACGACUCAAAAAAGUGAUUUGAAGAACAUGAUUAUGUUGCUUUGAAGUCUUUUCCUUGAGGUCAUCAAUAAAUGCUGUCCAUGAAUUCAUUAUAUUUAGGAUUGCCUCUUUCUGAUUUCUUUAAAAUGAUAGAAUCAGUAACUCAGUGGUGGAUGGAAGAUGGGCCUUGGAGACGUUAUACUGCAUGAUCUUUGUUCCCAUCCAAAUGAAAGACUUUAUGGGGGUGCUCAUGGUUUUAUUCAGCUUUCCUUUACAGACAGUGGGUGUUGGUCAGUGGUGACAUCUGUUUUGAGGAAUACAUGUUACCUGCUGGAAAUAAAUGGCUAAAGGAACUAAAACUUACCAACUGGUUCCUCUGGAGCAAGGAAGAUCUAAUUGGUAACCUCUGGCUAUUCUCGAGCCUAAUGGUAUAUUUAUUAACUCUAUCAGCCCCUUUAUAUCUUCUUGCUAUGGUUUGGCUGCUUCUCCACCCAAAUCACAUCUUGAAUUGUAGCUCCCAUAAUUCCCACAUGUUGUGGGAGGGACCUGGUGGGAGAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-362.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -389.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 318.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((..(((........)))..))............(((((..(((((((.....((..((.((((.....))))...))..))((((((...((((...(((((...)))))...(((((((.(((...((((.(...((.((((..(((...(((((.((...(((((.....(((((((((.....((((((((((...(((((((((((..((.((..(((((((.(((.((...((((..(((...)))..)))).(((((((((((.......)))...))))))))..(((((....)))))))...)).).)))))))..((((.((((....))))))))......)).))....)))))))))))...((((..(((((((.((..(((.........(((((..(((((((....)))))))))))).((((((.(((..(((((((((..((((..((........)).))))......))))))))).........))).))))))...(((((.......)))))....(((.(((...))).)))......)))..)))))))))))))..)))))))))).....(((((.......)).)))..))))))))).((((((((((((((((((((((((..............)))))))))(((.((((.((.(((((((.....(((((((((.((((....(((((.....)))))((((...((((.............(((((..((((((((((...((((((((((((....))))).)))))))..)))))..))))))))))........((.((((.(((((.......))))))))).))......(((((((..(((...)))..)))))))..)))).))))(((((((((.(.(((.(.((.((........)).)).).))).).)).))))))).......))))..))))))))).....((((......))))........))))))))).)))))))(((((((((((((.(((((....))))).)))))))).)))))..............((((((((............))))))))..))))))).)))))))).........)))))..)).)))))...)))..(((((....))))).)))).))...).))))...))))))))))..(((((((.((......)).)))))))))))...))))))...((((((((((........))))))))))))))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{..{((........,,},}}}............(((((..(((((((..,...,||{,.((((.....))))...}}..}}|{{(((.,,{(({,..(((((...)))))...{{{{||{|{|{.,,{({(.(.{,{{,{{{(,{(((.,,{((((,{((.,(((((,,,,.(((((((((,{...((((((((((...(((((((((((..({.{{..(((((((.(.((((,.,,(((,.,,..,},)).,))))}(((((((((((.......)))...)))))))).,(((((....)))))}....,,.}.)))))))..(((,.((((....)))),,))}.....},.))....)))))))))))...((((.,((((((({{,.,((,{{,.,,,,.{{{((..,{((((,....)))))}))))}},,,{{{({((({.(((((((((.,(((,..((.{....,.)).)})))}....))))))))),{{{.....,,,}))))))}},(((((.......)))))..,}}}}}{|.....}}|||||....}))},.,)))))}))})))..))))))))))....|||||{.......|},}},,.))))))))).((((((((((((((((,{{{{,,........{{,....})))}},,.(((.((((.((.(((((((.....,{{{{{{{{.(({{....(((((.....)))))((((...((({,.....||{,,,{{(((,{{(((((.,(((.{{((((((((((((....))))).))))}))}}),)))..)))))))),)},......((.((((.(((((.......))))))))).))....,.(((((((,,{{,...,}).,)))))))..,.||{,,,,(((((((((.(.(((.(.((.((........)).)).).))).).))})))))))..}}}..}}}}..)))))))))|},,}|||,......,}}.........))))))))).))))))){((((((((((((.(((((....))))).)))))))).))))}..............((((((((............)))))))).})))))))))))))))).....,...})))),.)).}))))..,))}..,|||.....}}}},.)))).))..,},))))...)))))))))).,(((((((.((......)).)))))))}||,...},,,)),..((((((((((........))))))))))))))))))))))....
Back