Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-RICTOR-54:2
Sequence Length
837 nt
GC Content
0.4731
CCGGACUUUGCGGGCGGGCGGGCACUGGUGAGAAGAGGAAGUGGGAGAGGCCUGGGAAGGAAACUUGGAAACCGAAAACUCGGCGGCCGAGGCUCCGUGCCCCGCGCGCAGCGCUGCUCCUGCCCCGGCCAAGGACGCACGGGCCAGCCGGCGGAACCAGAGGGGGGAAUUUGGACACAGACACCCAGAAAGAACACUGUGUGACCACUGAGACAGAUCCUGCUUAUGCUGACUCAAGCCAAGGAAUGGCAAGGUUGCUGACCACCACCAGAAGCUAGGAGAGAGGAACGGAACAGGCUCCCUUUGAACCCCUAAGAAGAAGCUAGCCCUGCCAACAUCUUCAUUUCAGACUUCUGGCCUCCAGAUUGAGAAUACAUUUCUGUUGUUUUAAGCCACCAAGUUUGUGGUAAUGUGUUAUGGCAGCCUUAGGAAACUGAUACAUAGGUUAUGUUCCAUAAGUUAGUUUUAAACAAUUAUCCUGAAAAUAACUAAUAGGAAAAAGAUGAAAAAUACCAAUGGCUUAUUAAGCUAAGAGCUAAAAUAUCCAUCCUUGCUUAGUUUUGAUAAGAUUGUGUGGCCAAGGCACAUAUUAUUCUGCUUCGUUAAACACUCUUUUUAUUUUUUUAUUUGUGUGUGUGUUUUUAUUUUUAAUUUAUUUAUUUAUUUAUUUAUUUAGAGACGGAGUCUUGCUCUGUCACACAGGCUGGAGUGCAGUGGCACGAUCUCAGCUCACUGCAUGCUCCGCCUCCUGGGUUCACACCAUUCUGCCUCAGCCUCCCGAGGAGCUGGAACUACAGGCGCCGGCUACCACGCCCAGCUAAUUUUUUUGUAUUUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-251.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -267.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 238.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((.((((.(((((((((.(((((..................((((.(((.((((..(((((...((((....))))...)))))(((.(((((...))))).))).....)))).))).)))).....(((.(((.....))))))(((((..(((.((((((..(((((((.((((...(((((((....((((....((.(((.((((.....(((((...((((.((((.(((((.(((.(((((((((........(((((((((.((((.(((((..((....((((..((((.............))))..))))...))....))))).)))))).))))))).(((......)))((((((((.............(((((.......)))))))))))))..)))))))))..(((((((((..((.((.......))))..))))))))).........(((((...........)))))...................((((((..........))))))......))))))))))))))))...)))))..((((((.(...).))))))....))))))).))...))))........)))))))....)))).)))))))..))))))......((((..((......))..))))((((((((...))))))))....((((.(((((((((((((.........)).))))))..)))))))))))).))))).)))))...)))))..)))))))).)))))))).......(((...(((......)))..)))..................
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((,.((((.(((((((((.(((((.{,,.{((,.(((({,{.(((({(((..(((..(((((...((((....))))...))))),,|}|{{{(,,,}|}},.})}}}|.,}))}|}||{|||,..,,.({{.{{|,.,.,)))))),..{{..,||}|{((((..(((((((.((((..,((((((,....((((....{(.(((.((((.....(((((...((((.((({{((((,,(((.((((((((({{,((,.,((({(((((.((((,(((((..((..((((((..((((.............))))..)))),)),,....))))).}))}}}.}}|||||...|}}}},||||{..,{,.,,,))},.}}}}..{{{{|,.,,,,,}))))..,)})}}..))))))))).{(((((((((..,{.{|,,,..,,))||..}|||}||||.........{((({...........)))))......,,...........{(((((.,.,|||}}.}}))},......))))))))))))))))...)))))..{(((((,(...,}))))))....))))))).))...))))....,,,.})))))}....)))).)))))))..)))},,......,,{{..,,......}}..)))}((((((((...))))))))....{(((.(((((((((((((.........)).)))))),.}))))))))))).}}))).)))))...))))),.)))))))).})))))))...,.,,(((...(({..,,.,)))..))}........,,,.......
Back