Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

lnc-RICTOR-54:5

Sequence Length

583 nt

GC Content

0.4751

AACUUGGAAACCGAAAACUCGGCGGCCGAGGCUCCGUGCCCCGCGCGCAGCGCUGCUCCUGCCCCGGCCAAGGACGCACGGGCCAGCCGGCGGAACCAGAGGUUUUCAGUGAUGUUGAGAGUCAACAGGAAAUUAAUCAGCAAGUAGAAAAUUGAAAGAAGAUCUGCAUCUUACUGCAGGAGUCAUUAAAAUAAAAGCAGAUUUGGCAAAAUGGCAAGAACCAGAGGAUGAGGAUGUAAAACAAAAACUUUUGGAGUCAUUUUGCCACCAGGAUGAAAAUAGGAUGAAGCUGACAUGACAAAGGUGCAGGUGACAGCUUCUACCUUAUGAUCUGCGUUCCAGUCAGCGGGAAGGAGAUGGGGUGGGAAUGUGAUAAACCACUUCCCUUGAAGGACAUUUUCCAGAAGGUGAAUGCCACUUCUGUUUAUAUCCCAUUGGCCAGCACUUAGAUUUAUUUCCAAGAAGAAAAAAGGAGAACAGAUAUCAUGUUGACCAGCAGUCUCUGCCACAGACAGCUAAUCUCCACCUUCCACUAAGGCUGAGAAAUUACCAGCAUGGGAGGAAAAGGUGGUGCAGUUCAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-173.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -186.11

Frequency: 0.0000

Diversity: 144.21

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((...((((....))))...)))))(((.(((((...))))).)))((((...((((.((......)).(((.(((.....))))))(((((...))))).......((((((...))))))((((((.((((...((((..................(((((......)))))(((((...............)))))(((((((((((.....(((((((....................))))))).))))))))))).((((((((.((((((((.(((((((.(((.............))).))))))).(((((...((((.(.((((........)))).))))))))))(((((.(((......)))))))).....((.(((((.((....)).)))))))..)))))))).)))))...))).....)))).)))).))))))............((..((((.......))))..))(((.((((.......)))).))).....(((((((((.(((..((((.(......))))).)))..)))..)))))).))))..)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,{{((((((((......{((.((((...(((.((((((...({({,.,))|}.{,{{{{||.,.,}}..,)),.))))))))).)))).))}.......))))))))}|..((((((,.,||||||((((((.{(((..,{(,,......}},......{{((((((......})))),.,}}............{{{||||((((((((((((.....(((((((.,...,........).....))))))).)))))))))))),,,,,,{{.,,{{(((,.(((((((.(((,.(,....},,,.))).))))))).,||||,,,}|||}|.(({{.,,,.,.,))}}||}||||||||(((((.(((......)))))))).....((.(((((.((....)).))))))).,)))})}}}.,))))}.})}},,.,,},,,.)))}.})))))............{{..{{{{.......)))),.)){((.((((.......)))).))}...,.(((((((((.(({..((((.{......})))).}}),.)))..)))))).}..,}))))),