Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-RICTOR-54:7
Sequence Length
577 nt
GC Content
0.4766
GAAACCGAAAACUCGGCGGCCGAGGCUCCGUGCCCCGCGCGCAGCGCUGCUCCUGCCCCGGCCAAGGACGCACGGGCCAGCCGGCGGAACCAGAGGUUUUCAGUGAUGUUGAGAGUCAACAGGAAAUUAAUCAGCAAGUAGAAAAUUGAAAGAAGAUCUGCAUCUUACUGCAGGAGUCAUUAAAAUAAAAGCAGAUUUGGCAAAAUGGCAAGAACCAGAGGAUGAGGAUGUAAAACAAAAACUUUUGGAGUCAUUUUGCCACCAGGAUGAAAAUAGGAUGAAGCUGACAUGACAAAGGUGCAGGUGACAGCUUCUACCUUAUGAUCUGCGUUCCAGUCAGCGGGAAGGAGAUGGGGUGGGAAUGUGAUAAACCACUUCCCUUGAAGGACAUUUUCCAGAAGGUGAAUGCCACUUCUGUUUAUAUCCCAUUGGCCAGCACUUAGAUUUAUUUCCAAGAAGAAAAAAGGAGAACAGAUAUCAUGUUGACCAGCAGUCUCUGCCACAGACAGCUAAUCUCCACCUUCCACUAAGGCUGAGAAAUUACCAGCAUGGGAGGAAAAGGUGGUGCAGUUCAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-169.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -182.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 156.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((....)))).(((((.(((.....((...((((...)))).))....))).)))))..((((((((..(((....)))((((((...))))))......((((((...))))))((((((.((((...((((..................(((((......)))))(((((...............)))))(((((((((((.....(((((((....................))))))).))))))))))).((((((((.((((((((.(((((((.(((.............))).))))))).(((((...((((.(.((((........)))).))))))))))(((((.(((......)))))))).....((.(((((.((....)).)))))))..)))))))).)))))...))).....)))).)))).))))))............((..((((.......))))..))(((.((((.......)))).)))......((((((((.(((..((((.(......))))).)))..)))..))))))))).))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,,(({{....||||{(((,{.(((.{(((((...((({,..))}}.|,{{{{||,,,,}}...}},.})})))))).}}))|)}|,,{,...))))}||.{{,.((((((...})}})}((((((.{(((..,{(,,......}},......{{((((({......})))),.,}}............{{{||||((((((((((((.....(((((((.,...,........).....))))))).)))))))))))),,,,,,{{.,,{{(((,.(((((((.(((,.(,....},,,.))).))))))).,||||,,,}|||}|.{({{.,,,.,.,))}}||}||||||||(((((.(((......)))))))).....((.(((((.((....)).))))))).,)))))}}}.,})))}.})}},,.,,},,,.)))}.})))))............((..{{{{.......)))),.)){((,({|{},},,..,}},.|||...{.(((((((((.(({..((((.{......})))).}}),.)))..)))))).}..}}),})).
Back