Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
lnc-RNF26-6:1
Sequence Length
559 nt
GC Content
0.5921
ACAGGGCAGAGAUGGAUAGGGAAGGGAGUGUGAUGUGACGAGGCCGCAGAGAGCUCAGCCCCCAGGAUGGACGGGAAACCCUGGGUCACCGUUCUUGGAGGGGGACAUCAGUGCCUGGCACAUAGUAGAUGCCCAAAGAACAUCUGCUGACUGACCUCACCUAAAGCAUUUGGGCAGUUACCCACAGGUGCUCCAUGACACCUUCUGGCCAGCAGAAAGGACCUGCAGCCAAGUGCUCUGGUGGCUGCUACUGAACACCAACCGCUACUCUCAGCCUUGGGGGUGACAGGAAAGAAUGGGACCGCAGUGAUUGAAACUUAUUUGGGGCAGGAAGCUUGGCCUGGAUGACCUGAGGGGCAGUCAUGUCCUCUGGCCCACCCAGUCUUCACUUCUCACCUCCUCACCCCCCGCCCUCUGGAGGGCAGCUCCUAUCUCUCCUGGGUUAGCCUCAGAGUUCGGCGAGGGGAGGCACUGUUUGGGGCUACAGUCCUGGGCCCGGCGUUGCUUGCCAGUGAGAUGUCUGAUGCCAGGGGGGUGCCAAGGAGCAGCAAGCCUGGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-211 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -223.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 192.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((......((...(((..(((((.((((.((((.((((((..((((.((...(((((((((......((....))(((((((.((((((((((((((...(((.((((((((.......((((.((((((((.......((((................)))))))))))).))))...))))))))..)))...))))))((((........)).)).(((((((((....))..)))))))..(((..((((..(.(((......)))...)..)))).)))..)))))))))))).)))..........(((((((((.((((...)))).))))))))))))).)))))......)).)))))))).......)).))))...)))))))))..))).))(((((....))))).((((((..(((((((((((((((((((......((((((..((.((...(((((((((....)))))))))...)).)).))))))..))))..).))))).))))))))).....)))))).))...))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,.,,((..(((((..((((..(((.{({,,.(((((.(.((({{((.{{,,,.{{..(((((((({.,{((((,..,{|,,,}}},.)))))))))).))),)}..)).)))))).)))))}((((((((.........)))))))).)))..)))..))))...))))},,|}.....{({.{(((((((((.((.(((((((((({.,.((({..,,..,}||{{{{{{{,,,.,|,,||}}}}}...,,..,,}},...{|{..,,,,})},},|(((((((.((,.((((.((((....,,{,........,{((((((((.((((...)))).))))))))}{{.{{((({((....))))))),)),...)))).))))..))..)))))))),,.{((({(((((((({,,{({{{((,((..........))))}.}))))))))...)))).)))){{({{.{({{{((({({,..,,,,)))}))}|}}|.}}}})}}).})),}...}))).,)))))))))))).)).))))),....}))))))}
Back